Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09317
• Subject: XM_011510415.2
• Aligned Length: 1088
• Identities: 840
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  ATGTGGGTGCTTACACCTGCTGCTTTTGCTGGGAAGCTCTTGAGTGTGTTCAGGCAACCTCTGAGCTCTCTGTG  74
            |||||.|.| .||.||...|.||    |||.||.||              |||.|         |||     ||
Sbjct    1  ATGTGCGCG-ATAAACGGCCGGC----GCTCGGGAG--------------CAGAC---------GCT-----TG  41

Query   75  G---AGGAGCCTGGTCCCGCTGTTCTGCTGGCTGAGGGCAACCTTCTGGCTGCGAGCTACCAAGAGGAGAAAGC  145
            |   .||.|||    ||.|.||..|.|||  |.|.||||          |||||.|.|.||            |
Sbjct   42  GCCCCGGGGCC----CCAGGTGCGCGGCT--CCGCGGGC----------CTGCGCGGTCCC------------C  87

Query  146  AGCAGCTGG-TCCTGAGAGGGCCAGATGAGACCAAAGAGGAGGAA-GAGGACCCTCCTCTGCCCACCACCCCAA  217
            ||..||.|| |||.|   ||||    |||.|||         ||| ||||.|||.|    |||..|..||||||
Sbjct   88  AGGCGCCGGCTCCCG---GGGC----TGACACC---------GAATGAGGCCCCGC----GCCGTCGGCCCCAA  141

Query  218  CCAGCGTCAACTATCACTTCACTCGCCAGTGCAACTACAAATGCGGCTTCTGTTTCCACACAGCCAAAACATCC  291
                                                                                      
Sbjct  142  --------------------------------------------------------------------------  141

Query  292  TTTGTGCTGCCCCTTGAGGAAGCAAAGAGAGGATTGCTTTTGCTTAAGGAAGCTGGTATGGAGAAGATCAACTT  365
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  142  ------------------------------------------------------GGTATGGAGAAGATCAACTT  161

Query  366  TTCAGGTGGAGAGCCATTTCTTCAAGACCGGGGAGAATACCTGGGCAAGTTGGTGAGGTTCTGCAAAGTAGAGT  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  162  TTCAGGTGGAGAGCCATTTCTTCAAGACCGGGGAGAATACCTGGGCAAGTTGGTGAGGTTCTGCAAAGTAGAGT  235

Query  440  TGCGGCTGCCCAGCGTGAGCATCGTGAGCAATGGAAGCCTGATCCGGGAGAGGTGGTTCCAGAATTATGGTGAG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  236  TGCGGCTGCCCAGCGTGAGCATCGTGAGCAATGGAAGCCTGATCCGGGAGAGGTGGTTCCAGAATTATGGTGAG  309

Query  514  TATTTGGACATTCTCGCTATCTCCTGTGACAGCTTTGACGAGGAAGTCAATGTCCTTATTGGCCGTGGCCAAGG  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  310  TATTTGGACATTCTCGCTATCTCCTGTGACAGCTTTGACGAGGAAGTCAATGTCCTTATTGGCCGTGGCCAAGG  383

Query  588  AAAGAAGAACCATGTGGAAAACCTTCAAAAGCTGAGGAGGTGGTGTAGGGATTATAGAGTCGCTTTCAAGATAA  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  AAAGAAGAACCATGTGGAAAACCTTCAAAAGCTGAGGAGGTGGTGTAGGGATTATAGAGTCGCTTTCAAGATAA  457

Query  662  ATTCTGTCATTAATCGTTTCAACGTGGAAGAGGACATGACGGAACAGATCAAAGCACTAAACCCTGTCCGCTGG  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  ATTCTGTCATTAATCGTTTCAACGTGGAAGAGGACATGACGGAACAGATCAAAGCACTAAACCCTGTCCGCTGG  531

Query  736  AAAGTGTTCCAGTGCCTCTTAATTGAGGGTGAGAATTGTGGAGAAGATGCTCTAAGAGAAGCAGAAAGATTTGT  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  AAAGTGTTCCAGTGCCTCTTAATTGAGGGTGAGAATTGTGGAGAAGATGCTCTAAGAGAAGCAGAAAGATTTGT  605

Query  810  TATTGGTGATGAAGAATTTGAAAGATTCTTGGAGCGCCACAAAGAAGTGTCCTGCTTGGTGCCTGAATCTAACC  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  TATTGGTGATGAAGAATTTGAAAGATTCTTGGAGCGCCACAAAGAAGTGTCCTGCTTGGTGCCTGAATCTAACC  679

Query  884  AGAAGATGAAAGACTCCTACCTTATTCTGGATGAATATATGCGCTTTCTGAACTGTAGAAAGGGACGGAAGGAC  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  AGAAGATGAAAGACTCCTACCTTATTCTGGATGAATATATGCGCTTTCTGAACTGTAGAAAGGGACGGAAGGAC  753

Query  958  CCTTCCAAGTCCATCCTGGATGTTGGTGTAGAAGAAGCTATAAAATTCAGTGGATTTGATGAAAAGATGTTTCT  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  CCTTCCAAGTCCATCCTGGATGTTGGTGTAGAAGAAGCTATAAAATTCAGTGGATTTGATGAAAAGATGTTTCT  827

Query 1032  GAAGCGAGGAGGAAAATACATATGGAGTAAGGCTGATCTGAAGCTGGATTGG  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  GAAGCGAGGAGGAAAATACATATGGAGTAAGGCTGATCTGAAGCTGGATTGG  879