Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09332
• Subject: XM_006520091.4
• Aligned Length: 2086
• Identities: 1861
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTCATCGATATGG  74
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGAGTGGTGCGGCTTTAGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTGTTCCTCCTGCATCGCTATGG  74

Query   75  AGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTTATTGTCT  148
            ||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  AGACTTTAAGAAACAGCACAGACTGGTAATCATCGGCACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTCATTGTCT  148

Query  149  TCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTCAAGCCCTCCT  222
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TCATACTGCCGCTGGATGTCAGTACGACAATATATAACCGATGCAGGCATGCTGCTGCAAATTCCAGCCCTCCT  222

Query  223  GAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAAC-CCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTTTCAAGCCAT  295
            ||.||||.||||.||||.|||.||.|.|||.||| |.|| ||.|.||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  223  GAAAATACCAACGTTACGGGACTGGATGCATCTG-TCACTCCAGCTCCAAGACAGCATCCATGTTTCAAGCCGT  295

Query  296  GGAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTTTTAACATGG  369
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  296  GGAGTTACATTCCAGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTTTATTGGACATCACAGTTTTTGACGTGG  369

Query  370  ATTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAAAACTGCACT  443
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  370  ATCCTGTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCTGGAGGTTTCTCCATCACCGGCAAGATCAAAACAGCCCT  443

Query  444  AATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAGCTGTAAACC  517
            .|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||
Sbjct  444  GATTGAGAATGCCATCTATTACGGCACTTACTTGCTGATATTTGGAGCATTTCTGATTTACGTAGCTGTAAACC  517

Query  518  CACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGTCTGTTTCTT  591
            |||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  518  CACGTTTGCATTTAGAATGGAACCAACTTCAGACGATTGGGATAGCTGCTGCCAACACATGGGGTCTGTTTCTC  591

Query  592  CTTGTGTTGTTGTTGGGGTATGGCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAGGGGTTATCT  665
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  592  CTTGTGTTATTATTGGGGTATGGATTGGTGGAAATTCCTCGGTCATACTGGAATGGAGCCAAAAGGGGTTATCT  665

Query  666  ACTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAAGATG  739
            .||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  666  TCTTATGAAGACTTACTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAGGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAGGATG  739

Query  740  CCATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTGTTGATACAATA  813
            ..||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||.||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  740  TAATGGAGGAGGTTCGTAAAGTAAATGAGAGCATCAAGTACAACCACCCACTGAGGAAGTGTGTAGACACAATA  813

Query  814  CTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGATTTTGATGAAAA  887
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  814  CTTAAAAAGTGCCCTACAGATTATCAGGAAAAGATGGGTAGGAATATGGATGACTATGAAGATTTTGACGAAAA  887

Query  888  GCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTTCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAGAGACACC  961
            ||..|.||.|||.|||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  888  GCGCAATACCTACCCAAGTGAAAAAAGTTTGGTAAAATTGCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAAAGGCACC  961

Query  962  GTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACT  1035
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GTCGGACTCAAGTGCAATGGCAGATTCTTTTGGAACAGGCATTCTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACT  1035

Query 1036  AGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAA  1109
            ||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AGCGCAACTCACCAGTTTGTTCACACCTTTCAGTCACCTGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAA  1109

Query 1110  TCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGTGGTTCTGTCCA  1183
            ||||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||.||..||||||||||||.||||.|
Sbjct 1110  TCCTACTGTTGAGTGGTACTGGGAATGCCTTTTGCGTCCATGGTTTCACAGGACCCTTGCTGTGGTTTTGTCTA  1183

Query 1184  TCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCCTCTTTGCGGTC  1257
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1184  TCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGTACCTTCTTTAGCACAACTCCTGTCTTATCCCTTTTTGCAGTA  1257

Query 1258  TTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCCT  1331
            |||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1258  TTCATACAGCTGGCAGAAAGAACATACAATTACATTTATATTGAGATTGCTTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCTT  1331

Query 1332  AAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTCACATCACCAGA  1405
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||..||||||||||.||.||||
Sbjct 1332  AAGCATCTGTGTTTACTCTACTGTGTTCAGGATCCGCGTGTTTAACTACTACTACCTGGCCTCACACCATCAGA  1405

Query 1406  CTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTCTTAATTTCTTG  1479
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1406  CCGATGCTTATAGCCTTCTGTTCAGTGGCATGTTATTTTGCCGTTTGACTCCTCCTTTATGTCTTAACTTCTTG  1479

Query 1480  GGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCTATTATGGGTTC  1553
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1480  GGATTGACCCATATGGATTCATCCATCTCCCACCAGAATACCCAGCCAACTGCATATACATCTATCATGGGTTC  1553

Query 1554  CATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAATTCTCTGCATTG  1627
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1554  CATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTAGTAATTCTCTGCATCG  1627

Query 1628  CTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAGATGATGATATG  1701
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 1628  CTACGTATTTTAGTTTGGGCACCCGTTGTTTGAATCTGCTTGGTTTCCAGCAGTTCATGGGAGATAATGATATG  1701

Query 1702  ACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGGCAAGAAGAAGG  1775
            ||||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1702  ACATCAGATCTAGTTGATGAAGGAAAAGAATTAATCAGACGAGAGAAAAGAAAAAGGCAAAGACAAGAGGAAGG  1775

Query 1776  TGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAACAGAAATATTC  1849
            |||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||..|.|
Sbjct 1776  TGAAAATAGAAGAAGAGAGTGGAAAGAACGTTATGGACACAACAGAGAGGATTCCACTCGGAACAGAAACGTCC  1849

Query 1850  ATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATACCAGGGCTAAT  1923
            ||.|||||||||||||||||||.||||||||....|.|||||||.|.|   |||.||||||.||||||||||||
Sbjct 1850  ATCCTGACCCCAAAGAGTCAAATTTCTCAGACACGACTACCAACTGGT---CATCCAAATACACCAGGGCTAAT  1920

Query 1924  AACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCAGAAACATTCAC  1997
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1921  AACAGGACTGAAAGAGACCGAATAGAACTTCTCCAGGATGCTGAGCCTCTGGATTTTAATGCAGAAACGTTTAC  1994

Query 1998  TGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTCTCGCAGTGACA  2071
            .|||||..||||.|||.||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||..||||...|
Sbjct 1995  GGATGAATCTCTGGAACCTGAGTCAGGAAGGTATCAACCTGGTGGGCGATATCTCTCCATGTCTTCCAGTATAA  2068

Query 2072  TATTTAATGATGTT  2085
            |||||.|.|||.|.
Sbjct 2069  TATTTGAAGATATC  2082