Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09332
- Subject:
- XM_006520092.4
- Aligned Length:
- 2085
- Identities:
- 1520
- Gaps:
- 387
Alignment
Query 1 ATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTCATCGATATGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTTATTGTCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTCAAGCCCTCCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAACCCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTTTCAAGCCATG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTTTTAACATGGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAAAACTGCACTA 444
||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1 --------------ATGCAGTCATATGCAAGATCTGGAGGTTTCTCCATCACCGGCAAGATCAAAACAGCCCTG 60
Query 445 ATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAGCTGTAAACCC 518
|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||
Sbjct 61 ATTGAGAATGCCATCTATTACGGCACTTACTTGCTGATATTTGGAGCATTTCTGATTTACGTAGCTGTAAACCC 134
Query 519 ACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGTCTGTTTCTTC 592
||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 135 ACGTTTGCATTTAGAATGGAACCAACTTCAGACGATTGGGATAGCTGCTGCCAACACATGGGGTCTGTTTCTCC 208
Query 593 TTGTGTTGTTGTTGGGGTATGGCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAGGGGTTATCTA 666
|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 209 TTGTGTTATTATTGGGGTATGGATTGGTGGAAATTCCTCGGTCATACTGGAATGGAGCCAAAAGGGGTTATCTT 282
Query 667 CTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAAGATGC 740
||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 283 CTTATGAAGACTTACTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAGGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAGGATGT 356
Query 741 CATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTGTTGATACAATAC 814
.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||.||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 357 AATGGAGGAGGTTCGTAAAGTAAATGAGAGCATCAAGTACAACCACCCACTGAGGAAGTGTGTAGACACAATAC 430
Query 815 TTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGATTTTGATGAAAAG 888
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 431 TTAAAAAGTGCCCTACAGATTATCAGGAAAAGATGGGTAGGAATATGGATGACTATGAAGATTTTGACGAAAAG 504
Query 889 CATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTTCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAGAGACACCG 962
|..|.||.|||.|||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 505 CGCAATACCTACCCAAGTGAAAAAAGTTTGGTAAAATTGCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAAAGGCACCG 578
Query 963 TCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACTA 1036
|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579 TCGGACTCAAGTGCAATGGCAGATTCTTTTGGAACAGGCATTCTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACTA 652
Query 1037 GTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAAT 1110
|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 GCGCAACTCACCAGTTTGTTCACACCTTTCAGTCACCTGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAAT 726
Query 1111 CCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGTGGTTCTGTCCAT 1184
|||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||.||..||||||||||||.||||.||
Sbjct 727 CCTACTGTTGAGTGGTACTGGGAATGCCTTTTGCGTCCATGGTTTCACAGGACCCTTGCTGTGGTTTTGTCTAT 800
Query 1185 CTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCCTCTTTGCGGTCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 801 CTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGTACCTTCTTTAGCACAACTCCTGTCTTATCCCTTTTTGCAGTAT 874
Query 1259 TCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCCTA 1332
||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct 875 TCATACAGCTGGCAGAAAGAACATACAATTACATTTATATTGAGATTGCTTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCTTA 948
Query 1333 AGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTCACATCACCAGAC 1406
||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||
Sbjct 949 AGCATCTGTGTTTACTCTACTGTGTTCAGGATCCGCGTGTTTAACTACTACTACCTGGCCTCACACCATCAGAC 1022
Query 1407 TGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTCTTAATTTCTTGG 1480
.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1023 CGATGCTTATAGCCTTCTGTTCAGTGGCATGTTATTTTGCCGTTTGACTCCTCCTTTATGTCTTAACTTCTTGG 1096
Query 1481 GTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCTATTATGGGTTCC 1554
|.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1097 GATTGACCCATATGGATTCATCCATCTCCCACCAGAATACCCAGCCAACTGCATATACATCTATCATGGGTTCC 1170
Query 1555 ATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAATTCTCTGCATTGC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1171 ATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTAGTAATTCTCTGCATCGC 1244
Query 1629 TACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAGATGATGATATGA 1702
|||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 1245 TACGTATTTTAGTTTGGGCACCCGTTGTTTGAATCTGCTTGGTTTCCAGCAGTTCATGGGAGATAATGATATGA 1318
Query 1703 CATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGGCAAGAAGAAGGT 1776
|||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1319 CATCAGATCTAGTTGATGAAGGAAAAGAATTAATCAGACGAGAGAAAAGAAAAAGGCAAAGACAAGAGGAAGGT 1392
Query 1777 GAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAACAGAAATATTCA 1850
||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||..|.||
Sbjct 1393 GAAAATAGAAGAAGAGAGTGGAAAGAACGTTATGGACACAACAGAGAGGATTCCACTCGGAACAGAAACGTCCA 1466
Query 1851 TACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATACCAGGGCTAATA 1924
|.|||||||||||||||||||.||||||||....|.|||||||.|.| |||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1467 TCCTGACCCCAAAGAGTCAAATTTCTCAGACACGACTACCAACTGGT---CATCCAAATACACCAGGGCTAATA 1537
Query 1925 ACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCAGAAACATTCACT 1998
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1538 ACAGGACTGAAAGAGACCGAATAGAACTTCTCCAGGATGCTGAGCCTCTGGATTTTAATGCAGAAACGTTTACG 1611
Query 1999 GATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTCTCGCAGTGACAT 2072
|||||..||||.|||.||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||..||||...||
Sbjct 1612 GATGAATCTCTGGAACCTGAGTCAGGAAGGTATCAACCTGGTGGGCGATATCTCTCCATGTCTTCCAGTATAAT 1685
Query 2073 ATTTAATGATGTT 2085
||||.|.|||.|.
Sbjct 1686 ATTTGAAGATATC 1698