Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09332
- Subject:
- XM_017010024.2
- Aligned Length:
- 2097
- Identities:
- 1395
- Gaps:
- 687
Alignment
Query 1 ATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTCATCGATATGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTTATTGTCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTCAAGCCCTCCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAACCCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTTTCAAGCCATG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTTTTAACATGGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAAAACTGCACTA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 ATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAGCTGTAAACCC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 ACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGTCTGTT----- 587
|||..||.|.||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------ATGATGTGTCTTGTCCA 17
Query 588 TCTTCTTGTGTTGTTGTTGGGGTATG-----GCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAG 656
|||||| ||.|| |.||..||||||.| ||| |..|||.|.|| ||
Sbjct 18 TCTTCT---------------GTCTGACAGAGATTCATGGAAAAT--------ATA-TTCAATAGTGC----AG 63
Query 657 GGGTTATCTA--CTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAA 728
|| ||| |.||| ||||||
Sbjct 64 GG-----CTACGCCTAT-------TATTTT-------------------------------------------- 81
Query 729 TTTGGAAGATGCCATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTG 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 ----------------GAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTG 139
Query 803 TTGATACAATACTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGAT 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 TTGATACAATACTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGAT 213
Query 877 TTTGATGAAAAGCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTTCATAAACAGGTGATTTATTCAGT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 TTTGATGAAAAGCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTGCATAAACAGGTGATTTATTCAGT 287
Query 951 TCAGAGACACCGTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAA 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 TCAGAGACACCGTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAA 361
Query 1025 AAAATGAAACTAGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAA 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 AAAATGAAACTAGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAA 435
Query 1099 TATTTTTATAATCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGT 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 TATTTTTATAATCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGT 509
Query 1173 GGTTCTGTCCATCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCC 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 GGTTCTGTCCATCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCC 583
Query 1247 TCTTTGCGGTCTTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCC 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 TCTTTGCGGTCTTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCC 657
Query 1321 ATCTTCTTCCTAAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTC 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ATCTTCTTCCTAAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTC 731
Query 1395 ACATCACCAGACTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTC 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 ACATCACCAGACTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTC 805
Query 1469 TTAATTTCTTGGGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCT 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 TTAATTTCTTGGGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCT 879
Query 1543 ATTATGGGTTCCATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAAT 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 ATTATGGGTTCCATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAAT 953
Query 1617 TCTCTGCATTGCTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAG 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 TCTCTGCATTGCTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAG 1027
Query 1691 ATGATGATATGACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGG 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 ATGATGATATGACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGG 1101
Query 1765 CAAGAAGAAGGTGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAA 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 CAAGAAGAAGGTGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAA 1175
Query 1839 CAGAAATATTCATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATA 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 CAGAAATATTCATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATA 1249
Query 1913 CCAGGGCTAATAACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCA 1986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CCAGGGCTAATAACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCA 1323
Query 1987 GAAACATTCACTGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTC 2060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GAAACATTCACTGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTC 1397
Query 2061 TCGCAGTGACATATTTAATGATGTT 2085
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 TCGCAGTGACATATTTAATGATGTT 1422