Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09342
- Subject:
- XM_006718058.4
- Aligned Length:
- 1084
- Identities:
- 1032
- Gaps:
- 50
Alignment
Query 1 ------------------------ATGG------AGC-CCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCAC 43
||.| |.| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTCACAGGAGTTTGTTGTACATAGTATTACATCACCCAGA-AATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCAC 73
Query 44 CTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGA 117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGA 147
Query 118 CCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATAC 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 CCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATAC 221
Query 192 GGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCA 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCA 295
Query 266 GCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCA------------------GAGAG 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 296 GCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCAGTAGCATTTGGCTTGGAGGAGAG 369
Query 322 CCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGG 395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGG 443
Query 396 AGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACA 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 AGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACA 517
Query 470 CCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTA 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTA 591
Query 544 ATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAG 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 ATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAG 665
Query 618 AGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAA 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAA 739
Query 692 AGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCG 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCG 813
Query 766 GGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGAC 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGAC 887
Query 840 GCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAA 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAA 961
Query 914 GTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTA 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTA 1035
Query 988 TTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTCTGC 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTCTGC 1083