Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09342
• Subject: XM_006718064.3
• Aligned Length: 1053
• Identities: 1017
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCAT  74
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------ATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCAT  56

Query   75  TGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   57  TGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTG  130

Query  149  AAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  131  AAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGT  204

Query  223  CTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  205  CTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACT  278

Query  297  CGTCTCAGTGTCTACAACCA------------------GAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTG  352
            ||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  279  CGTCTCAGTGTCTACAACCAGTAGCATTTGGCTTGGAGGAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTG  352

Query  353  TCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAG  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  TCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAG  426

Query  427  TTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGG  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  TTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGG  500

Query  501  CACAGACGTGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  CACAGACGTGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATG  574

Query  575  TTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGG  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  TTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGG  648

Query  649  GCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACAC  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  GCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACAC  722

Query  723  TGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTG  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  TGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTG  796

Query  797  ATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCAT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  ATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCAT  870

Query  871  GAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  GAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCT  944

Query  945  AGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  AGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAA  1018

Query 1019  AGAAGTCTTGTGTCTGC  1035
            |||||||||||||||||
Sbjct 1019  AGAAGTCTTGTGTCTGC  1035