Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09342
- Subject:
- XM_017016920.2
- Aligned Length:
- 1144
- Identities:
- 966
- Gaps:
- 176
Alignment
Query 1 ------------------------ATGG------AGC-CCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCAC 43
||.| |.| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTCACAGGAGTTTGTTGTACATAGTATTACATCACCCAGA-AATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCAC 73
Query 44 CTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGA 117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGA 147
Query 118 CCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATAC 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 CCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATAC 221
Query 192 GGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCA 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCA 295
Query 266 GCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCA----------------------- 316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCAGGCCATCTCTGAGCAAGAGCCTT 369
Query 317 -------------------------------------------------------GAGAGCCCATAAGTAGTGA 335
|||||||||||||||||||
Sbjct 370 GTAAAAATTAGGATGGTCACAAGTGTTCTCCACGGCCCACCCACTGAAAACACAGGAGAGCCCATAAGTAGTGA 443
Query 336 GCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGG 409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGG 517
Query 410 TTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAA 483
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 TTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACAC------------- 578
Query 484 ATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTA 557
|||||||||||||||||||||
Sbjct 579 -----------------------------------------------------CAGTCTAATGCTGGCGTGCTA 599
Query 558 TGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCT 631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCT 673
Query 632 GTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAG 705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674 GTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAG 747
Query 706 GTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748 GTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGT 821
Query 780 GGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGG 853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 GGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGG 895
Query 854 CTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAG 927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 CTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAG 969
Query 928 TTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAA 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 TTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAA 1043
Query 1002 AAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTCTGC 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044 AAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTCTGC 1077