Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09342
• Subject: XM_017016922.2
• Aligned Length: 1113
• Identities: 856
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGT  222
                             |||   |||.|      ||.|.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------ATG---ACTCA------CAGTAAGAGGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGT  48

Query  223  CTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   49  CTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACT  122

Query  297  CGTCTCAGTGTCTACAACCA------------------------------------------------------  316
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct  123  CGTCTCAGTGTCTACAACCAGGCCATCTCTGAGCAAGAGCCTTGTAAAAATTAGGATGGTCACAAGTGTTCTCC  196

Query  317  ------------------------GAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGAT  366
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  197  ACGGCCCACCCACTGAAAACACAGGAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGAT  270

Query  367  GAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGC  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271  GAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGC  344

Query  441  TCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  TCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATC  418

Query  515  TGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  TGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTC  492

Query  589  CGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGG  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  CGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGG  566

Query  663  CCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGA  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  CCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGA  640

Query  737  CCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAAT  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  CCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAAT  714

Query  811  GTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCA  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  GTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCA  788

Query  885  GTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAG  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  GTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAG  862

Query  959  TTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTC  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  TTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTC  936

Query 1033  TGC  1035
            |||
Sbjct  937  TGC  939