Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09358
• Subject: NM_178684.5
• Aligned Length: 742
• Identities: 632
• Gaps: 23

Alignment

Query   1  ATGTCTGATGAATTTTCGTTGGCAGATGCACTACCTGAACACTCCCCTGCCAAAACCTCTGCTGTGAGCAATAC  74
           |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||||||.|..|||||||||.||||||
Sbjct   1  ATGTCAGATGAATTTTCGTTGGCAGATGCGCTACCTGAACAGTCCTCTGCCAAACCGCCTGCTGTGACCAATAC  74

Query  75  AAAACCTGGCCAACCTCCTCAAGGCTGGCCAGGCTCCAACCCTTGGAATAATCCGAGTGCTCCATCTTCAGTGC  148
           ||||.|||||||..||.|||||||.|||||||||||||.|||.||||.|||.||.|||||||||.||.||.|||
Sbjct  75  AAAAGCTGGCCATTCTTCTCAAGGGTGGCCAGGCTCCAGCCCGTGGAGTAACCCAAGTGCTCCACCTGCAATGC  148

Query 149  CATCTGGACTCCCACCAAGT---GCAACACCCTCCACTGTGCCTTTTGGACCAGCACCAACAGGAATGTATCCC  219
           |||||||||||||.||.|||   |||.|||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 149  CATCTGGACTCCCCCCGAGTAGCGCAGCACCCTCTACTGTGCCTTTTGGACCAGTACCAACAGGAATGTATCCC  222

Query 220  TCCGTGCCTCCCACCGGACCACCTCCAGGACCCCCAGCACCCTTTCCTCCTTCCGGACCATCATGTCCCCCACC  293
           |||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||
Sbjct 223  TCCATGCCTCCAACCGGACCACCCCCAGGACCCCCGGGACCCTTTCCTCCTCCTGGACCATCATGCCCCCCACC  296

Query 294  TGGTGGTCCTTATCCAGCCCCAACTGTGCCGGGCCCTGGCCCCACAGGGCCATATCCTACACCAAATATGCCCT  367
           |||||.|||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||..
Sbjct 297  TGGTGTTCCTTATCCAGCCCCTGCTGTGCCAGGCCCTGGCCCCACAGGGCCATATGCTACGCCAAATATGCCTA  370

Query 368  TTCCAGAGCTACCCAGACCATATGGTGCACCCACAGATCCAGCTGCAGCTGGTCCTTTAGGTCCATGGGGATCC  441
           |.||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 371  TGCCAGAGCTGCCTAGGCCGTATGGTGCGCCCACAGATCCAGCTGCAGCCGGTTCTTTAGGTCCATGGGGACCC  444

Query 442  ATGTCTTCTGGACCTTGGGCGCCAGGAATGGGAGGGCAGTATCCTACCCCTAATATGCCATATCCATCTCCAGG  515
           ||||||||||||||||||||.||||||||.|..||||||.||      |||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 445  ATGTCTTCTGGACCTTGGGCACCAGGAATTGCGGGGCAGCAT------CCTAACATGCCATATCGATCTCCAGG  512

Query 516  CCCATATCCCGCTCCTCCTCCTCC----CCAGGCCCCTGGGGCAGCACCACCTGTTCCATGGGGCACCGTTCCA  585
           .|||||||||.||..|||||||||    .||||          ||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 513  GCCATATCCCACTGTTCCTCCTCCAGTGTCAGG----------AGCACCGCCTGTTCCGTGGGGCACTGTGCCA  576

Query 586  CCAGGAGCCTGGGGACCACCAGCACCATATCCTGCCCCTACAGGATCGTATCCCACACCAGGACTCTATCCTAC  659
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||.|.||||.|||||||.||.|||||.||||.||.|.|||||.|
Sbjct 577  CCAGGAGCCTGGGGACCAGCAGCACCATATCCCGGCCCTGCAGGATCATACCCCACGCCAGCACCCCATCCTGC  650

Query 660  TCCCAGTAATCCTTTCCAAGTGCCTTCAGGACCTTCTGGTGCTCCACCAATGCCTGGTGGCCCCCATTCTTACC  733
           ||..|..||.||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 651  TCTGAACAACCCTTACCAAGTGCCTTCAGGACCTGCTGGTGCTCCACCCATGCCTGGTGGCCCCCACTCTTACC  724

Query 734  AT  735
           ||
Sbjct 725  AT  726