Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09375
• Subject: NM_080386.4
• Aligned Length: 1350
• Identities: 1333
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGCCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCGGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  AGCCAGTAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCCAATAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACAGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518

Query  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTAACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666

Query  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACAGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTCGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ACGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCATGAGCAGCTGTCTGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAAATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAATGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACTATCCAGTTTGTGGATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTGGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGTCCATAAGTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCATAAGTT  1184

Query 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGTGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTGTGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT  1332

Query 1333  GAAGAAGGCGAAGAATAC  1350
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGAAGGCGAAGAATAC  1350