Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09428
• Subject: NM_001276326.2
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1554
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGGCATTTTCTGAACTCCTGGACCTCGTGGGTGGCCTGGGCAGGTTCCAGGTTCTCCAGACGATGGCTCTGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCATTTTCTGAACTCCTGGACCTCGTGGGTGGCCTGGGCAGGTTCCAGGTTCTCCAGACGATGGCTCTGAT  74

Query   75  GGTCTCCATCATGTGGCTGTGTACCCAGAGCATGCTGGAGAACTTCTCGGCCGCCGTGCCCAGCCACCGCTGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTCTCCATCATGTGGCTGTGTACCCAGAGCATGCTGGAGAACTTCTCGGCCGCCGTGCCCAGCCACCGCTGCT  148

Query  149  GGGCACCCCTCCTGGACAACAGCACGGCTCAGGCCAGCATCCTAGGGAGCTTGAGTCCTGAGGCCCTCCTGGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCACCCCTCCTGGACAACAGCACGGCTCAGGCCAGCATCCTAGGGAGCTTGAGTCCTGAGGCCCTCCTGGCT  222

Query  223  ATTTCCATCCCGCCGGGCCCCAACCAGAGGCCCCATCAGTGCCGCCGCTTCCGCCAGCCACAGTGGCAGCTCTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTTCCATCCCGCCGGGCCCCAACCAGAGGCCCCACCAGTGCCGCCGCTTCCGCCAGCCACAGTGGCAGCTCTT  296

Query  297  GGACCCCAATGCCACGGCCACCAGCTGGAGCGAGGCCGACACGGAGCCGTGTGTGGATGGCTGGGTCTATGACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACCCCAATGCCACGGCCACCAGCTGGAGCGAGGCCGACACGGAGCCGTGTGTGGATGGCTGGGTCTATGACC  370

Query  371  GCAGCATCTTCACCTCCACAATCGTGGCCAAGTGGAACCTCGTGTGTGACTCTCACGCTCTGAAGCCCATGGCC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAGCATCTTCACCTCCACAATCGTGGCCAAGTGGAACCTCGTGTGTGACTCTCATGCTCTGAAGCCCATGGCC  444

Query  445  CAGTCCATCTACCTGGCTGGGATTCTGGTGGGAGCTGCTGCGTGCGGCCCTGCCTCAGACAGGTTTGGGCGCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCCATCTACCTGGCTGGGATTCTGGTGGGAGCTGCTGCGTGCGGCCCTGCCTCAGACAGGTTTGGGCGCAG  518

Query  519  GCTGGTGCTAACCTGGAGCTACCTTCAGATGGCTGTGATGGGTACGGCAGCTGCCTTCGCCCCTGCCTTCCCCG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct  519  GCTGGTGCTAACCTGGAGCTACCTTCAGATGGCTGTGATGG---------------------------------  559

Query  593  TGTACTGCCTGTTCCGCTTCCTGTTGGCCTTTGCCGTGGCAGGCGTCATGATGAACACGGGCACTCTCCTGATG  666
                                                                                 |||||
Sbjct  560  ---------------------------------------------------------------------TGATG  564

Query  667  GAGTGGACGGCGGCACGGGCCCGACCCTTGGTGATGACCTTGAACTCTCTGGGCTTCAGCTTCGGCCATGGCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GAGTGGACGGCGGCACGGGCCCGACCCTTGGTGATGACCTTGAACTCTCTGGGCTTCAGCTTCGGCCATGGCCT  638

Query  741  GACAGCTGCAGTGGCCTACGGTGTGCGGGACTGGACACTGCTGCAGCTGGTGGTCTCGGTCCCCTTCTTCCTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  GACAGCTGCAGTGGCCTACGGTGTGCGGGACTGGACACTGCTGCAGCTGGTGGTCTCGGTCCCCTTCTTCCTCT  712

Query  815  GCTTTTTGTACTCCTGGTGGCTGGCAGAGTCGGCACGATGGCTCCTCACCACAGGCAGGCTGGATTGGGGCCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  GCTTTTTGTACTCCTGGTGGCTGGCAGAGTCGGCACGATGGCTCCTCACCACAGGCAGGCTGGATTGGGGCCTG  786

Query  889  CAGGAGCTGTGGAGGGTGGCTGCCATCAACGGAAAGGGGGCAGTGCAGGACACCCTGACCCCTGAGGTCTTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  CAGGAGCTGTGGAGGGTGGCTGCCATCAACGGAAAGGGGGCAGTGCAGGACACCCTGACCCCTGAGGTCTTGCT  860

Query  963  TTCAGCCATGCGGGAGGAGCTGAGCATGGGCCAGCCTCCTGCCAGCCTGGGCACCCTGCTCCGCATGCCCGGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  TTCAGCCATGCGGGAGGAGCTGAGCATGGGCCAGCCTCCTGCCAGCCTGGGCACCCTGCTCCGCATGCCCGGAC  934

Query 1037  TGCGCTTCCGGACCTGTATCTCCACGTTGTGCTGGTTCGCCTTTGGCTTCACCTTCTTCGGCCTGGCCCTGGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  TGCGCTTCCGGACCTGTATCTCCACGTTGTGCTGGTTCGCCTTTGGCTTCACCTTCTTCGGCCTGGCCCTGGAC  1008

Query 1111  CTGCAGGCCCTGGGCAGCAACATCTTCCTGCTCCAAATGTTCATTGGTGTCGTGGACATCCCAGCCAAGATGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  CTGCAGGCCCTGGGCAGCAACATCTTCCTGCTCCAAATGTTCATTGGTGTCGTGGACATCCCAGCCAAGATGGG  1082

Query 1185  CGCCCTGCTGCTGCTGAGCCACCTGGGCCGCCGCCCCACGCTGGCCGCATCCCTGTTGCTGGCGGGGCTCTGCA  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1083  CGCCCTGCTGCTGCTGAGCCACCTGGGCCGCCGCCCCACGCTGGCCGCATCCCTGTTGCTGGCAGGGCTCTGCA  1156

Query 1259  TTCTGGCCAACACGCTGGTGCCCCACGAAATGGGGGCTCTGCGCTCAGCCTTGGCCGTGCTGGGGCTGGGCGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  TTCTGGCCAACACGCTGGTGCCCCACGAAATGGGGGCTCTGCGCTCAGCCTTGGCCGTGCTGGGGCTGGGCGGG  1230

Query 1333  GTGGGGGCTGCCTTCACCTGCATCACCATCTACAGCAGCGAGCTCTTCCCCACTGTGCTCAGGATGACGGCAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  GTGGGGGCTGCCTTCACCTGCATCACCATCTACAGCAGCGAGCTCTTCCCCACTGTGCTCAGGATGACGGCAGT  1304

Query 1407  GGGCTTGGGCCAGATGGCAGCCCGTGGAGGAGCCATCCTGGGGCCTCTGGTCCGGCTGCTGGGTGTCCATGGCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  GGGCTTGGGCCAGATGGCAGCCCGTGGAGGAGCCATCCTGGGGCCTCTGGTCCGGCTGCTGGGTGTCCATGGCC  1378

Query 1481  CCTGGCTGCCCTTGCTGGTGTATGGGACGGTGCCAGTGCTGAGTGGCCTGGCCGCACTGCTTCTGCCCGAGACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  CCTGGCTGCCCTTGCTGGTGTATGGGACGGTGCCAGTGCTGAGTGGCCTGGCCGCACTGCTTCTGCCCGAGACC  1452

Query 1555  CAGAGCTTGCCGCTGCCCGACACCATCCAAGATGTGCAGAACCAGGCAGTAAAGAAGGCAACACATGGCACGCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  CAGAGCTTGCCGCTGCCCGACACCATCCAAGATGTGCAGAACCAGGCAGTAAAGAAGGCAACACATGGCACGCT  1526

Query 1629  GGGGAACTCTGTCCTAAAATCCACACAGTTT  1659
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  GGGGAACTCTGTCCTAAAATCCACACAGTTT  1557