Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09428
• Subject: XM_006718430.4
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1656
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGGCATTTTCTGAACTCCTGGACCTCGTGGGTGGCCTGGGCAGGTTCCAGGTTCTCCAGACGATGGCTCTGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCATTTTCTGAACTCCTGGACCTCGTGGGTGGCCTGGGCAGGTTCCAGGTTCTCCAGACGATGGCTCTGAT  74

Query   75  GGTCTCCATCATGTGGCTGTGTACCCAGAGCATGCTGGAGAACTTCTCGGCCGCCGTGCCCAGCCACCGCTGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTCTCCATCATGTGGCTGTGTACCCAGAGCATGCTGGAGAACTTCTCGGCCGCCGTGCCCAGCCACCGCTGCT  148

Query  149  GGGCACCCCTCCTGGACAACAGCACGGCTCAGGCCAGCATCCTAGGGAGCTTGAGTCCTGAGGCCCTCCTGGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCACCCCTCCTGGACAACAGCACGGCTCAGGCCAGCATCCTAGGGAGCTTGAGTCCTGAGGCCCTCCTGGCT  222

Query  223  ATTTCCATCCCGCCGGGCCCCAACCAGAGGCCCCATCAGTGCCGCCGCTTCCGCCAGCCACAGTGGCAGCTCTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTTCCATCCCGCCGGGCCCCAACCAGAGGCCCCACCAGTGCCGCCGCTTCCGCCAGCCACAGTGGCAGCTCTT  296

Query  297  GGACCCCAATGCCACGGCCACCAGCTGGAGCGAGGCCGACACGGAGCCGTGTGTGGATGGCTGGGTCTATGACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACCCCAATGCCACGGCCACCAGCTGGAGCGAGGCCGACACGGAGCCGTGTGTGGATGGCTGGGTCTATGACC  370

Query  371  GCAGCATCTTCACCTCCACAATCGTGGCCAAGTGGAACCTCGTGTGTGACTCTCACGCTCTGAAGCCCATGGCC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAGCATCTTCACCTCCACAATCGTGGCCAAGTGGAACCTCGTGTGTGACTCTCATGCTCTGAAGCCCATGGCC  444

Query  445  CAGTCCATCTACCTGGCTGGGATTCTGGTGGGAGCTGCTGCGTGCGGCCCTGCCTCAGACAGGTTTGGGCGCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCCATCTACCTGGCTGGGATTCTGGTGGGAGCTGCTGCGTGCGGCCCTGCCTCAGACAGGTTTGGGCGCAG  518

Query  519  GCTGGTGCTAACCTGGAGCTACCTTCAGATGGCTGTGATGGGTACGGCAGCTGCCTTCGCCCCTGCCTTCCCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGTGCTAACCTGGAGCTACCTTCAGATGGCTGTGATGGGTACGGCAGCTGCCTTCGCCCCTGCCTTCCCCG  592

Query  593  TGTACTGCCTGTTCCGCTTCCTGTTGGCCTTTGCCGTGGCAGGCGTCATGATGAACACGGGCACTCTCC-----  661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  593  TGTACTGCCTGTTCCGCTTCCTGTTGGCCTTTGCCGTGGCAGGCGTCATGATGAACACGGGCACTCTCCGTAGG  666

Query  662  ----------------------------------------------------------------------TGAT  665
                                                                                  ||||
Sbjct  667  TCTCTGACCTGGCGCCATGCAGGGGGGCTCCATGCAGGCTCCAGGGCTGAACCACTCGGTCTCCTTGCAGTGAT  740

Query  666  GGAGTGGACGGCGGCACGGGCCCGACCCTTGGTGATGACCTTGAACTCTCTGGGCTTCAGCTTCGGCCATGGCC  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGTGGACGGCGGCACGGGCCCGACCCTTGGTGATGACCTTGAACTCTCTGGGCTTCAGCTTCGGCCATGGCC  814

Query  740  TGACAGCTGCAGTGGCCTACGGTGTGCGGGACTGGACACTGCTGCAGCTGGTGGTCTCGGTCCCCTTCTTCCTC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGACAGCTGCAGTGGCCTACGGTGTGCGGGACTGGACACTGCTGCAGCTGGTGGTCTCGGTCCCCTTCTTCCTC  888

Query  814  TGCTTTTTGTACTCCTGGTGGCTGGCAGAGTCGGCACGATGGCTCCTCACCACAGGCAGGCTGGATTGGGGCCT  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCTTTTTGTACTCCTGGTGGCTGGCAGAGTCGGCACGATGGCTCCTCACCACAGGCAGGCTGGATTGGGGCCT  962

Query  888  GCAGGAGCTGTGGAGGGTGGCTGCCATCAACGGAAAGGGGGCAGTGCAGGACACCCTGACCCCTGAGGTCTTGC  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGGAGCTGTGGAGGGTGGCTGCCATCAACGGAAAGGGGGCAGTGCAGGACACCCTGACCCCTGAGGTCTTGC  1036

Query  962  TTTCAGCCATGCGGGAGGAGCTGAGCATGGGCCAGCCTCCTGCCAGCCTGGGCACCCTGCTCCGCATGCCCGGA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTCAGCCATGCGGGAGGAGCTGAGCATGGGCCAGCCTCCTGCCAGCCTGGGCACCCTGCTCCGCATGCCCGGA  1110

Query 1036  CTGCGCTTCCGGACCTGTATCTCCACGTTGTGCTGGTTCGCCTTTGGCTTCACCTTCTTCGGCCTGGCCCTGGA  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCGCTTCCGGACCTGTATCTCCACGTTGTGCTGGTTCGCCTTTGGCTTCACCTTCTTCGGCCTGGCCCTGGA  1184

Query 1110  CCTGCAGGCCCTGGGCAGCAACATCTTCCTGCTCCAAATGTTCATTGGTGTCGTGGACATCCCAGCCAAGATGG  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGCAGGCCCTGGGCAGCAACATCTTCCTGCTCCAAATGTTCATTGGTGTCGTGGACATCCCAGCCAAGATGG  1258

Query 1184  GCGCCCTGCTGCTGCTGAGCCACCTGGGCCGCCGCCCCACGCTGGCCGCATCCCTGTTGCTGGCGGGGCTCTGC  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  GCGCCCTGCTGCTGCTGAGCCACCTGGGCCGCCGCCCCACGCTGGCCGCATCCCTGTTGCTGGCAGGGCTCTGC  1332

Query 1258  ATTCTGGCCAACACGCTGGTGCCCCACGAAATGGGGGCTCTGCGCTCAGCCTTGGCCGTGCTGGGGCTGGGCGG  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTCTGGCCAACACGCTGGTGCCCCACGAAATGGGGGCTCTGCGCTCAGCCTTGGCCGTGCTGGGGCTGGGCGG  1406

Query 1332  GGTGGGGGCTGCCTTCACCTGCATCACCATCTACAGCAGCGAGCTCTTCCCCACTGTGCTCAGGATGACGGCAG  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTGGGGGCTGCCTTCACCTGCATCACCATCTACAGCAGCGAGCTCTTCCCCACTGTGCTCAGGATGACGGCAG  1480

Query 1406  TGGGCTTGGGCCAGATGGCAGCCCGTGGAGGAGCCATCCTGGGGCCTCTGGTCCGGCTGCTGGGTGTCCATGGC  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGGCTTGGGCCAGATGGCAGCCCGTGGAGGAGCCATCCTGGGGCCTCTGGTCCGGCTGCTGGGTGTCCATGGC  1554

Query 1480  CCCTGGCTGCCCTTGCTGGTGTATGGGACGGTGCCAGTGCTGAGTGGCCTGGCCGCACTGCTTCTGCCCGAGAC  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTGGCTGCCCTTGCTGGTGTATGGGACGGTGCCAGTGCTGAGTGGCCTGGCCGCACTGCTTCTGCCCGAGAC  1628

Query 1554  CCAGAGCTTGCCGCTGCCCGACACCATCCAAGATGTGCAGAACCAGGCAGTAAAGAAGGCAACACATGGCACGC  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGAGCTTGCCGCTGCCCGACACCATCCAAGATGTGCAGAACCAGGCAGTAAAGAAGGCAACACATGGCACGC  1702

Query 1628  TGGGGAACTCTGTCCTAAAATCCACACAGTTT  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGGGAACTCTGTCCTAAAATCCACACAGTTT  1734