Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09438
• Subject: NM_207223.1
• Aligned Length: 2505
• Identities: 2149
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74
            |||||.||.|||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGACGGTAGAGTTCGAGGAATGCATCAAGGACTCGCCGCGCTTCAGGGCAACTATTGATGAGGTAGAAACAGA  74

Query   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148
            .|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||.||.||||
Sbjct   75  TGTGGTTGAGATCGAGGCTAAACTGGACAAGCTGGTCAAACTGTGCAGTGGTATGATTGAAGCCGGCAAAGCCT  148

Query  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222
            ||||||.|||||.||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGTCACCACCAACAGGCTCTTTGTGAGCGGTGTCCGAGACCTGTCTCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222

Query  223  TCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGC  296
            ||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||.||||.|||||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  223  TCGGAATGTCTGCAGAGGTTTGGAGACAGCCTACAGGAGATGGTCAACTATCACACGATCCTGTTTGACCAGGC  296

Query  297  CCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGC  370
            ||||||.||.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAGATCGGTGCGGCAGCAGCTCCACAACTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAAGAGACAAAGAAGC  370

Query  371  AGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCAC  444
            ||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  371  AGTTTGACAAAGTGCGGGAGGACATGGAGTTGTCCTTGGTGAGGAATGCCCAAGCCCCAAGGCACCGGCCCCAT  444

Query  445  GAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCT  518
            ||.||.|||||.|||||.||.||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGTAGAGGAGGCCACAGGTGCCCTCACTGTCACCCGGAAGTGCTTCCGCCACTTGGCGCTGGACTATGTGCT  518

Query  519  CCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGT  592
            .|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCAGATCAATGTCCTCCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAAATCTTAGATTCTATGCTGTCCTTCATGCATGCCCAGT  592

Query  593  CCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTG  666
            .||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct  593  ACAGCTTCTTCCAGCAGGGGTATAGCCTCCTACATCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCTGAGTTG  666

Query  667  GACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGAC  740
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  GACCAGCTTGTGATCGACTCTGCAGTGGAAAAGCGAGAGATGGAGCGCAAGCATGCTGCCATCCAGCAACGGAC  740

Query  741  GCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGG  814
            .||.|||||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  741  ACTCCTGCAGGACTTTTCCTATGATGAACCCAAAGTGGAGTTTGATGTGGATGCACCAAGTGGTGTGGTAATGG  814

Query  815  AGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGC  888
            |||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  AGGGCTATCTCTTCAAGAGAGCCAGCAATGCCTTCAAGACATGGAACCGACGGTGGTTCTCCATTCAAAACAGC  888

Query  889  CAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAA  962
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  889  CAGCTGGTCTACCAGAAGAAACTCAAGGATGCACTCACTGTGGTGGTAGATGACCTTCGCCTATGCTCTGTGAA  962

Query  963  GCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTG  1036
            .||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  ACCATGTGAGGACATTGAACGGAGGTTCTGCTTTGAAGTCGTGTCACCTACCAAGAGCTGTATGCTGCAGGCTG  1036

Query 1037  ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCT  1110
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1037  ACTCGGAGAAGCTGCGACAGGCTTGGGTTCAAGCTGTGCAGGCTAGCATCGCCTCTGCCTACCGGGAAAGTCCA  1110

Query 1111  GACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACAC  1184
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||.||||.|||.|
Sbjct 1111  GATAGCTGCTACAGTGAGAGGCTGGACCGTACAGCGTCGCCATCAACAAGTAGCATTGATTCCACCACGGACTC  1184

Query 1185  TCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCG  1258
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  TCGGGAGCGTGGAGTCAAGGGCGAGAGCGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCTGGCAACAGCCAGTGTGGCG  1258

Query 1259  ACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATC  1332
            ||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259  ACTGTGGCCAGCCAGATCCCCGCTGGGCCAGCATCAACTTGGGTGTGCTGCTCTGTATTGAGTGCTCAGGCATC  1332

Query 1333  CACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAA  1406
            |||||||||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CACAGGAGCTTGGGCGTCCACTGCTCTAAGGTACGATCTCTGACACTGGACTCCTGGGAGCCAGAGCTGCTAAA  1406

Query 1407  GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGA  1480
            |||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||...||||
Sbjct 1407  GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCACCGTGAACCAGATCTATGAAGCCCAGTGTGAGGGCCCAGGCGTTAGGA  1480

Query 1481  AACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTG  1554
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1481  AACCCACAGCCAGCAGTTCCAGGCAGGACAAAGAGGCATGGATCAAGGACAAATACGTTGAAAAGAAGTTTCTA  1554

Query 1555  CGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAG  1628
            ||||||..|.|....||||||||||.|||..||||||||||||||||||..||||||||||.|||.||.|||||
Sbjct 1555  CGGAAGTTGACTTCTGCACCAGCCCGGGAACCCCCAAGACGCTGGAGGGCACAGAAGTGCCAGCGCCCTCACAG  1628

Query 1629  CTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCT  1702
            |||.||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||.||||||
Sbjct 1629  CTCCCCCCACGCCCCCACTACCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTCCTGCCCTCCGTTGCTGCTTTGTCCT  1702

Query 1703  CAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCC  1776
            |||..|..||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1703  CAGCTGCTACTATGGAGCGCAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGCCCTGATGAGCTGGACTCCCTCTTCTCT  1776

Query 1777  TACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGA  1850
            |||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1777  TACTTTGATGCAGGGGCTGCTGGGGCTGGTCCACGCAGTCTAAGCAGTGACAGTGGTCTAGGAGGCAGCTCTGA  1850

Query 1851  TGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGT  1924
            ||||||.||.||.||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1851  TGGCAGTTCAGATGTTCTTGCCTTCGGCACAGGCTCAGTGGTGGACAGTGTCACCGAGGAAGAGGGTGCCGAGT  1924

Query 1925  CGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTG  1998
            |.||||||||||||.||||||..||.||      .||.||.|||||||||.||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1925  CCGAGGAGTCCAGCAGTGAGGTCGATGG------AGAAGCAGAGGCCTGGAGCTTGGCAGATGTGCGTGAGCTG  1992

Query 1999  CACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGG  2072
            ||.||.|||||..||||.||.|..|||||.|||.||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1993  CATCCTGGGCTGCTGGCACATCAGGCAGCTCGTACCCGTGACCTCCCAGCACTGGCTGCAGCGCTGGCCCATGG  2066

Query 2073  GGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCT  2146
            .||.||.|||||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||..||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 2067  AGCTGAAGTCAACTGGGCCGATGCAGCAGATGAGGGCAAGACCCCATTGGTGCAGGCTGTACTAGGGGGTTCCT  2140

Query 2147  TGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTG  2220
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||
Sbjct 2141  TGATTGTCTGTGAGTTCCTTCTGCAAAACGGAGCTGATGTGAACCAAAGAGACAGCCTTGGCCGGGCCCCCTTG  2214

Query 2221  CACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCT  2294
            |||||.||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2215  CACCATGCTACACTCTTGGGCCGTACCGGCCAGGTCTGTCTGTTCCTGAAGCGGGGGGCTGACCAGCATGCCCT  2288

Query 2295  GGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTC  2368
            ||||||.|||||.|.||||||..||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||.||||.||.|
Sbjct 2289  GGACCAGGAGCAACAGGACCCACTGACCATCGCAGTTCAAGCAGCGAATGCTGACATTGTCACATTGCTTCGCC  2362

Query 2369  TGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGC---  2439
            ||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.|||||..|||||||||..|||||..|||||.||||||||   
Sbjct 2363  TGGCCCGCATGGCTGAGGAGATGAGAGAAGCTGAGGCGCCCCCTGGTCAGCCGGGACCCCTGCCGGGCAGCAGT  2436

Query 2440  CCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC  2502
            ||.||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||
Sbjct 2437  CCTACAGAGCTGCAGTACCGCAGGTGCATCCAGGAGTTCATTGGCCTCCACCTGGAGGAAAGC  2499