Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09438
- Subject:
- XM_006538541.3
- Aligned Length:
- 2505
- Identities:
- 2041
- Gaps:
- 135
Alignment
Query 1 ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT 148
|||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------ATGATTGAAGCCGGCAAAGCCT 22
Query 149 ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC 222
||||||.|||||.||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 ACGTCACCACCAACAGGCTCTTTGTGAGCGGTGTCCGAGACCTGTCTCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC 96
Query 223 TCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGC 296
||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||.||||.|||||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 97 TCGGAATGTCTGCAGAGGTTTGGAGACAGCCTACAGGAGATGGTCAACTATCACACGATCCTGTTTGACCAGGC 170
Query 297 CCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGC 370
||||||.||.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 171 CCAGAGATCGGTGCGGCAGCAGCTCCACAACTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAAGAGACAAAGAAGC 244
Query 371 AGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCAC 444
||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 245 AGTTTGACAAAGTGCGGGAGGACATGGAGTTGTCCTTGGTGAGGAATGCCCAAGCCCCAAGGCACCGGCCCCAT 318
Query 445 GAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCT 518
||.||.|||||.|||||.||.||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 319 GAAGTAGAGGAGGCCACAGGTGCCCTCACTGTCACCCGGAAGTGCTTCCGCCACTTGGCGCTGGACTATGTGCT 392
Query 519 CCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGT 592
.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 393 GCAGATCAATGTCCTCCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAAATCTTAGATTCTATGCTGTCCTTCATGCATGCCCAGT 466
Query 593 CCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTG 666
.||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 467 ACAGCTTCTTCCAGCAGGGGTATAGCCTCCTACATCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCTGAGTTG 540
Query 667 GACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGAC 740
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 541 GACCAGCTTGTGATCGACTCTGCAGTGGAAAAGCGAGAGATGGAGCGCAAGCATGCTGCCATCCAGCAACGGAC 614
Query 741 GCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGG 814
.||.|||||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 615 ACTCCTGCAGGACTTTTCCTATGATGAACCCAAAGTGGAGTTTGATGTGGATGCACCAAGTGGTGTGGTAATGG 688
Query 815 AGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGC 888
|||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 689 AGGGCTATCTCTTCAAGAGAGCCAGCAATGCCTTCAAGACATGGAACCGACGGTGGTTCTCCATTCAAAACAGC 762
Query 889 CAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAA 962
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 763 CAGCTGGTCTACCAGAAGAAACTCAAGGATGCACTCACTGTGGTGGTAGATGACCTTCGCCTATGCTCTGTGAA 836
Query 963 GCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTG 1036
.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 837 ACCATGTGAGGACATTGAACGGAGGTTCTGCTTTGAAGTCGTGTCACCTACCAAGAGCTGTATGCTGCAGGCTG 910
Query 1037 ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCT 1110
||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 911 ACTCGGAGAAGCTGCGACAGGCTTGGGTTCAAGCTGTGCAGGCTAGCATCGCCTCTGCCTACCGGGAAAGTCCA 984
Query 1111 GACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACAC 1184
||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||.||||.|||.|
Sbjct 985 GATAGCTGCTACAGTGAGAGGCTGGACCGTACAGCGTCGCCATCAACAAGTAGCATTGATTCCACCACGGACTC 1058
Query 1185 TCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCG 1258
||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1059 TCGGGAGCGTGGAGTCAAGGGCGAGAGCGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCTGGCAACAGCCAGTGTGGCG 1132
Query 1259 ACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATC 1332
||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1133 ACTGTGGCCAGCCAGATCCCCGCTGGGCCAGCATCAACTTGGGTGTGCTGCTCTGTATTGAGTGCTCAGGCATC 1206
Query 1333 CACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAA 1406
|||||||||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1207 CACAGGAGCTTGGGCGTCCACTGCTCTAAGGTACGATCTCTGACACTGGACTCCTGGGAGCCAGAGCTGCTAAA 1280
Query 1407 GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGA 1480
|||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||...||||
Sbjct 1281 GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCACCGTGAACCAGATCTATGAAGCCCAGTGTGAGGGCCCAGGCGTTAGGA 1354
Query 1481 AACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTG 1554
||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1355 AACCCACAGCCAGCAGTTCCAGGCAGGACAAAGAGGCATGGATCAAGGACAAATACGTTGAAAAGAAGTTTCTA 1428
Query 1555 CGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAG 1628
||||||..|.|....||||||||||.|||..||||||||||||||||||..||||||||||.|||.||.|||||
Sbjct 1429 CGGAAGTTGACTTCTGCACCAGCCCGGGAACCCCCAAGACGCTGGAGGGCACAGAAGTGCCAGCGCCCTCACAG 1502
Query 1629 CTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCT 1702
|||.||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||.||||||
Sbjct 1503 CTCCCCCCACGCCCCCACTACCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTCCTGCCCTCCGTTGCTGCTTTGTCCT 1576
Query 1703 CAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCC 1776
|||..|..||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1577 CAGCTGCTACTATGGAGCGCAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGCCCTGATGAGCTGGACTCCCTCTTCTCT 1650
Query 1777 TACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGA 1850
|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1651 TACTTTGATGCAGGGGCTGCTGGGGCTGGTCCACGCAGTCTAAGCAGTGACAGTGGTCTAGGAGGCAGCTCTGA 1724
Query 1851 TGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGT 1924
||||||.||.||.||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1725 TGGCAGTTCAGATGTTCTTGCCTTCGGCACAGGCTCAGTGGTGGACAGTGTCACCGAGGAAGAGGGTGCCGAGT 1798
Query 1925 CGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTG 1998
|.||||||||||||.||||||..||.|| .||.||.|||||||||.||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1799 CCGAGGAGTCCAGCAGTGAGGTCGATGG------AGAAGCAGAGGCCTGGAGCTTGGCAGATGTGCGTGAGCTG 1866
Query 1999 CACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGG 2072
||.||.|||||..||||.||.|..|||||.|||.||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1867 CATCCTGGGCTGCTGGCACATCAGGCAGCTCGTACCCGTGACCTCCCAGCACTGGCTGCAGCGCTGGCCCATGG 1940
Query 2073 GGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCT 2146
.||.||.|||||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||..||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1941 AGCTGAAGTCAACTGGGCCGATGCAGCAGATGAGGGCAAGACCCCATTGGTGCAGGCTGTACTAGGGGGTTCCT 2014
Query 2147 TGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTG 2220
||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||
Sbjct 2015 TGATTGTCTGTGAGTTCCTTCTGCAAAACGGAGCTGATGTGAACCAAAGAGACAGCCTTGGCCGGGCCCCCTTG 2088
Query 2221 CACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCT 2294
|||||.||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2089 CACCATGCTACACTCTTGGGCCGTACCGGCCAGGTCTGTCTGTTCCTGAAGCGGGGGGCTGACCAGCATGCCCT 2162
Query 2295 GGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTC 2368
||||||.|||||.|.||||||..||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||.||||.||.|
Sbjct 2163 GGACCAGGAGCAACAGGACCCACTGACCATCGCAGTTCAAGCAGCGAATGCTGACATTGTCACATTGCTTCGCC 2236
Query 2369 TGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGC--- 2439
||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.|||||..|||||||||..|||||..|||||.||||||||
Sbjct 2237 TGGCCCGCATGGCTGAGGAGATGAGAGAAGCTGAGGCGCCCCCTGGTCAGCCGGGACCCCTGCCGGGCAGCAGT 2310
Query 2440 CCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC 2502
||.||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||
Sbjct 2311 CCTACAGAGCTGCAGTACCGCAGGTGCATCCAGGAGTTCATTGGCCTCCACCTGGAGGAAAGC 2373