Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09438
• Subject: XM_006538542.1
• Aligned Length: 2505
• Identities: 2041
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148
                                                                |||.|.||||||||.||.||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------ATGATTGAAGCCGGCAAAGCCT  22

Query  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222
            ||||||.|||||.||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   23  ACGTCACCACCAACAGGCTCTTTGTGAGCGGTGTCCGAGACCTGTCTCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  96

Query  223  TCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGC  296
            ||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||.||||.|||||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct   97  TCGGAATGTCTGCAGAGGTTTGGAGACAGCCTACAGGAGATGGTCAACTATCACACGATCCTGTTTGACCAGGC  170

Query  297  CCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGC  370
            ||||||.||.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  171  CCAGAGATCGGTGCGGCAGCAGCTCCACAACTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAAGAGACAAAGAAGC  244

Query  371  AGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCAC  444
            ||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  245  AGTTTGACAAAGTGCGGGAGGACATGGAGTTGTCCTTGGTGAGGAATGCCCAAGCCCCAAGGCACCGGCCCCAT  318

Query  445  GAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCT  518
            ||.||.|||||.|||||.||.||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  319  GAAGTAGAGGAGGCCACAGGTGCCCTCACTGTCACCCGGAAGTGCTTCCGCCACTTGGCGCTGGACTATGTGCT  392

Query  519  CCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGT  592
            .|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  393  GCAGATCAATGTCCTCCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAAATCTTAGATTCTATGCTGTCCTTCATGCATGCCCAGT  466

Query  593  CCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTG  666
            .||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct  467  ACAGCTTCTTCCAGCAGGGGTATAGCCTCCTACATCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCTGAGTTG  540

Query  667  GACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGAC  740
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  541  GACCAGCTTGTGATCGACTCTGCAGTGGAAAAGCGAGAGATGGAGCGCAAGCATGCTGCCATCCAGCAACGGAC  614

Query  741  GCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGG  814
            .||.|||||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  615  ACTCCTGCAGGACTTTTCCTATGATGAACCCAAAGTGGAGTTTGATGTGGATGCACCAAGTGGTGTGGTAATGG  688

Query  815  AGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGC  888
            |||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  689  AGGGCTATCTCTTCAAGAGAGCCAGCAATGCCTTCAAGACATGGAACCGACGGTGGTTCTCCATTCAAAACAGC  762

Query  889  CAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAA  962
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  763  CAGCTGGTCTACCAGAAGAAACTCAAGGATGCACTCACTGTGGTGGTAGATGACCTTCGCCTATGCTCTGTGAA  836

Query  963  GCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTG  1036
            .||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  837  ACCATGTGAGGACATTGAACGGAGGTTCTGCTTTGAAGTCGTGTCACCTACCAAGAGCTGTATGCTGCAGGCTG  910

Query 1037  ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCT  1110
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct  911  ACTCGGAGAAGCTGCGACAGGCTTGGGTTCAAGCTGTGCAGGCTAGCATCGCCTCTGCCTACCGGGAAAGTCCA  984

Query 1111  GACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACAC  1184
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||.||||.|||.|
Sbjct  985  GATAGCTGCTACAGTGAGAGGCTGGACCGTACAGCGTCGCCATCAACAAGTAGCATTGATTCCACCACGGACTC  1058

Query 1185  TCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCG  1258
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1059  TCGGGAGCGTGGAGTCAAGGGCGAGAGCGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCTGGCAACAGCCAGTGTGGCG  1132

Query 1259  ACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATC  1332
            ||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1133  ACTGTGGCCAGCCAGATCCCCGCTGGGCCAGCATCAACTTGGGTGTGCTGCTCTGTATTGAGTGCTCAGGCATC  1206

Query 1333  CACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAA  1406
            |||||||||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1207  CACAGGAGCTTGGGCGTCCACTGCTCTAAGGTACGATCTCTGACACTGGACTCCTGGGAGCCAGAGCTGCTAAA  1280

Query 1407  GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGA  1480
            |||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||...||||
Sbjct 1281  GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCACCGTGAACCAGATCTATGAAGCCCAGTGTGAGGGCCCAGGCGTTAGGA  1354

Query 1481  AACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTG  1554
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1355  AACCCACAGCCAGCAGTTCCAGGCAGGACAAAGAGGCATGGATCAAGGACAAATACGTTGAAAAGAAGTTTCTA  1428

Query 1555  CGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAG  1628
            ||||||..|.|....||||||||||.|||..||||||||||||||||||..||||||||||.|||.||.|||||
Sbjct 1429  CGGAAGTTGACTTCTGCACCAGCCCGGGAACCCCCAAGACGCTGGAGGGCACAGAAGTGCCAGCGCCCTCACAG  1502

Query 1629  CTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCT  1702
            |||.||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||.||||||
Sbjct 1503  CTCCCCCCACGCCCCCACTACCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTCCTGCCCTCCGTTGCTGCTTTGTCCT  1576

Query 1703  CAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCC  1776
            |||..|..||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1577  CAGCTGCTACTATGGAGCGCAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGCCCTGATGAGCTGGACTCCCTCTTCTCT  1650

Query 1777  TACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGA  1850
            |||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1651  TACTTTGATGCAGGGGCTGCTGGGGCTGGTCCACGCAGTCTAAGCAGTGACAGTGGTCTAGGAGGCAGCTCTGA  1724

Query 1851  TGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGT  1924
            ||||||.||.||.||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1725  TGGCAGTTCAGATGTTCTTGCCTTCGGCACAGGCTCAGTGGTGGACAGTGTCACCGAGGAAGAGGGTGCCGAGT  1798

Query 1925  CGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTG  1998
            |.||||||||||||.||||||..||.||      .||.||.|||||||||.||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1799  CCGAGGAGTCCAGCAGTGAGGTCGATGG------AGAAGCAGAGGCCTGGAGCTTGGCAGATGTGCGTGAGCTG  1866

Query 1999  CACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGG  2072
            ||.||.|||||..||||.||.|..|||||.|||.||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1867  CATCCTGGGCTGCTGGCACATCAGGCAGCTCGTACCCGTGACCTCCCAGCACTGGCTGCAGCGCTGGCCCATGG  1940

Query 2073  GGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCT  2146
            .||.||.|||||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||..||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1941  AGCTGAAGTCAACTGGGCCGATGCAGCAGATGAGGGCAAGACCCCATTGGTGCAGGCTGTACTAGGGGGTTCCT  2014

Query 2147  TGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTG  2220
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||
Sbjct 2015  TGATTGTCTGTGAGTTCCTTCTGCAAAACGGAGCTGATGTGAACCAAAGAGACAGCCTTGGCCGGGCCCCCTTG  2088

Query 2221  CACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCT  2294
            |||||.||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2089  CACCATGCTACACTCTTGGGCCGTACCGGCCAGGTCTGTCTGTTCCTGAAGCGGGGGGCTGACCAGCATGCCCT  2162

Query 2295  GGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTC  2368
            ||||||.|||||.|.||||||..||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||.||||.||.|
Sbjct 2163  GGACCAGGAGCAACAGGACCCACTGACCATCGCAGTTCAAGCAGCGAATGCTGACATTGTCACATTGCTTCGCC  2236

Query 2369  TGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGC---  2439
            ||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.|||||..|||||||||..|||||..|||||.||||||||   
Sbjct 2237  TGGCCCGCATGGCTGAGGAGATGAGAGAAGCTGAGGCGCCCCCTGGTCAGCCGGGACCCCTGCCGGGCAGCAGT  2310

Query 2440  CCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC  2502
            ||.||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||
Sbjct 2311  CCTACAGAGCTGCAGTACCGCAGGTGCATCCAGGAGTTCATTGGCCTCCACCTGGAGGAAAGC  2373