Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09438
• Subject: XM_011540608.2
• Aligned Length: 2532
• Identities: 2405
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74

Query   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148

Query  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222

Query  223  TC------------------------------GGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGT  266
            ||                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCGGTGAGGGGCCGACTGACCTCTGACCTCAAGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGT  296

Query  267  GAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGG  340
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACTACCACATGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGG  370

Query  341  ATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGG  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGG  444

Query  415  AACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTG  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTG  518

Query  489  CTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGG  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGG  592

Query  563  ACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGAC  636
            |||||                                                                     
Sbjct  593  ACTCT---------------------------------------------------------------------  597

Query  637  CCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGA  710
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  ---------------------------CTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGA  644

Query  711  GCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTG  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  GCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTG  718

Query  785  ACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  ACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGG  792

Query  859  AACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGT  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  AACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGT  866

Query  933  GGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGT  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  GGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGT  940

Query 1007  CACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCC  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  CACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCC  1014

Query 1081  AGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTC  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  AGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTC  1088

Query 1155  CACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGC  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  CACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGC  1162

Query 1229  AGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGC  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGC  1236

Query 1303  GTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGAC  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  GTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGAC  1310

Query 1377  GCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATG  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  GCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATG  1384

Query 1451  AGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATC  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  AGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATC  1458

Query 1525  AAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTG  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  AAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTG  1532

Query 1599  GAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGC  1672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  GAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGC  1606

Query 1673  CCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTC  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  CCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTC  1680

Query 1747  TGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAG  1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681  TGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAG  1754

Query 1821  TAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGG  1894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755  TAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGG  1828

Query 1895  ACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAG  1968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829  ACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAG  1902

Query 1969  GCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCT  2042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903  GCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCT  1976

Query 2043  TCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGC  2116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977  TCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGC  2050

Query 2117  CGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAAC  2190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051  CGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAAC  2124

Query 2191  CAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTT  2264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125  CAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTT  2198

Query 2265  CCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGG  2338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199  CCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGG  2272

Query 2339  CCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCT  2412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273  CCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCT  2346

Query 2413  GGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCT  2486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347  GGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCT  2420

Query 2487  CCACCTGGAAGAGAGC  2502
            ||||||||||||||||
Sbjct 2421  CCACCTGGAAGAGAGC  2436