Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09448
• Subject: NM_054111.5
• Aligned Length: 1230
• Identities: 1228
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGATGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT  74
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGACGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT  74

Query   75  CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT  148

Query  149  TCTATGAATCCCTGCCACTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTATGAATCCCTGCCGCTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG  222

Query  223  AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC  296

Query  297  AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCCAGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCCAGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTTG  370

Query  371  CCCAGTGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAGCCCGGCCAAGGCTCTTCTGAGGTCCGAGCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCAGTGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAGCCCGGCCAAGGCTCTTCTGAGGTCCGAGCCC  444

Query  445  CACCTCAACACTCCAGCCTTCTCGCTGGTGGAAGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGAGGAAGAGCTTCAACCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACCTCAACACTCCAGCCTTCTCGCTGGTGGAAGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGAGGAAGAGCTTCAACCC  518

Query  519  GTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGACCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAGAACAAGCGGCATCGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGACCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAGAACAAGCGGCATCGGT  592

Query  593  TCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAAGATGGGGACCCGGCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAAGATGGGGACCCGGCAG  666

Query  667  CACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGAGCACCTCAGCCTGCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGAGCACCTCAGCCTGCCT  740

Query  741  GGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGCAAAGACAAGTACTATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGCAAAGACAAGTACTATG  814

Query  815  GAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGGAAGCCACCTCCGGAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGGAAGCCACCTCCGGAGG  888

Query  889  GAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCCAGAGTTCATACCGCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCCAGAGTTCATACCGCTT  962

Query  963  CTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCAGGCAGCCCGCATCCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCAGGCAGCCCGCATCCTC  1036

Query 1037  ACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACATCCGCATGATTGACTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACATCCGCATGATTGACTTT  1110

Query 1111  GCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACCCTGGCTATATTTTTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACCCTGGCTATATTTTTGG  1184

Query 1185  CCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  1230