Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09448
- Subject:
- XM_024446326.1
- Aligned Length:
- 1246
- Identities:
- 862
- Gaps:
- 371
Alignment
Query 1 ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGATGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCTATGAATCCCTGCCACTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCC-AGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTT 369
|||.|| |||| ||.| ||.||.|.| .||| ||||...|.
Sbjct 1 ---------------------ATGTCA----CTCCTAGAA-------GGGAGGATT----ACGA-TGCATTTTA 37
Query 370 GCCCAG----TGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAG-----------CCCGGCCAAGGCTCT 428
.||||| || ||||.||| |.|||| |||||||||||||||
Sbjct 38 TCCCAGAAGTTG-----ATGCACAG-----------------GCAGAGTTGTCTACTGACCCGGCCAAGGCTCT 89
Query 429 TCTGAGGTCCGAGCCCCACCTCAACACTCCAGCCTTCTCGCTGGTGGAAGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGA 502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 TCTGAGGTCCGAGCCCCACCTCAACACTCCAGCCTTCTCGCTGGTGGAAGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGA 163
Query 503 GGAAGAGCTTCAACCCGTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGACCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAG 576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 GGAAGAGCTTCAACCCGTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGACCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAG 237
Query 577 AACAAGCGGCATCGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 AACAAGCGGCATCGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAA 311
Query 651 GATGGGGACCCGGCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGA 724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 GATGGGGACCCGGCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGA 385
Query 725 GCACCTCAGCCTGCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGC 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 GCACCTCAGCCTGCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGC 459
Query 799 AAAGACAAGTACTATGGAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGG 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 AAAGACAAGTACTATGGAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGG 533
Query 873 AAGCCACCTCCGGAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCC 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 AAGCCACCTCCGGAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCC 607
Query 947 AGAGTTCATACCGCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 AGAGTTCATACCGCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCA 681
Query 1021 GGCAGCCCGCATCCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACAT 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 GGCAGCCCGCATCCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACAT 755
Query 1095 CCGCATGATTGACTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACC 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 CCGCATGATTGACTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACC 829
Query 1169 CTGGCTATATTTTTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 CTGGCTATATTTTTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA 891