Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09464
• Subject: XM_017017174.1
• Aligned Length: 1512
• Identities: 1216
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  ATGGAAGCGGCGTCGTCGCCGGCGGCTGCCGGGGCGGCGAGGCGCGAGGAGCTAGATATGGATGTAATGAGGCC  74
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGCGGCGGCGACGCCGGCGGCTGCCGGGGCGGCGAGGCGCGAGGAGCTAGATATGGATGTAATGAGGCC  74

Query   75  CTTGATAAATGAGCAGAATTTTGATGGGACATCAGATGAAGAACATGAGCAAGAGCTTCTGCCTGTTCAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTGATAAATGAGCAGAATTTTGATGGGACATCAGATGAAGAACATGAGCAAGAGCTTCTGCCTGTTCAGAAGC  148

Query  149  ATTACCAACTTGATGATCAAGAGGGCATTTCATTTGTACAAACTCTTATGCACCTTCTTAAAGGAAATATTGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTACCAACTTGATGATCAAGAGGGCATTTCATTTGTACAAACTCTTATGCACCTTCTTAAAGGAAATATTGGA  222

Query  223  ACTGGCCTTTTAGGACTTCCATTGGCAATAAAAAATGCAGGCATAGTGCTTGGACCAATCAGCCTTGTGTTTAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGGCCTTTTAGGACTTCCATTGGCAATAAAAAATGCAGGCATAGTGCTTGGACCAATCAGCCTTGTGTTTAT  296

Query  297  AGGAATTATTTCTGTTCACTGTATGCACATATTGGTACGTTGCAGTCACTTTCTATGTCTGAGGTTTAAAAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGAATTATTTCTGTTCACTGTATGCACATATTGGTACGTTGCAGTCACTTTCTATGTCTGAGGTTTAAAAAGT  370

Query  371  CAACATTAGGTTATAGTGACACTGTGAGCTTTGCTATGGAAGTGAGTCCTTGGAGTTGTCTTCAGAAGCAAGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAACATTAGGTTATAGTGACACTGTGAGCTTTGCTATGGAAGTGAGTCCTTGGAGTTGTCTTCAGAAGCAAGCA  444

Query  445  GCATGGGGGCGGAGTGTGGTTGACTTTTTTCTGGTGATAACACAGCTGGGATTCTGTAGTGTTTATATTGTCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCATGGGGGCGGAGTGTGGTTGACTTTTTTCTGGTGATAACACAGCTGGGATTCTGTAGTGTTTATATTGTCTT  518

Query  519  CTTAGCTGAAAATGTGAAACAAGTTCATGAAGGATTCCTGGAGAGTAAAGTGTTTATTTCAAATAGTACCAATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTAGCTGAAAATGTGAAACAAGTTCATGAAGGATTCCTGGAGAGTAAAGTGTTTATTTCAAATAGTACCAATT  592

Query  593  CATCAAACCCTTGTGAGAGAAGAAGTGTTGACATAAGGATATATATGCTTTGCTTTCTTCCATTTATAATTCTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATCAAACCCTTGTGAGAGAAGAAGTGTTGACCTAAGGATATATATGCTTTGCTTTCTTCCATTTATAATTCTT  666

Query  667  TTGGTCTTCATTCGTGAACTAAAGAATCTATTTGTACTTTCATTCCTTGCCAACGTTTCCATGGCTGTCAGTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGGTCTTCATTCGTGAACTAAAGAATCTATTTGTACTTTCATTCCTTGCCAACGTTTCCATGGCTGTCAGTCT  740

Query  741  TGTGATAATTTACCAGTATGTTGTCAGGAACATGCCAGATCCCCACAACCTTCCAATAGTGGCTGGTTGGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGATAATTTACCAGTATGTTGTCAGGAACATGCCAGATCCCCACAACCTTCCAATAGTGGCTGGTTGGAAGA  814

Query  815  AATACCCACTCTTTTTTGGTACTGCTGTATTTGCTTTTGAAGGCATAGGAGTGGTCCTTCCACTGGAAAACCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATACCCACTCTTTTTTGGTACTGCTGTATTTGCTTTTGAAGGCATAGGAGTGGTCCTTCCACTGGAAAACCAA  888

Query  889  ATGAAAGAATCAAAGCGTTTCCCTCAAGCGTTGAATATTGGCATGGGGATTGTTACAACTTTGTATGTAACATT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGAAAGAATCAAAGCGTTTCCCTCAAGCGTTGAATATTGGCATGGGGATTGTTACAACTTTGTATGTAACATT  962

Query  963  AGCTACTTTAGGATATATGTGTTTCCATGATGAAATCAAAGGCAGCATAACTTTAAATCTTCCCCAAGATGTAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTACTTTAGGATATATGTGTTTCCATGATGAAATCAAAGGCAGCATAACTTTAAATCTTCCCCAAGATGTAT  1036

Query 1037  GGTTATATCAATCAGTGAAAATTCTATATTCGTTTGGCATTTTTGTGACATATTCAATTCAGTTCTATGTTCCA  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTTATATCAATCAGTGAAAATTCTATATTCCTTTGGCATTTTTGTGACATATTCAATTCAGTTCTATGTTCCA  1110

Query 1111  GCAGAGATCATTATCCATGGGATCACATCCAAATTTCATACTAAATGGAAGCAAATCTGTGAATTTGGGATAAG  1184
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGAGATCATTATCCCTGGGATCACATCCAAATTTCATACTAAATGGAAGCAAATCTGTGAATTTGGGATAAG  1184

Query 1185  ATCCTTCTTGGTTAGTATTACTTGTGCCGGAGCAATTCTTATTCCTCGTTTAGACATTGTGATTTCCTTCGTTG  1258
            ||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct 1185  ATCCTTCTTG-------------GTGCCGGAGCAATTCTTATTCCTCGTT------------------------  1221

Query 1259  GAGCTGTGAGCAGCAGCACATTGGCCATAATCCTGCCACCTTTGGTTGAAATTCTTACATTTTCGAAGGAACAT  1332
                                                                                      
Sbjct 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221

Query 1333  TATAATATATGGATGGTCCTGAAAAATATTTCTATAGCATTCACTGGAGTTGTTGGCTTCTTATTAGGTACATA  1406
                                                                                      
Sbjct 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221

Query 1407  TATAACTGTTGAAGAAATTATTTATCCTACTCCCAAAGTTGTAGCTGGCACTCCACAGAGTCCTTTTCTAAATT  1480
                                                                                      
Sbjct 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221

Query 1481  TGAATTCAACATGCTTAACATCTGGTTTGAAA  1512
                                            
Sbjct 1222  --------------------------------  1221