Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09477
• Subject: NM_001172071.1
• Aligned Length: 702
• Identities: 575
• Gaps: 66

Alignment

Query   1  ---------------------------------------ATGGACCCCGTAGTCTTGAGTTACATGGACAGTCT  35
                                                  ||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct   1  ATGCTTCTGGAATTTCTGAGAATCCCTGCTCAATACAAGATGGACCCTGTGGTCTTGAGTTATATGGACAGTCT  74

Query  36  ACTGCGGCAATCAGATGTCTCACTATTGGATCCGCCAAGCTGGCTCAATGACCATATTATTGGGTTTGCGTTTG  109
           |.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  75  ATTGCGGCAATCAGATGTCTCACTATTGGACCCTCCAAGCTGGCTCAACGACCACATTATTGGGTTTGCCTTTG  148

Query 110  AGTACTTTGCCAACAGTCAGTTTCATGACTGCTCTGATCACGTCAGTTTCATCAGCCCTGAAGTCACCCAGTTC  183
           |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AATACTTTGCCAATAGTCAGTTTCATGACTGCTCAGACCATGTCTGTTTCATCAGCCCTGAAGTCACCCAGTTC  222

Query 184  ATCAAGTGCACTAGCAACCCAGCAGAGATTGCCATGTTCCTTGAACCACTGGACCTCCCCAACAAGAGAGTTGT  257
           ||.||||||||.||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||.||
Sbjct 223  ATTAAGTGCACCAGCAGCCCTGCAGAAATTGCCATGTTCCTTGAACCCCTGGATCTTCCCCACAAAAGAGTGGT  296

Query 258  ATTTTTAGCCATCAATGATAACTCCAACCAGGCAGCTGGAGGAACCCACTGGAGTTTATTGGTCTACCTCCAAG  331
           |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 297  ATTTTTAGCCATCAATGATAATTCTAACCAGGCAGCCGGAGGTACCCACTGGAGTTTGTTGGTTTATCTCCAAG  370

Query 332  ATAAAAATAGCTTTTTTCATTATGATTCCCATAGCAGGAGCAACTCAGTTCACGCAAAGCAGGTAGCAGAGAAA  405
           |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATAAAAATAGCTTCTTTCATTATGATTCCCATAGCAGGAGCAACTCAATCCATGCAAAGCAGGTAGCAGAGAAA  444

Query 406  CTGGAGGCTTTCTTAGGCAGAAAAGGAGACAAACTGGCCTTTGTGGAAGAGAAAGCCCCTGCCCAACAAAACAG  479
           |||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||
Sbjct 445  CTGAAGGCTTTCTTAGGCAGCAAAGGAGACAAACTGGTCTTTGTGGAAGAGAAAGCCCCAGCTCAAGAGAACAG  518

Query 480  CTATGACTGTGGGATGTACGTGATATGTAACACTGAGGCCTTGTGTCAGAACTTCTTTAGGCAACAGACAGAAT  553
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||...|||||||.|..|||.||||.|
Sbjct 519  CTATGACTGTGGGATGTACGTGATATGTAACACCGAGGCCTTGTGTCAGAGTCTCTTTAGACGGCAGCCAGAGT  592

Query 554  CACTGCTGCAGCTACTCACCCCTGCATACATCACAAAGAAGAGGGGAGAATGGAAAGATCTCATTGCCACACTT  627
           |.|.||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct 593  CCCCGCTGCAGCTACTCACCCCGACATACATCACAAAGAAGAGAGGAGAATGGAAAGATCTAATTGCCAGACTT  666

Query 628  GCTAAAAAG---------------------------  636
           ||||||||.                           
Sbjct 667  GCTAAAAAAAACGAAGTAGCTACTGAAGAATGCTCG  702