Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09490
• Subject: XM_017024190.1
• Aligned Length: 1383
• Identities: 1361
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ---------------------ATGGCAGAGTTCTCCCAGAAACGGGGGAAGCGGCGTAGCGACGAAGGGCTGGG  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCATCTTACAGGCAGACCATGGCAGAGTTCTCCCAGAAACGGGGGAAGCGGCGTAGCGACGAAGGGCTGGG  74

Query   54  CAGCATGGTGGACTTCCTCCTGGCCAATGCCCGCCTGGTGCTGGGCGTGGGCGGGGCTGCTGTGCTGGGCATTG  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCATGGTGGACTTCCTCCTGGCCAATGCCCGCCTGGTGCTGGGCGTGGGCGGGGCTGCTGTGCTGGGCATTG  148

Query  128  CCACCCTGGCCGTGAAGCGGTTCATTGACAGGGCCACTAGCCCGCGGGATGAGGATGACACCAAGGCAGACAGC  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCACCCTGGCCGTGAAGCGGTTCATTGACAGGGCCACTAGCCCGCGGGATGAGGATGACACCAAGGCAGACAGC  222

Query  202  TGGAAGGAACTGAGCCTGCTCAAGGCCACACCACACCTGCAGCCCCGGCCTCCACCTGCTGCCCTTAGCCAGCC  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGAAGGAACTGAGCCTGCTCAAGGCCACACCACACCTGCAGCCCCGGCCTCCACCTGCTGCCCTTAGCCAGCC  296

Query  276  AGTGTTGCCCTTGGCCCCCTCGTCGTCTGCCCCAGAAGGGCCTGCAGAAACTGATCCTGAGGTGACACCACAGC  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTGTTGCCCTTGGCCCCCTCGTCGTCTGCCCCAGAAGGGCCTGCAGAAACTGATCCTGAGGTGACACCACAGC  370

Query  350  TCAGCTCCCCAGCACCGCTGTGTCTGACACTGCAGGAGAGGCTGCTGGCCTTCGAGCGGGACCGTGTGACCATC  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGCTCCCCAGCACCGCTGTGTCTGACACTGCAGGAGAGGCTGCTGGCCTTCGAGCGGGACCGTGTGACCATC  444

Query  424  CCAGCAGCCCAGGTGGCTTTGGCCAAACAGCTGGCTGGCGACATCGCCCTGGAGCTGCAGGCCTACTTTCGGAG  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGCAGCCCAGGTGGCTTTGGCCAAACAGCTGGCTGGCGACATCGCCCTGGAGCTGCAGGCCTACTTTCGGAG  518

Query  498  CAAGTTCCCGGAACTGCCCTTTGGGGCATTCGTGCCTGGGGGGCCGCTCTACGACGGGCTGCAGGCGGGGGCTG  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGTTCCCGGAACTGCCCTTTGGGGCATTCGTGCCTGGGGGGCCGCTCTACGACGGGCTGCAGGCGGGGGCTG  592

Query  572  CGGACCATGTGCGTCTCCTGGTGCCACTGGTGCTGGAGCCGGGCCTGTGGAGCCTGGTGCCGGGCGTGGACACT  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGACCATGTGCGTCTCCTGGTGCCACTGGTGCTGGAGCCGGGCCTGTGGAGCCTGGTGCCGGGCGTGGACACT  666

Query  646  GTGGCGAGGGACCCTCGCTGCTGGGCCGTGCGCAGGACGCAGCTTGAGTTCTGCCCCCGTGGGAGCAGCCCCTG  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGCGAGGGACCCTCGCTGCTGGGCCGTGCGCAGGACGCAGCTTGAGTTCTGCCCCCGTGGGAGCAGCCCCTG  740

Query  720  GGACCGCTTCCTGGTCGGGGGCTACCTCTCCTCCCGCGTCCTGCTGGAGCTACTCCGCAAGGCGCTGGCTGCCT  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  GGACCGCTTCCTGGTCGGGGGCTACCTCTCCTCCCGCGTCCTGCTGGAGCTACTCCGCAAGGCGCTGGCTGCTT  814

Query  794  CTGTCAACTGGCCGGCCATTGGCAGCCTTCTCGGGTGCCTGATCCGGCCCAGCATGGCCTCGGAGGAGCTGCTG  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGTCAACTGGCCGGCCATTGGCAGCCTTCTCGGGTGCCTGATCCGGCCCAGCATGGCCTCGGAGGAGCTGCTG  888

Query  868  CTCGAGGTGCAGCACGAACGCCTGGAGCTCACTGTGGCTGTGCTTGTGGCAGTCCCTGGGGTCGATGCTGACGA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCGAGGTGCAGCACGAACGCCTGGAGCTCACTGTGGCTGTGCTTGTGGCAGTCCCTGGGGTCGATGCTGACGA  962

Query  942  CCGCCTCCTCTTGGCCTGGCCCCTGGAGGGGCTGGCGGGGAACCTCTGGCTGCAGGACCTGTATCCAGTGGAGG  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGCCTCCTCTTGGCCTGGCCCCTGGAGGGGCTGGCGGGGAACCTCTGGCTGCAGGACCTGTATCCAGTGGAGG  1036

Query 1016  CTGCTAGGCTGCGAGCCCTGGACGACCATGACGCTGGGACTCGCCGGCGGCTGCTGCTGCTGCTGTGTGCTGTC  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGCTAGGCTGCGAGCCCTGGACGACCATGACGCTGGGACTCGCCGGCGGCTGCTGCTGCTGCTGTGTGCTGTC  1110

Query 1090  TGCCGTGGTTGCTCGGCTCTGGGGCAGCTAGGCCGGGGTCACCTGACCCAGGTGGTCCTGCGTCTGGGGGAGGA  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCCGTGGTTGCTCGGCTCTGGGGCAGCTAGGCCGGGGTCACCTGACCCAGGTGGTCCTGCGTCTGGGGGAGGA  1184

Query 1164  CAACGTGGATTGGACGGAGGAGGCCTTGGGTGAGCGCTTCCTGCAAGCCCTGGAGCTGCTCATCGGCAGCCTGG  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAACGTGGATTGGACGGAGGAGGCCTTGGGTGAGCGCTTCCTGCAAGCCCTGGAGCTGCTCATCGGCAGCCTGG  1258

Query 1238  AGCAGGCCAGCCTGCCCTGCCACTTCAACCCCAGCGTGAACCTCTTCAGCAGCTTGCGTGAGGAGGAGATTGAC  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCAGGCCAGCCTGCCCTGCCACTTCAACCCCAGCGTGAACCTCTTCAGCAGCTTGCGTGAGGAGGAGATTGAC  1332

Query 1312  GACATTGGCTATGCGCTATACAGTGGCCTACAGGAGCCCGAGGGGCTGCTC  1362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACATTGGCTATGCGCTATACAGTGGCCTACAGGAGCCCGAGGGGCTGCTC  1383