Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09520
• Subject: XM_011529868.3
• Aligned Length: 1397
• Identities: 1292
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT  74

Query   75  CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC  148

Query  149  AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA  222

Query  223  ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA  296

Query  297  CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGGTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC  370
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGCTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC  370

Query  371  GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG  444

Query  445  CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC  518

Query  519  TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAG-------  585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  519  TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAGGGGCTGC  592

Query  586  --------------------------------------------GACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG  615
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGGAGCCATAGAGAGTGTGAGGGTCCCGCTGCTTCCCCGAAATGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG  666

Query  616  CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC  740

Query  690  CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC  814

Query  764  CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG  888

Query  838  TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT  962

Query  912  GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG  1036

Query  986  GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC  1110

Query 1060  TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGG---------GGGA  1124
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ...|
Sbjct 1111  TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGGCTCCTAGCTTACA  1184

Query 1125  GGGGT---TGCACCAGCTACGCGAGGCT---TTGAAGATTTTAGCTGAGA-GGGTTTTAATCTTGGAAACAATG  1191
            |.|.|   ||||.||||      |||||   .||.||.|..|.|| .||| ||||.....||.|||||.|.||.
Sbjct 1185  GAGCTTCCTGCAGCAGC------AGGCTCAGCTGGAGCTCCTGGC-CAGACGGGTCACCCTCCTGGAAGCCATC  1251

Query 1192  AT-TGGGCTCTATGAGCCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG  1264
            || |||.|    .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  ATCTGGCC----AGAACCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG  1321

Query 1265  GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC  1386