Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09520
- Subject:
- XM_011529874.2
- Aligned Length:
- 1397
- Identities:
- 1097
- Gaps:
- 274
Alignment
Query 1 ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA 222
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------ATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA 27
Query 223 ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA 101
Query 297 CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGGTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC 370
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGCTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC 175
Query 371 GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG 249
Query 445 CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC 323
Query 519 TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAG------- 585
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAGGGGCTGC 397
Query 586 --------------------------------------------GACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG 615
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 CAGGAGCCATAGAGAGTGTGAGGGTCCCGCTGCTTCCCCGAAATGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG 471
Query 616 CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC 545
Query 690 CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC 619
Query 764 CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG 693
Query 838 TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT 767
Query 912 GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG 841
Query 986 GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC 915
Query 1060 TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGG---------GGGA 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ...|
Sbjct 916 TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGGCTCCTAGCTTACA 989
Query 1125 GGGGT---TGCACCAGCTACGCGAGGCT---TTGAAGATTTTAGCTGAGA-GGGTTTTAATCTTGGAAACAATG 1191
|.|.| ||||.|||| ||||| .||.||.|..|.|| .||| ||||.....||.|||||.|.||.
Sbjct 990 GAGCTTCCTGCAGCAGC------AGGCTCAGCTGGAGCTCCTGGC-CAGACGGGTCACCCTCCTGGAAGCCATC 1056
Query 1192 AT-TGGGCTCTATGAGCCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG 1264
|| |||.| .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 ATCTGGCC----AGAACCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG 1126
Query 1265 GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC 1329
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC 1191