Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09520
- Subject:
- XM_011529876.1
- Aligned Length:
- 1364
- Identities:
- 776
- Gaps:
- 550
Alignment
Query 1 ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGGTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC 518
.|||||.||.||..|..||||| ||||||| |||||
Sbjct 1 ------ATGCTGCAGTCCCTGGAGACCA---------------AGCAGCC-------------CCAGC------ 34
Query 519 TGAGGACCCTGCCCCGCTCTG--GGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGA-TG-GAG---------GC 579
.|||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||...|||| || ||| ||
Sbjct 35 ---AGACCCTGC------CTGGAGGG--------CTG-CCAGG--AGCCATAGAGAGTGTGAGGGTCCCGCTGC 88
Query 580 CTCC-----AGGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGGCCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGG 648
.||| |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 89 TTCCCCGAAATGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGGCCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGG 162
Query 649 GGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCCCCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGG 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 GGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCCCCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGG 236
Query 723 CACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTCCTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGC 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 CACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTCCTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGC 310
Query 797 CACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTGTCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 CACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTGTCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGG 384
Query 871 CCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCATGGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGT 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 CCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCATGGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGT 458
Query 945 CCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTGGACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGA 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 CCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTGGACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGA 532
Query 1019 AGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGCTCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAG 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 AGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGCTCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAG 606
Query 1093 GGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGG---------GGGAGGGGT---TGCACCAGCTACGCGAGGCT---TT 1151
|||||||||||||||||||||||||||| ...||.|.| ||||.|||| ||||| .|
Sbjct 607 GGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGGCTCCTAGCTTACAGAGCTTCCTGCAGCAGC------AGGCTCAGCT 674
Query 1152 GAAGATTTTAGCTGAGA-GGGTTTTAATCTTGGAAACAATGAT-TGGGCTCTATGAGCCAGAGCTGGGGTCTGG 1223
|.||.|..|.|| .||| ||||.....||.|||||.|.||.|| |||.| .||.|||||||||||||||||
Sbjct 675 GGAGCTCCTGGC-CAGACGGGTCACCCTCCTGGAAGCCATCATCTGGCC----AGAACCAGAGCTGGGGTCTGG 743
Query 1224 GGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGGGCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGA 1297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 GGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGGGCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGA 817
Query 1298 TCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 TCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC 849