Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09586
- Subject:
- NM_133346.2
- Aligned Length:
- 1268
- Identities:
- 1047
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 ATGCCGTTCCTGCACGGCTTCCGGAGGATCATCTTCGAGTACCAGCCGCTGGTGGATGCGATTCTGGGCTCCCT 74
|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||.||||
Sbjct 1 ATGCCGTTCTTGCACGGCTTCCGCAGGATCATCTTTGAGTACCAGCCCCTAGTGGACGCCATCCTTGGCGCCCT 74
Query 75 GGGGATCCAGGACCCCGAGCGGCAGGAGTCTCTGGACCGGCCCAG-TTATGTCGCCAGCGAGGAGAGCCGAATC 147
|||.||||||||.|..||||||||||||.|.||||| .| ||.||...||||||||||||||||.|||
Sbjct 75 GGGCATCCAGGATCTGGAGCGGCAGGAGCCCCTGGA-------TGATTCTGCTTCCAGCGAGGAGAGCCGGATC 141
Query 148 CTTGTTCTCACTGAGCTGCTGGAGAGGAAAGCCCACTCTCCCTTTTACCAGGAAGGCGTCAGCAACGCCCTGCT 221
||.||.|||||.||||||||||||..|||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||..||||
Sbjct 142 CTGGTCCTCACGGAGCTGCTGGAGCAGAAGGCTCACTCTCCATTCTACCAGGAAGGCGTGAGCAATGCGTTGCT 215
Query 222 CAAGATGGCTGAGCTGGGGCTGACGCGGGCGGCCGACGTTCTCTTGCGGCATGGGGCCAATCTCAACTTTGAAG 295
.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|..||.||..|||.|..|||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 216 GAAGATGGCTGAGCTGGGCCTGACCCGGGCAGCTGCTGTCCTTCTGCAGAGTGGGGCCAACCTCAATTTCGAAG 289
Query 296 ACCCAGTCACCTACTACACGGCCTTGCACATCGCCGTCCTGCGGAACCAGCCGGACATGGTGGAGCTGCTGGTG 369
||||.||.|||||||||||.|||.|||||||.||.||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 290 ACCCTGTTACCTACTACACAGCCCTGCACATTGCTGTCCTGAGAAACCAGCCTGACATGGTTGAGCTGCTGGTG 363
Query 370 CATCACGGGGCCGACGTTAATCGGAGGGACCGGATCCACGAGAGTAGCCCCTTGGACCTGGCCAGCGAGGAGCC 443
|..||||||||.|||.|.||..||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 364 CGCCACGGGGCTGACATCAACAGGAGGGACCGGATCCATGAGAGCAGCCCCTTGGATCTGGCCAGCGAGGAACC 437
Query 444 TGAGCGCCTGCCCTGCCTGCAGCGCCTCCTGGACCTTGGAGCTGATGTCAATGCCGCTGACAAGCATGGAAAAA 517
.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||.||.|
Sbjct 438 CGAACGCCTGCCCTGCCTGCAGCGCCTCTTGGATCTTGGAGCAGATGTCAATGCAGCTGACAAGAATGGGAAGA 511
Query 518 CTGCTCTGCTCCATGCTCTGGCCAGCAGCGACGGGGTGCAGATCCACAATACTGAGAACATTCGTCTCTTACTG 591
|.|||.|.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.|||
Sbjct 512 CAGCTTTACTTCACGCCCTGGCCAGCAGCGATGGTGTGCAGATCCACAACACAGAAAACATCCGGCTCCTCCTG 585
Query 592 GAAGGAGGGGCAGACGTCAAGGCCACCACCAAAGATGGGGACACAGTGTTCACCTGCATCATCTTCCTGCTTGG 665
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 586 GAGGGAGGGGCAGACGTCAAGGCCACCACCAAGGATGGGGACACTGTATTCACCTGCATCATCTTCCTGCTCGG 659
Query 666 TGAGACCGTGGGAGGGGACAAAGAGGAGGCCCAGATGATCAACCGCTTCTGCTTCCAAGTCACACGGCTGCTGC 739
||||||.||..|.||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||..|||
Sbjct 660 TGAGACTGTCTGTGGGGACAAGGAGGAGGCCCCGATGATCAACCGCTTCTGCTTCCAAGTCACGCAGCTCTTGC 733
Query 740 TGGCACACGGGGCCGACCCCAGCGAGTGCCCAGCCCACGAGTCCCTCACCCACATCTGCCTGAAGAGCTTTAAA 813
||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 734 TGGCCCACGGTGCCGACCCCAGCGAGTGCCCGGCCCATGAGTCCCTCACGCACATCTGCCTCAAGAGCTTCAAG 807
Query 814 CTGCACTTCCCTCTCCTGCGCTTCCTCCTGGAGTCCGGAGCTGCCTACAACTGCTCCCTGCACGGTGCGTCCTG 887
|||||||||||.|||||..|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 808 CTGCACTTCCCGCTCCTCTGCTTCCTGCTGGAGTCCGGAGCCGCCTACAACTGCTCCCTGCACGGTGCATCCTG 881
Query 888 CTGGTCTGGCTTTCACATCATCTTTGAGAGGCTCTGTTCCCACCCAGGCTGCACGGAAGACGAGAGCCATGCGG 961
.|||||||||||..||.||.|.||||||||||||||.||.|||||.|||||..|.||.|||||.|||||....|
Sbjct 882 TTGGTCTGGCTTCAACCTCGTTTTTGAGAGGCTCTGCTCGCACCCGGGCTGTGCCGAGGACGACAGCCACATTG 955
Query 962 ACCTCCTGCGCAAAGCTGAGACTGTCCTGGATCTCATGGTGACCAACTCTCAGAAACTCCAGCTGCCCGAAAAC 1035
|.||.||||..||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||.|||.||||..||.||||||||.||.|||
Sbjct 956 AGCTTCTGCATAAGGCTGAGACCGTGCTGGACCTCATGGTGACCAGCTCCCAGAGGCTGCAGCTGCCTGAGAAC 1029
Query 1036 TTCGATATCCACCCTGTGGGCAGCCTGGCGGAAAAGATCCAGGCCCTCCACTTCTCCTTGAGGCAGCTGGAGAG 1109
.||.|.||||||||.|||||.||||||||.|..||||||||||||||.||...||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1030 CTCAACATCCACCCAGTGGGTAGCCTGGCAGGGAAGATCCAGGCCCTTCATGCCTCCCTGAGGCAGCTCGAGAG 1103
Query 1110 CTATCCCCCGCCCCTCAAGCACCTGTGCCGTGTGGCCATCCGGCTCTACCTTCAGCCGTGGCCTGTGGATGTGA 1183
|||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|.|||.|..||||||||||||||....|
Sbjct 1104 CTACCCGCCACCTCTCAAACACCTGTGCCGGGTGTCCATCCGGCTGTGCCTGCGACCGTGGCCTGTGGACACCA 1177
Query 1184 AGGTCAAAGCCCTGCCTCTGCCCGACAGGCTGAAGTGGTACCTCCTTAGCGAGCACAGTGGCTCCGTGGAAGAT 1257
||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||.||.|..|||||||...|| .|.
Sbjct 1178 AGGTCAAAGCACTGCCCTTGCCCGACAGGCTCAAGTGGTACCTGCTCAGTGCACACAGTGATACC------CAA 1245
Query 1258 GACATC---- 1263
|||| |
Sbjct 1246 GACA-CTTGC 1254