Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09619
• Subject: XM_017021030.2
• Aligned Length: 2322
• Identities: 2317
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAGAGGACCGATTGTATTGCACATTTGTCTGGCTTTCTGTAGCCTTCTGCTTTTCAGCGTTGCCACACAATG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGGACCGATTGTATTGCACATTTGTCTGGCTTTCTGTAGCCTTCTGCTTTTCAGCGTTGCCACACAATG  74

Query   75  TCTGGCCTTCCCCAAAATAGAAAGGAGGAGGGAGATAGCACATGTTCATGCGGAAAAAGGGCAGTCCGATAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGGCCTTCCCCAAAATAGAAAGGAGGAGGGAGATAGCACATGTTCATGCGGAAAAAGGGCAGTCCGATAAGA  148

Query  149  TGAACACCGATGACCTAGAAAATAGCTCTGTTACCTCAAAGCAGACTCCCCAACTGGTGGTCTCTGAAGATCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAACACCGATGACCTAGAAAATAGCTCTGTTACCTCAAAGCAGACTCCCCAACTGGTGGTCTCTGAAGATCCA  222

Query  223  ATGATGATGTCAGCAGTACCATCGGCAACATCATTAAATAAAGCATTCTCGATTAACAAAGAAATCCAGCCTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  223  ATGATGATGTCAGCAGTACCATCGGCAACATCATTAAATAAAGCATTCTCGATTAACAAAGAAACCCAGCCTGG  296

Query  297  ACAAGCTGGGCTCATGCAAACAGAACGCCCTGGTGTTTCCACACCTACTGAGTCAGGTGTCCCCTCAGCTGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAAGCTGGGCTCATGCAAACAGAACGCCCTGGTGTTTCCACACCTACTGAGTCAGGTGTCCCCTCAGCTGAAG  370

Query  371  AAGTATTTGGTTCCAGCCAGCCAGAGAGAATATCTCCTGAAAGTGGACTTGCCAAGGCCATGTTAACCATTGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTATTTGGTTCCAGCCAGCCAGAGAGAATATCTCCTGAAAGTGGACTTGCCAAGGCCATGTTAACCATTGCT  444

Query  445  ATCACTGCGACTCCTTCTCTGACTGTTGATGAAAAGGAGGAACTCCTTACAAGCACTAACTTTCAGCCCATTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCACTGCGACTCCTTCTCTGACTGTTGATGAAAAGGAGGAACTCCTTACAAGCACTAACTTTCAGCCCATTGT  518

Query  519  AGAAGAGATCACAGAAACCACAAAAGGTTTTCTGAAGTATATGGATAATCAATCATTTGCAACTGAAAGTCAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGAGATCACAGAAACCACAAAAGGTTTTCTGAAGTATATGGATAATCAATCATTTGCAACTGAAAGTCAGG  592

Query  593  AAGGAGTTGGTTTGGGACATTCACCTTCATCCTATGTGAATACTAAGGAAATGCTAACCACCAATCCAAAGACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGGAGTTGGTTTGGGACATTCACCTTCATCCTATGTGAATACTAAGGAAATGCTAACCACCAATCCAAAGACT  666

Query  667  GAGAAATTTGAAGCAGACACAGACCACAGGACAACTTCTTTTCCTGGTGCTGAGTCCACAGCAGGCAGTGAGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAAATTTGAAGCAGACACAGACCACAGGACAACTTCTTTTCCTGGTGCTGAGTCCACAGCAGGCAGTGAGCC  740

Query  741  TGGAAGCCTCACCCCTGATAAGGAGAAGCCTTCGCAGATGACAGCTGATAACACCCAGGCTGCTGCCACCAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGAAGCCTCACCCCTGATAAGGAGAAGCCTTCGCAGATGACAGCTGATAACACCCAGGCTGCTGCCACCAAGC  814

Query  815  AACCACTCGAAACTTCCGAGTACACCCTGAGTGTTGAGCCAGAAACTGATAGTCTGCTGGGAGCCCCAGAAGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACCACTCGAAACTTCCGAGTACACCCTGAGTGTTGAGCCAGAAACTGATAGTCTGCTGGGAGCCCCAGAAGTC  888

Query  889  ACAGTGAGTGTCAGCACAGCTGTTCCAGCTGCCTCTGCCTTAAGTGATGAGTGGGATGACACCAAATTAGAGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGTGAGTGTCAGCACAGCTGTTCCAGCTGCCTCTGCCTTAAGTGATGAGTGGGATGACACCAAATTAGAGAG  962

Query  963  TGTAAGCCGGATAAGGACCCCCAAGCTTGGAGACAATGAAGAGACTCAGGTGAGAACGGAGATGTCTCAGACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTAAGCCGGATAAGGACCCCCAAGCTTGGAGACAATGAAGAGACTCAGGTGAGAACGGAGATGTCTCAGACAG  1036

Query 1037  CACAAGTAAGCCATGAGGGTATGGAAGGAGGCCAGCCTTGGACAGAGGCTGCACAGGTGGCTCTGGGGCTGCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACAAGTAAGCCATGAGGGTATGGAAGGAGGCCAGCCTTGGACAGAGGCTGCACAGGTGGCTCTGGGGCTGCCT  1110

Query 1111  GAAGGGGAAACACACACGGGCACAGCCCTGCTAATAGCGCATGGGAATGAGAGATCACCTGCTTTCACTGATCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGGGGAAACACACACGGGCACAGCCCTGCTAATAGCGCATGGGAATGAGAGATCACCTGCTTTCACTGATCA  1184

Query 1185  AAGTTCCTTTACCCCCACAAGTCTGATGGAAGACATGAAAGTTTCCATTGTGAACTTGCTCCAAAGTACGGGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGTTCCTTTACCCCCACAAGTCTGATGGAAGACATGAAAGTTTCCATTGTGAACTTGCTCCAAAGTACGGGAG  1258

Query 1259  ACTTCACGGAATCCACCAAGGAAAACGATGCCCTGTTTTTCTTAGAAACCACTGTTTCTGTCTCTGTATATGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTTCACGGAATCCACCAAGGAAAACGATGCCCTGTTTTTCTTAGAAACCACTGTTTCTGTCTCTGTATATGAG  1332

Query 1333  TCTGAGGCAGACCAACTGTTGGGAAATACAATGAAAGACATCATCACTCAAGAGATGACAACAGCTGTTCAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTGAGGCAGACCAACTGTTGGGAAATACAATGAAAGACATCATCACTCAAGAGATGACAACAGCTGTTCAAGA  1406

Query 1407  GCCAGATGCCACTTTATCCATGGTGACACAAGAGCAGGTTGCTACCCTCGAGCTTATCAGAGACAGTGGCAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCAGATGCCACTTTATCCATGGTGACACAAGAGCAGGTTGCTACCCTCGAGCTTATCAGAGACAGTGGCAAGA  1480

Query 1481  CTGAGGAAGAAAAGGAGGACCCCTCTCCTGTGTCTGACGTTCCTGGTGTTACTCAGCTGTCAAGAAGATGGGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGAGGAAGAAAAGGAGGACCCCTCTCCTGTGTCTGACGTTCCTGGTGTTACTCAGCTGTCAAGAAGATGGGAG  1554

Query 1555  CCTCTGGCCACTACAATTTCAACTACAGTCGTCCCTTTGTCTTTTGAAGTTACTCCCACTGTGGAAGAACAAAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTCTGGCCACTACAATTTCAACTACAGTCGTCCCTTTGTCTTTTGAAGTTACTCCCACTGTGGAAGAACAAAT  1628

Query 1629  GGACACAGTCACAGGGCCAAATGAGGAGTTCACACCAGTTCTGGGATCTCCAGTGACACCTCCTGGAATAATGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGACACAGTCACAGGGCCAAATGAGGAGTTCACACCAGTTCTGGGATCTCCAGTGACACCTCCTGGAATAATGG  1702

Query 1703  TGGGGGAACCCAGCATTTCCCCTGCACTTCCTGCTTTGGAGGCATCCTCTGAGAGAAGAACTGTTGTTCCATCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGGGGAACCCAGCATTTCCCCTGCACTTCCTGCTTTGGAGGCATCCTCTGAGAGAAGAACTGTTGTTCCATCT  1776

Query 1777  ATTACTCGTGTTAATACAGCTGCCTCATATGGCCTGGACCAACTTGAATCTGAAGAGGGAGAAGAAGATGAGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1777  ATTACTCGTGTTAATACAGCTGCCTCATATGGCCTGGACCAACTTGAATCTGAAGAGGGACAAGAAGATGAGGA  1850

Query 1851  TGAAGAGGATGAAGAAGATGAAGATGAAGAAGAGGAAGATGAGGAAGAAGATGAGGAAGATAAAGATGCAGACT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAAGAGGATGAAGAAGATGAAGATGAAGAAGAGGAAGATGAGGAAGAAGATGAGGAAGATAAAGATGCAGACT  1924

Query 1925  CGCTGGATGAGGGCTTGGATGGTGACACTGAGCTGCCAGGTTTTACCCTCCCTGGTATCACATCCCAGGAACCA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGCTGGATGAGGGCTTGGATGGTGACACTGAGCTGCCAGGTTTTACCCTCCCTGGTATCACATCCCAGGAACCA  1998

Query 1999  GGCTTAGAGGAGGGAAACATGGACCTGTTGGAGGGAGCTACCTACCAGGTGCCAGATGCCCTCGAGTGGGAACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGCTTAGAGGAGGGAAACATGGACCTGTTGGAGGGAGCTACCTACCAGGTGCCAGATGCCCTCGAGTGGGAACA  2072

Query 2073  GCAGAATCAAGGCCTGGTGAGAAGCTGGATGGAAAAATTAAAAGACAAGGCTGGTTACATGTCTGGGATGCTGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCAGAATCAAGGCCTGGTGAGAAGCTGGATGGAAAAATTAAAAGACAAGGCTGGTTACATGTCTGGGATGCTGG  2146

Query 2147  TGCCTGTAGGGGTTGGGATAGCTGGAGCCTTGTTCATCTTGGGAGCCCTCTACAGCATTAAGGTTATGAATCGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCCTGTAGGGGTTGGGATAGCTGGAGCCTTGTTCATCTTGGGAGCCCTCTACAGCATTAAGGTTATGAATCGC  2220

Query 2221  CGAAGGAGAAATGGCTTCAAAAGGCATAAAAGAAAGCAGAGAGAATTCAACAGCATGCAAGATCGAGTAATGCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CGAAGGAGAAATGGCTTCAAAAGGCATAAAAGAA---AGAGAGAATTCAACAGCATGCAAGATCGAGTAATGCT  2291

Query 2295  CTTAGCCGACAGCTCTGAAGATGAATTT  2322
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  CTTAGCCGACAGCTCTGAAGATGAATTT  2319