Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09677
• Subject: NM_001113399.1
• Aligned Length: 1185
• Identities: 989
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGGAGTGGACTTCCCAGCAGAGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCGCACACCCAC  74

Query    1  ----ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGC  70
                ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct   75  CCTGATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGC  148

Query   71  TCTTTCCAAATTTTAACACAATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCC  144
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TCTTTCCAAACTTTAACACAATGGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCC  222

Query  145  CCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCA  218
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGAAGAAGAAACAAGTTATTTCCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCA  296

Query  219  CTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTT  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTT  370

Query  293  CCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAA  366
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAA  444

Query  367  GATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATC  440
            ||.|||||||||.|||||||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||
Sbjct  445  GACAAAGGGAAGATAAAAGCCACCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATC  518

Query  441  TGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTG  514
            ||||||||||||||||||||.||||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||
Sbjct  519  TGGCACAACACCCCTGCCACTTGGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTG  592

Query  515  TTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCA  588
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGAGTCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCA  666

Query  589  CAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAA  662
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCTGGAGGCTCACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAA  740

Query  663  ATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACAT  736
            .||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|
Sbjct  741  GTCCTATCCAAGACCTGGGTCAAGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGT  814

Query  737  TTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCAT  810
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  TTCATTGTGAGATCTGTGATGTTCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCAT  888

Query  811  AAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTAT  884
            |||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  889  AAAGACCGCGTGGCAGGAAAACCGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCAT  962

Query  885  TCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCG  958
            ..||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.||  
Sbjct  963  CTTAGCTGCAAAGCTTGCATTCCAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT--  1034

Query  959  CAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCC  1032
             .|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||
Sbjct 1035  -GGCGGCCGCAGCCGTGTCCTCTGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCC  1107

Query 1033  ATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTA  1106
            ||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1108  ATCCCTCCTGCGCTGCTGAGGCCTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTA  1181

Query 1107  C  1107
            |
Sbjct 1182  C  1182