Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09677
• Subject: NM_001352816.2
• Aligned Length: 1119
• Identities: 1048
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGATGCATCCTTCA---------CTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGG--ACAGTAGTTCTGCT  63
            ||| .|||.||..||         |.||    |.|.||             ||||..|  ||||.||       
Sbjct    1  ATG-GGCAGCCCCCACCACCCGCCCAGG----CCAGCC-------------CCAGCAGCAACAGCAG-------  49

Query   64  GTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACACA-ATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTAT  136
                                   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   50  -----------------------CACAGATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTAT  100

Query  137  CCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCC  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  CCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCC  174

Query  211  GAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAAT  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  GAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAAT  248

Query  285  GGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACA  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  GGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACA  322

Query  359  AATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATC  432
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  323  AATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTCTC  396

Query  433  CTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGG  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  CTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGG  470

Query  507  TACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACT  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  TACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACT  544

Query  581  CCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  CCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGT  618

Query  655  CCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  CCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAA  692

Query  729  CAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCC  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  CAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCC  766

Query  803  GAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGC  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  GAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGC  840

Query  877  CCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  CCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTC  914

Query  951  ACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGG  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  ACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGG  988

Query 1025  CTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTT  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  CTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTT  1062

Query 1099  GCTCCGTAC  1107
            |||||||||
Sbjct 1063  GCTCCGTAC  1071