Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09677
- Subject:
- XM_006499458.3
- Aligned Length:
- 1311
- Identities:
- 989
- Gaps:
- 207
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGGAGTGGACTTCCCAGCAGAGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCGCACACCCAC 74
Query 1 ----ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGC 70
||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 75 CCTGATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGC 148
Query 71 TCTTTCCAAATTTTAACACA------------------------------------------------------ 90
||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TCTTTCCAAACTTTAACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCTACGCATACA 222
Query 91 ------------------------------------------------------------------------AT 92
||
Sbjct 223 GGACTGAGGAAGAGACCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTTCTGCCAGAT 296
Query 93 GGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTT 166
|||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAAGTTATTT 370
Query 167 CTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCC 240
|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCC 444
Query 241 AAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAA 314
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAA 518
Query 315 TCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCA 388
|||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 519 TCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATAAAAGCCA 592
Query 389 GCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCT 462
.|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 593 CCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACTT 666
Query 463 GGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGC 536
|||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAGAAAAAGC 740
Query 537 CAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAG 610
||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 741 CAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCACAACACAG 814
Query 611 GATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCA 684
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 815 GATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACCTGGGTCA 888
Query 685 AGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGT 758
|||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 AGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCTGTGATGT 962
Query 759 TCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAAC 832
|||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 963 TCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCAGGAAAAC 1036
Query 833 CACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTC 906
|.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1037 CGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCTTGCATTC 1110
Query 907 CAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTC 980
|||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.|| .|||||.||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCGTGTCCTC 1181
Query 981 AGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGC 1054
.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1182 TGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTGCTGAGGC 1255
Query 1055 CTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC 1107
||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1256 CTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC 1308