Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09677
- Subject:
- XM_006499460.3
- Aligned Length:
- 1296
- Identities:
- 989
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------ATGATGCATCC 11
||||||||.||
Sbjct 1 ATGCTCCTGGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCGCACACCCACCCTGATGATGCAGCC 74
Query 12 TTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTA 85
|||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGCTCTTTCCAAACTTTA 148
Query 86 ACACA--------------------------------------------------------------------- 90
|||||
Sbjct 149 ACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCTACGCATACAGGACTGAGGAAGAGA 222
Query 91 ---------------------------------------------------------ATGGATCCTGTGCAAAA 107
|||||.||||||||.||
Sbjct 223 CCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTTCTGCCAGATGGACCCTGTGCAGAA 296
Query 108 AGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTC 181
|||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 297 AGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAAGTTATTTCCTGTAACGTCTGTC 370
Query 182 AGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCA 255
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 AGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCT 444
Query 256 CTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCAT 329
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCAT 518
Query 330 CACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGC 403
||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 519 CAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATAAAAGCCACCAGTTCCAGTCAGC 592
Query 404 CATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCT 477
|.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||...|.|||||
Sbjct 593 CCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACTTGGAGCCATCGCTTCT 666
Query 478 CCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTA 551
|||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 CCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTCTA 740
Query 552 TTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGA 625
.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCACAACACAGGATCTAAACACAAGA 814
Query 626 CCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAG 699
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 815 CCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACCTGGGTCAAGATTAAAGGTGCAG 888
Query 700 AATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGA 773
||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 889 AACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCTGTGATGTTCACGTGAACTCAGA 962
Query 774 AATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAAT 847
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 963 GATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCAGGAAAACCGCTGAAGCCGAAAT 1036
Query 848 ACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATG 921
|||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1037 ACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCTTGCATTCCAGAAAGATCTGATG 1110
Query 922 AAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCC 995
||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.|| .|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111 AAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCGTGTCCTCTGCGCTGTCACTGCC 1181
Query 996 ACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCA 1069
|||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1182 ACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTGCTGAGGCCTGGCCACGGGCCCA 1255
Query 1070 TCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC 1107
||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1256 TCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC 1293