Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09683
• Subject: XM_011533420.2
• Aligned Length: 2147
• Identities: 1419
• Gaps: 706

Alignment

Query    1  ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG  74

Query   75  GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC  148

Query  149  CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG  222

Query  223  GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA  296

Query  297  GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG  370

Query  371  GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG  444

Query  445  GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA  518

Query  519  GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG  592

Query  593  ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT  666

Query  667  GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG  740

Query  741  GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT  814

Query  815  TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT  888

Query  889  GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA  962

Query  963  AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA  1036

Query 1037  AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG  1110

Query 1111  GGAACCCTGGTGGTGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA  1184
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAACCCTGGTGGAGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA  1184

Query 1185  GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA  1258

Query 1259  ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG  1332

Query 1333  CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCACTATCTTCGGAATAAAGGAGTGGGTGAGGGGTCCAG  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |.|.|.||||   |..||..|.|||  
Sbjct 1333  CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCAC--------GCACACAGGA---GAAGACTGTTCC--  1393

Query 1407  TGGCCGCGAGGTCAGCCCTGCCTATACCCAGTTCCTGGA--GGACCCAGGCCTGACCAAGTCCCCGGCCTCAGC  1478
            |..|..||||||||             ||||   |||.|  ||..|||.||.|.|||    |.||.|.||    
Sbjct 1394  TACCTCCGAGGTCA-------------CCAG---CTGAATGGGGGCCAAGCATTACC----CACCAGACT----  1443

Query 1479  AGGCGATCATGTTGGCAGGCTTGGATCTTCTCGCTCTGTGACCAGCCTGGGCCACACACTGGTGGAATCTGCTC  1552
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1553  TCACGAGGCCTTCCCTGCCCAGTCCCCACAGGACCTCACCTAGGTTCTCGGACTCCCCAGAACAAAAAGGCTGG  1626
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1627  CAGGCACAAGTGTCAGAGATCAAGGCCCTCTGGCAGGCTGCCGAGGTGGAGCGTGACCGGCTCACCGAGTTTGT  1700
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1701  CACTGTCCTGCAGAAACGGGTGGAGGAGAGCAACAGCAAGCTCCTGGAGTCAGAGAGGAAGCTGCAGGAGGAGC  1774
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1775  GACACCGCACCGTGGTGCTGGAGCAACATCTGGAGAAGATACGCCTGGAGCCAGGGAAGGCATCAGCCTCCCAG  1848
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1849  AGAGCAGCTCCCAGGACCAAAACAGGTCTGCCCACCTCTAACAACAGGCACAACCCAACCGGGAGCGAGAAGAA  1922
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1923  GGACCCATCCTTTGCCCAGCTCTCCGATGTGCCCGTGGAATCCCAAATGGAAGAGCTGACAACCAGGCTGGCCA  1996
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 1997  TCCAGGTGGAGGAGAATGAAATGCTAAAGGCTGCCCTGGGCAGTGCCCTGCGGGGAAAGGAGGAGGACTTCCGG  2070
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 2071  ATGTACCATGAGATCCTGGGCCAGGTGAAAAGTGTCTTCCTGCAGGCCCTGCGGCAGCAGAAGACAGGCAAGCA  2144
                                                                                      
Sbjct 1444  --------------------------------------------------------------------------  1443

Query 2145  A  2145
             
Sbjct 1444  -  1443