Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09683
- Subject:
- XM_011533421.2
- Aligned Length:
- 2155
- Identities:
- 1390
- Gaps:
- 758
Alignment
Query 1 ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG 74
Query 75 GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC 148
Query 149 CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG 222
Query 223 GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA 296
Query 297 GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG 370
Query 371 GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG 444
Query 445 GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA 518
Query 519 GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG 592
Query 593 ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT 666
Query 667 GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG 740
Query 741 GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT 814
Query 815 TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT 888
Query 889 GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA 962
Query 963 AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA 1036
Query 1037 AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG 1110
Query 1111 GGAACCCTGGTGGTGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA 1184
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGAACCCTGGTGGAGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA 1184
Query 1185 GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA 1258
Query 1259 ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG 1332
Query 1333 CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCAC---------TATCTTC-GGAATAAAGGAGTGGGTG 1396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|| |||.|.|||..|
Sbjct 1333 CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCACCTGTGGCCTTATCCTCAGGATTCAAGATG------ 1400
Query 1397 AGGGGTCCAGTGGCCGCGAGGTCAGCCCTGCCTATACCCAGTTCCTGGAGGACCCAGGCCTGACCAAGTCCCCG 1470
|||||.|
Sbjct 1401 ---------GTGGCAG---------------------------------------------------------- 1407
Query 1471 GCCTCAGCAGGCGATCATGTTGGCAGGCTTGGATCTTCTCGCTCTGTGACCAGCCTGGGCCACACACTGGTGGA 1544
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 1545 ATCTGCTCTCACGAGGCCTTCCCTGCCCAGTCCCCACAGGACCTCACCTAGGTTCTCGGACTCCCCAGAACAAA 1618
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 1619 AAGGCTGGCAGGCACAAGTGTCAGAGATCAAGGCCCTCTGGCAGGCTGCCGAGGTGGAGCGTGACCGGCTCACC 1692
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 1693 GAGTTTGTCACTGTCCTGCAGAAACGGGTGGAGGAGAGCAACAGCAAGCTCCTGGAGTCAGAGAGGAAGCTGCA 1766
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 1767 GGAGGAGCGACACCGCACCGTGGTGCTGGAGCAACATCTGGAGAAGATACGCCTGGAGCCAGGGAAGGCATCAG 1840
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 1841 CCTCCCAGAGAGCAGCTCCCAGGACCAAAACAGGTCTGCCCACCTCTAACAACAGGCACAACCCAACCGGGAGC 1914
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 1915 GAGAAGAAGGACCCATCCTTTGCCCAGCTCTCCGATGTGCCCGTGGAATCCCAAATGGAAGAGCTGACAACCAG 1988
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 1989 GCTGGCCATCCAGGTGGAGGAGAATGAAATGCTAAAGGCTGCCCTGGGCAGTGCCCTGCGGGGAAAGGAGGAGG 2062
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 2063 ACTTCCGGATGTACCATGAGATCCTGGGCCAGGTGAAAAGTGTCTTCCTGCAGGCCCTGCGGCAGCAGAAGACA 2136
Sbjct 1408 -------------------------------------------------------------------------- 1407
Query 2137 GGCAAGCAA 2145
Sbjct 1408 --------- 1407