Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09688
• Subject: XM_011534378.3
• Aligned Length: 2062
• Identities: 1337
• Gaps: 719

Alignment

Query    1  ATGAGCGCCTCGGGCGTACTGTCCTTTACCCAGCAAGGATGGGAGCAGGTGCTGGCCAAAGTGAAACGGGCTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGCCTCGGGCGTACTGTCCTTTACCCAGCAAGGATGGGAGCAGGTGCTGGCCAAAGTGAAACGGGCTGT  74

Query   75  GGTTTACCTGGACGCCGCCTGCGCCGAGAGCCTGCACTGGGGCTGCGGATCCACCCGTCTCCTGGAGGCGGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTTTACCTGGACGCCGCCTGCGCCGAGAGCCTGCACTGGGGCTGCGGATCCACCCGTCTCCTGGAGGCGGTGG  148

Query  149  GGGGTCCTGACTGTCACCTGCGAGAGTTCGAGCCCGACGCAATTGGTGGTGGAGCCAAGCAGCCCAAGGCAGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGGTCCTGACTGTCACCTGCGAGAGTTCGAGCCCGACGCAATTGGTGGTGGAGCCAAGCAGCCCAAGGCAGTG  222

Query  223  TTTGTGCTGAGCTGCCTGCTGAAAGGCCGGACCGTGGAGATCCTACGGGACATCATCTGCCGCAGTCACTTCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGTGCTGAGCTGCCTGCTGAAAGGCCGGACCGTGGAGATCCTACGGGACATCATCTGCCGCAGTCACTTCCA  296

Query  297  GTATTGTGTGGTGGTCACAACCGTGAGCCACGCTGTCCACCTCACAGCTAATCATGTCCCAGCGGCGGCAGCGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTATTGTGTGGTGGTCACAACCGTGAGCCACGCTGTCCACCTCACAGCTAATCATGTCCCAGCGGCGGCAGCGG  370

Query  371  CCGAGATGGAGGGGCAGCAGCCGGTGTTCGAGCAGCTGGAGGAGAAGCTGTGTGAATGGATGGGCAACATGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGAGATGGAGGGGCAGCAGCCGGTGTTCGAGCAGCTGGAGGAGAAGCTGTGTGAATGGATGGGCAACATGAAC  444

Query  445  TACACGGCCGAGGTGTTCCATGTCCCGTTATTGCTTGCCCCTGTTGCTCCCCACTTTGCCTTGACTCCAGCTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACACGGCCGAGGTGTTCCATGTCCCGTTATTGCTTGCCCCTGTTGCTCCCCACTTTGCCTTGACTCCAGCTTT  518

Query  519  TGCATCCCTTTTCCCACTGCTACCCCAGGATGTGCACCTCCTTAATAGCGCCCGACCGGACAAGAGGAAGCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCATCCCTTTTCCCACTGCTACCCCAGGATGTGCACCTCCTTAATAGCGCCCGACCGGACAAGAGGAAGCTGG  592

Query  593  GAAGCCTGGGTGATGTGGACTCCACTACGCTAACCCCAGAGCTGCTGCTGCAGATCAGATGCCTAGTGTCAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGCCTGGGTGATGTGGACTCCACTACGCTAACCCCAGAGCTGCTGCTGCAGATCAGATGCCTAGTGTCAGGC  666

Query  667  CTCAGTTCTCTGTGTGAACATTTAGGAGTACGGGAGGAGTGTTTTGCTGTAGGTTCCTTAAGTCAGGTCATCGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCAGTTCTCTGTGTGAACATTTAGGAGTACGGGAGGAGTGTTTTGCTGTAGGTTCCTTAAGTCAGGTCATCGC  740

Query  741  TGCGGATCTGGCCAATTATGCCCCTGCAAAGAACAGGAAGAAGACTGCTGCAGGCAGGGCATCAGTGGTTTTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCGGATCTGGCCAATTATGCCCCTGCAAAGAACAGGAAGAAGACTGCTGCAGGCAGGGCATCAGTGGTTTTTG  814

Query  815  TGGACAGAACCCTGGATCTCACAGGAGCAGTTGGACATCATGGAGACAACTTAGTAGAGAAGATCATTTCAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGACAGAACCCTGGATCTCACAGGAGCAGTTGGACATCATGGAGACAACTTAGTAGAGAAGATCATTTCAGCA  888

Query  889  CTTCCCCAGCTCCCAGGCCACACAAATGATGTGATGGTTAACATGATAGCGCTCACTGCACTCCATACTGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCCCCAGCTCCCAGGCCACACAAATGATGTGATGGTTAACATGATAGCGCTCACTGCACTCCATACTGAGGA  962

Query  963  GGAAAATTATAATGTGGTTGCACCAGGCTGTCTTTCACAATCCAGTGACACCACAGCCAAAGCCCTATGGGAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAAATTATAATGTGGTTGCACCAGGCTGTCTTTCACAATCCAGTGACACCACAGCCAAAGCCCTATGGGAAG  1036

Query 1037  CTTTACTGAACACTAAGCACAAAGAGGCAGTGATGGAAGTTCGGAGACATCTAGTGGAAGCGGCAAGCAGAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTTACTGAACACTAAGCACAAAGAGGCAGTGATGGAAGTTCGGAGACATCTAGTGGAAGCGGCAAGCAGAGAA  1110

Query 1111  AACCTGCCAATCAAGATGAGTATGGGGAGAGTCACACCGGGACAGCTCATGTCCTATATTCAGCTCTTCAAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCTGCCAATCAAGATGAGTATGGGGAGAGTCACACCGGGACAGCTCATGTCCTATATTCAGCTCTTCAAGAA  1184

Query 1185  CAACCTCAAAGCTCTAATGAATCATTGTGGCCTCCTCCAGCTTGGACTGGCCACAGCTCAAACGTTGAAACACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAACCTCAAAGCTCTAATGAATCATTGTGGCCTCCTCCAGCTTGGACTGGCCACAGCTCAAACGTTGAAACACC  1258

Query 1259  CACAGACTGCCAAGTGGGACAACTTTCTGGCTTTTGAAAGGCTCCTTCTTCAGAGCATTGGGGAGTCA------  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||...|||      
Sbjct 1259  CACAGACTGCCAAGTGGGACAACTTTCTGGCTTTTGAAAGGCTCCTTCTTCA--------GGCTCTCATGCCCT  1324

Query 1327  ---GCAATGTCCGTTGTGTTAAATCAGCTGCTGC-CCATGATTAAGCCTGTAACCCAGAGAACCAACGAGGACT  1396
               ||.||| ||.|           |.||||  | ||||| |||                              
Sbjct 1325  CTCGCCATG-CCAT-----------ACCTGC--CACCATG-TTA------------------------------  1353

Query 1397  ACAGCCCTGAGGAACTGCTGATCCTTCTCATATATATTTATTCTGTCACTGGAGAGCTCACAGTAGACAAAGAC  1470
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1471  CTGTGTGAAGCAGAAGAAAAAGTCAAGAAAGCATTGGCTCAGGTCTTCTGTGAGGAATCTGGATTGTCACCTTT  1544
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1545  GCTGCAAAAAATTACGGACTGGGACTCTTCAATTAATCTGACATTTCACAAATCCAAAATTGCCGTGGATGAAC  1618
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1619  TCTTTACTTCACTTCGGGATATTGCTGGAGCTCGGAGTCTCCTGAAACAGTTTAAGTCTGTATATGTTCCTGGA  1692
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1693  AATCATACCCACCAGGCATCTTATAAGCCATTGTTGAAGCAAGTTGTGGAGGAAATATTTCATCCCGAGAGGCC  1766
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1767  AGATTCCGTTGATATTGAACACATGTCTTCAGGCCTCACTGATCTCCTTAAAACTGGATTTAGCATGTTCATGA  1840
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1841  AGGTGAGCCGGCCTCATCCTAGTGACTACCCCCTCCTGATCCTCTTTGTGGTAGGTGGGGTCACAGTCTCTGAA  1914
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1915  GTGAAAATGGTCAAAGATCTTGTGGCATCGTTGAAGCCAGGAACCCAGGTAATCGTGCTGTCCACACGACTCCT  1988
                                                                                      
Sbjct 1354  --------------------------------------------------------------------------  1353

Query 1989  GAAGCCACTTAACATTCCTGAGCTGTTATTTGCAACTGACCGACTGCATCCAGACCTTGGCTTC  2052
                                                                            
Sbjct 1354  ----------------------------------------------------------------  1353