Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09696
• Subject: XM_017009093.2
• Aligned Length: 1851
• Identities: 1400
• Gaps: 423

Alignment

Query    1  ATGGGTGTGATAGGTATACAGCTGGTTGTTACCATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATACCTCACTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGTGATAGGTATACAGCTGGTTGTTACCATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATACCTCACTA  74

Query   75  TTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAATTAAGAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAATTAAGAA  148

Query  149  TTCTTGCAGGGAAACAACAAAAAGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAGTAAGCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCTTGCAGGGAAACAACAAAAAGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAGTAAGCCA  222

Query  223  TTAACCATTCCAAAGGATATTGACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAGCATTGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAACCATTCCAAAGGATATTGACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAGCATTGCA  296

Query  297  TTACTTTCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACTGAAGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTACTTTCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACTGAAGTCT  370

Query  371  ACTACAATTTTATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTCTTTTGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACAATTTTATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTCTTTTGCA  444

Query  445  ATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTTGTGTCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTTGTGTCAC  518

Query  519  CTTTGGATTTTTTTTCTTTGTCAAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTTGGACTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTGGATTTTTTTTCTTTGTCAAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTTGGACTTG  592

Query  593  AAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCAGAGTCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCAGAGTCCT  666

Query  667  GTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGG  740

Query  741  ATTACGACTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTACTTCATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTACGACTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTACTTCATA  814

Query  815  TCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTTTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTATGAACCCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTCTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTATGAACCCA  888

Query  889  CCACTGGGCAAAGAAAGTATCCCTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAATAATCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCACTGGGCAAAGAAAGTATCCCTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAATAATCCT  962

Query  963  GCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCCATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAATGTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCCATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAATGTGTGG  1036

Query 1037  ATCAGATGAAGAAAGAAGCGGGGCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTTTTATTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCAGATGAAGAAAGAAGCGGGGCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTTTTATTAT  1110

Query 1111  CTTTGTGTCATTGCACTGCAGTATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGAAAACACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTTGTGTCATTGCACTGCAGTATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGAAAACACT  1184

Query 1185  AGGTAATCATTCCTGGGGTATTTATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTGTCCAATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGTAATCATTCCTGGGGTATTTATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTGTCCAATT  1258

Query 1259  CTGTTTACTCTGAATTACCATCAGCTGAAGGGAAAATG----------------AAGGT--AACTGTTACACAA  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||  |.|.|||.|||  
Sbjct 1259  CTGTTTACTCTGAATTACCATCAGCTGAAGGGAAAATGAAGCATAATGCAAGGCAAGGTCCAGCCGTTCCAC--  1330

Query 1315  ATAACAGTGGCA------CT----GAGCAG----CTTAAAAAATATTTTTACTCC-------------------  1355
                  ..||||      ||    ||||||    |||..||.||       ||||                   
Sbjct 1331  ------CCGGCATGCAAGCTTATGGAGCAGCCCCCTTTGAAGAT-------CTCCAGCTAGACTTCACAGAGAT  1391

Query 1356  ---------------TCTTCTTTTTCGA---GGACT---------------------------TCTGTCTTTT-  1383
                           ||||.||..|.||   |||||                           .|||.|.||| 
Sbjct 1392  GCCAAAGTGTGGAGATCTTATTCCTAGATTTGGACTGCCCTTACGGATCGGCTCAGATAATGGGCTGGCGTTTG  1465

Query 1384  ---CTGACCTGGT-----------------------GGAT----TG----CTGCTTGCCTCTTTTCTACAAGCC  1423
               |||||.||||                       ||||    ||    ||||.|||    |..||||..|||
Sbjct 1466  TGGCTGACTTGGTACAGAAGACGGCAAAGGTACTGGGGATCACATGGAAACTGCATGC----TGCCTACTGGCC  1535

Query 1424  T-----TTTTG------------GGCTTTTCTATCACCAGTATCTGACTGTGGCA-------------------  1461
            |     ||..|            ||.|            |.|||.||||.|  ||                   
Sbjct 1536  TCAGAGTTCCGGAAAGGTGGAGCGGAT------------GAATCAGACTAT--CAAAAATAGTTTAGGGAAAGT  1595

Query 1462  --------------------------------------------------------------------------  1461
                                                                                      
Sbjct 1596  ATGTCAGGAAAAAGGATTAAAATGGATACAGGCTCTCCCTATGGTATTATTTAAAATTAGATGTACCCCTTCTA  1669

Query 1462  --------------------------------------------------------------------------  1461
                                                                                      
Sbjct 1670  AAAGAGCAGGATATTCCCCTTATAAAATACTATATCATAGGCCCCCTCCCATATTGTGGGGACTTCCAGGCACT  1743

Query 1462  --------------------------------------------------------------------------  1461
                                                                                      
Sbjct 1744  CCCCAAGAGTTAGGTGAAATTGAGTTACAGCGACAGCTACAGGCTTTAGGAAAAATTACACAATCTCAGCCTGG  1817

Query 1462  -  1461
             
Sbjct 1818  G  1818