Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09779
- Subject:
- NM_175459.6
- Aligned Length:
- 2814
- Identities:
- 1972
- Gaps:
- 498
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGGAAGGTCATGTGGCATGAATCTCCACCGGACATCAAGAACCCCACAGGGGCCTGGCCTACTCGGTGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCAACATATCCCTCCCATCAGAGCCCACGCAGGCACTCCCTGCTCCTCTTCCTGTGCCAGCACGCCGAGCCCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTATTGGAAGTCTTGCTAACAGTCTTCACCTCAAGATGTCCTCGGGAGCAGGGATGGCTCCTCAGAGCAACATG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GCCGCGAGTCCCATCCATCTGCCTGCCCTGAGCCCCAGGAGACAGTTACTCGCCAATGGGAAGCCTCAGTTCCA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGTCACCCCGGCTGGTGTCATGGCAGCACCACATACTATAAAGCCCAAACAGCAAGAATTTGGAGACCCCTTCT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CTCCAAATCCTGAGAAAGGGGCTCTTGGCTTTGGGCCTCAGTGCAAGTCCATTGGAAAAGGCAGCTGCAACAAT 444
Query 1 ---------------------ATGATGGTTCAGCGACTGGGACTCATTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCTAC 53
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 CTAGTGGTCACCAGCAGTCCCATGATGGTTCAGCGACTGGGACCCATTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCCAC 518
Query 54 AGCATGCAACCAGATCAGTCCTAGCTTACAGAGGGCAATGAATGCAGCCAACCTGAATATACCTCCTTCAGATA 127
|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 519 AGCATGCAAGCAGATCAGTCCTAGCTTACCGAGGGCAGTGAATGCAGCCAACCTGAATAGACCTCCTTCAGATA 592
Query 128 CCAGGTCCCTTATTTCGCGTGAGTCTTTGGCGTCCACGACCTTGAGTCTGACGGAAAGTCAGTCGGCCTCAAGC 201
||||||||.||||||.||..||||||.|||.|||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||..||.
Sbjct 593 CCAGGTCCGTTATTTTGCAAGAGTCTCTGGTGTCCACGACTTTGAGTCTGACAGAGAGTCAATCAGCCTTGAGT 666
Query 202 ATGAAGCAGGAGTGGTCCCAGGGCTACAGGGCCCTCCCTTCGCT---CTCCAACCACGGCTCTCAGAATGGCCT 272
.|||||||.||||||||.|||.||||||||||..|||||||.|| .||||.||||.|.||.|||||||||..
Sbjct 667 GTGAAGCAAGAGTGGTCTCAGAGCTACAGGGCTTTCCCTTCACTTTCATCCAGCCACAGTTCCCAGAATGGCAC 740
Query 273 TGATCTAGGGGATCTCCTTAGCCTTCCTCCCGGGACATCCA-TGTCCAGCAATAGTGTCTCTAACTCATTACCA 345
.||.||||||||.||.||||||.|.|||||.||.|| .||| ||||..||||.||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 741 GGACCTAGGGGACCTTCTTAGCTTGCCTCCAGGCAC-GCCAGTGTCTGGCAACAGCGTCTCCAACTCGTTGCCA 813
Query 346 TCCTACCTTTTTGGCACGGAAAGTAGCCACTCTCCTTACCCTAGTCCTCGGCACTCATCCACCAGGTCCCACTC 419
.||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||.|||||||
Sbjct 814 CCCTACCTTTTCGGCATGGAAAATAGCCACTCTCCTTACCCTAGCCCTCGGCACTCAGCAACCAGGGCCCACTC 887
Query 420 GGCCCGCTCCAAGAAGAGAGCGCTGTCCTTGTCCCCGCTGTCCGATGGCATCGGGATAGATTTCAATACCATCA 493
..|||||||.|||||||||||..||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 888 CACCCGCTCTAAGAAGAGAGCATTGTCCTTGTCGCCACTGTCAGATGGCATCGGGATCGACTTCAACACTATCA 961
Query 494 TCCGCACGTCGCCCACGTCCTTGGTGGCCTACATCAACGGGTCGAGGGCTTCGCCGGCCAACCTGTCCCCGCAG 567
||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||..|.||.||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 962 TCCGTACTTCACCCACATCCTTGGTCGCCTACATCAACGGACCAAGAGCCTCCCCAGCCAACCTGTCCCCACAG 1035
Query 568 CCGGAGGTCTACGGGCATTTCCTGGGCGTGCGCGGCAGCTGCATTCCCCAGCCGCGCCCGGTGCCCGGCAGCCA 641
.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.|..|..|.|||.||.||.|.||
Sbjct 1036 TCAGAGGTCTATGGGCATTTCCTGGGTGTTCGTGGCAGCTGCATCCCCCAGTCTTGTGCAGTGGCCAGCGGGCA 1109
Query 642 GAAGGGCGTGCTGGTGGCCCCTGGAGGCCTGGCGCTGCCGGCCTACGGCGAGGACGGGGCCCTGGAGCACGAGC 715
|||.|||.|..||||.|||..||||||.|...|||||||||.|||.||.||||||||..|.||||||.|.||.|
Sbjct 1110 GAAAGGCATATTGGTTGCCAGTGGAGGGCATACGCTGCCGGGCTATGGAGAGGACGGTACACTGGAGTATGAAC 1183
Query 716 GCATGCAACAGCTGGAGCACGGCGGCCTGCAGCCAGG-CCTGGTCAACCACATGGTGGTGCAGCATGGCCTGCC 788
|||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|| ||| ||.|||.||||||||.||||||.||||||.||
Sbjct 1184 GCATGCAGCAGCTTGAGCATGGTGGCCTGCAACCCGGACCT-GTAAACAACATGGTGTTGCAGCCTGGCCTACC 1256
Query 789 GGGCCCCGACAGCCAGCCGGCCGGCCTGTTCAAGACCGAACGCCTGGAGGAGTTCCCGGGCAGCACCGTAGACC 862
|||||..||..|||||.|.|||..|.||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|.|||..||.|.||||
Sbjct 1257 GGGCCAGGATGGCCAGACAGCCAACATGCTCAAAACAGAGCGCCTGGAGGAGTTCCCCGCCAGTGCCTTGGACC 1330
Query 863 TACCCCCCGCGCCTCCGCTCCCTCCTCTGCCGCCGCCCCAAGGCCCCCCACCCCCTTACCATGCCCATGCGCAC 936
|.|||.|.||.|..||.||| |||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||
Sbjct 1331 TGCCCTCTGCTCTGCCTCTC---CCTCTTCCTCCGCCTCAGGGTCCCCCACCCCCATACCATGCCCATCCACAC 1401
Query 937 CTTCACCACCCGGAGCTCGGGCCCCACGCCCAGCAGCTGGCCTTGCCCCAGGCCACCCTGGACGACGACGGGGA 1010
|||||.|||||.||||||..|||.|||.||||...||||.||.||.|||||.|...||||||.||.||.|||||
Sbjct 1402 CTTCATCACCCAGAGCTCCTGCCTCACACCCAATCGCTGTCCCTGGCCCAGACTGGCCTGGAAGAGGATGGGGA 1475
Query 1011 GATGGACGGCATC-GGGGGCAAGCATTGCTACCGCTGGATCGACTGCAGCGCCCTGTACGACCAGCAGGAGGAG 1083
||||||.|.| || |||||.|||||.||||.|||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1476 GATGGAAGAC-TCAGGGGGGAAGCACTGCTGCCGTTGGATAGACTGCAGTGCCCTTTATGACCAGCAGGAGGAA 1548
Query 1084 CTCGTGCGGCACATCGAGAAGGTCCACATCGACCAGCGCAAAGGGGAGGACTTCACTTGCTTCTGGGCCGGTTG 1157
||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||.|.||.||
Sbjct 1549 CTGGTGAGGCACATCGAGAAGGTCCACATAGACCAACGCAAGGGGGAAGACTTCACGTGCTTCTGGACTGGCTG 1622
Query 1158 CCCTCGAAGATACAAGCCCTTCAACGCCCGCTATAAACTGCTGATCCACATGAGAGTCCACTCTGGGGAGAAGC 1231
||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1623 CCCTAGAAGATACAAGCCTTTCAACGCACGGTATAAACTGCTGATCCACATGAGGGTCCACTCTGGGGAGAAGC 1696
Query 1232 CCAACAAGTGTACGTTTGAAGGTTGCGAGAAGGCCTTTTCAAGGCTTGAAAATCTCAAGATCCACTTGCGGAGC 1305
||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1697 CCAACAAGTGTACGTTCGAAGGCTGCAAGAAGGCCTTTTCCAGGCTCGAGAACCTCAAGATTCACTTGCGGAGC 1770
Query 1306 CACACAGGCGAGAAGCCGTATTTGTGCCAGCATCCGGGTTGTCAGAAGGCCTTCAGTAACTCCAGTGACCGCGC 1379
|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1771 CACACGGGTGAGAAGCCATACTTGTGCCAGCATCCGGGCTGCCAAAAGGCCTTCAGCAATTCCAGTGACCGTGC 1844
Query 1380 CAAACACCAGCGGACGCATCTGGACACCAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACCAAACGCTACACAG 1453
|||.||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1845 CAAGCACCAGAGGACACATCTTGACACTAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACAAAGCGCTACACAG 1918
Query 1454 ACCCAAGTTCCCTAAGAAAGCATGTGAAGGCACATTCTTCCAAAGAGCAACAAGCAAGGAAAAAGTTGCGGTCC 1527
|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||..||||||.|||||||||||||||.|.|||||.
Sbjct 1919 ACCCAAGCTCCCTCAGAAAGCACGTGAAGGCACATTCTTCCCGAGAGCAGCAAGCAAGGAAAAAGCTACGGTCT 1992
Query 1528 AGCACAGAGCTCCATCCAGACCTGCTCACAGATTGCCTCACCGTGCAGTCCCTGCAGCCGGCCACTTCCCCTAG 1601
|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|.||||||.||||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct 1993 AGCACTGAGCTCCATCCAGATCTCCTCACAGACTGCCTCGCTGTGCAGCCCCTGCAGCCAGCCACGTCCCCTGG 2066
Query 1602 AGATGCTGCTGCTGAAGGGACCGTGGGACGCTCCCCTGGACCCGGGC------------------CTGACCTCT 1657
|||||||||||.|.| .||||||||.|.||||||.||.||.|||| ||||.||||
Sbjct 2067 AGATGCTGCTGATCA---TACCGTGGGGCACTCCCCAGGGCCGGGGCCTGGGCCAGGGCCTGGGGCTGAACTCT 2137
Query 1658 ATTCAGCTCCCATTTTCTCCAGCAATTATTCAAGCCGAAGTGGAACAGCTGCTGGGGCCGTACCACCCCCACAT 1731
|||||||||||||||||.||||||||.||||||..|||||||||||||||||||||||.|..||||||||||||
Sbjct 2138 ATTCAGCTCCCATTTTCGCCAGCAATCATTCAACTCGAAGTGGAACAGCTGCTGGGGCTGGGCCACCCCCACAT 2211
Query 1732 CCTGTCAGTCACCCTTCTCCAGGACATAATGTACAGGGGAGCCCTCACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACT 1805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 CCTGTCAGTCACCCTTCTCCAGGACATAATGTACAGGGGAGCCCCCACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACT 2285
Query 1806 CACAGCTGTGGACGCAGGAGCTGAGAGGTTTGCACCTTCTGCTCCATCTCCTCACCACATCAGCCCCCGGAGAG 1879
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||..|.||||
Sbjct 2286 CACAGCTGTGGACGCAGGCGCTGAGAGGTTTGCACCTCCGACTCCATCTCCTCACCACATCAGCCCGGGAAGAG 2359
Query 1880 TTCCAGCTCCTTCTTCAATACTGCAAAGAACACAGCCTCCCTATACCCAGCAGCCATCAGGTTCACACCTGAAG 1953
|||||||||||.|.|||.|.||.||.|||.|||||.|||||.|..|||||||||||.||||.||||.|||||||
Sbjct 2360 TTCCAGCTCCTCCGTCACTGCTCCAGAGAGCACAGGCTCCCCACTCCCAGCAGCCACCAGGCTCACTCCTGAAG 2433
Query 1954 TCCTATCAGCCAGAAACAAACTCTTCTTTTCAACCAAATGGTATCCATGTCCATGGATTTTATGGGCAGCTGCA 2027
.||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2434 CCCTACCAGCCAGAAACCAACTCTTCTTTTCAGCCAAATGGTATCCATGTCCACGGATTTTATGGCCAGCTGCA 2507
Query 2028 GAAGTTCTGTCCCCCACACTACCCCGATTCCCAGAGAATTGTGCCGCCTGTCAGCTCCTGCAGTGTGGTGCCTT 2101
||..|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||.||||||.||...|.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2508 GACATTCTGTCCCCCGCATTATCCTGATTCCCAAAGAACTGTGCCACCCAGCGGCTCCTGCAGTATGGTGCCTT 2581
Query 2102 CGTTTGAGGACTGCCTAGTCCCTACATCCATGGGCCAGGCCAGTTTTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCGACT 2175
|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 2582 CCTTTGAGGACTGCCTGGTCCCCACGTCCATGGGTCAAGCCGGTTTTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCAACA 2655
Query 2176 CACTCGGGCATTACAGTGTATGATTTACCTTCAAGTTCCTCGAGCCTCTTTGGGGAGTCTCTCCGCAGCGGGGC 2249
|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||..||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||..|
Sbjct 2656 CACTCAGGCATCACAGTGTACGATTTGCCTTCAGCTTCCTCAAGCCTCTTTGGGGAATCTCTTCGCAGTGGCCC 2729
Query 2250 TGAAGATGCTACCTTCTTGCAGATCAGCACCGTGGACCGCTGTCCTAGCCAGCTCTCCTCTGTCTGCACCGAAG 2323
||||||..|.||.|||||||||.||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||
Sbjct 2730 TGAAGACCCCACGTTCTTGCAGCTCAGTGCTGTGGACCGCTGTCCTAGCCAGCTCTCCTCTGTGTATACCGAAG 2803
Query 2324 GC 2325
||
Sbjct 2804 GC 2805