Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09794
• Subject: NM_001127214.4
• Aligned Length: 1728
• Identities: 1719
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCCTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG  74
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCGTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG  74

Query   75  ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG  148

Query  149  CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC  222

Query  223  AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC  296

Query  297  CTTCCTATGTGCTAACGACGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCCTCATGGATGAGCGGCGGTGTGGCAGTAC  370
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  297  CTTCCTATGCGCTAACGATGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCGTCATGGATGAGTGGCGGTGTGGCAGTCC  370

Query  371  CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  371  CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGCC  444

Query  445  AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC  518

Query  519  CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA  592

Query  593  TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG  666

Query  667  GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT  740

Query  741  CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC  814

Query  815  CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA  888

Query  889  TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG  962

Query  963  TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA  1036

Query 1037  TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT  1110

Query 1111  GCCATGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA  1184
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCGTGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA  1184

Query 1185  GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG  1258

Query 1259  AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG  1332

Query 1333  AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCG  1406

Query 1407  AGGCCGGACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGCCGGACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGC  1480

Query 1481  TGGCCCACCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGCCCACCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCT  1554

Query 1555  GTGGTGACCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGAAATGTCCTGGCCCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGGTGACCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGAAATGTCCTGGCCCC  1628

Query 1629  GTACGCGGTGCCCTCGGAGCTGGTGCTGGTGGAGGAGATCCCGCGGAACCAGATGGGCAAGATTGACAAGAAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTACGCGGTGCCCTCGGAGCTGGTGCTGGTGGAGGAGATCCCGCGGAACCAGATGGGCAAGATTGACAAGAAGG  1702

Query 1703  CGCTCATCAGGCACTTCCACCCCTCA  1728
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGCTCATCAGGCACTTCCACCCCTCA  1728