Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09794
- Subject:
- XR_933240.3
- Aligned Length:
- 2551
- Identities:
- 1719
- Gaps:
- 823
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAGCTGTTGGGCGCCGGAACTGGTCCGGCCCGACTCACGACCCCGCGGGACCCGGCCGGAACCCGGCCCGACCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGGCGCGCGCGCGGCGGAGGACGAGGAAGAGTTGTGGCGAGGCAGATCCTGCCCCGTGGCCGCGGCCGTCTCGT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGGTGTCCCACCGGCCTTCCGGGTTCCAGCGCCAGGCCTGGTGCCTGCCCCAGGAGGATGAGCATTTGCATTGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTGCACCTTATCGTGCCCTTCCACCTGCTGAAGCAGCTGTGCCTGCCGCTCTTGTGAACTGCGAACTTCCCCTT 296
Query 1 -----------------------------------------------ATGCCGCCCCATGTGGTGCTCACCTTC 27
||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCTCCTCTCTCTGGCTCGGGAGCTGGCTCGGCCGCCTGTCAGTGCAATGCTGCCCCATGTGGTGCTCACCTTC 370
Query 28 CGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCCTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAGACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACAC 101
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCGTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAGACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACAC 444
Query 102 AGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTGCCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCC 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTGCCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCC 518
Query 176 TGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGCAGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGC 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGCAGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGC 592
Query 250 AGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTCCTTCCTATGTGCTAACGACGCCTCCTA 323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 593 AGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTCCTTCCTATGCGCTAACGATGCCTCCTA 666
Query 324 CGTCGTGGCCCAGTGGGCCTCATGGATGAGCGGCGGTGTGGCAGTACCCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCC 397
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGTCGTGGCCCAGTGGGCGTCATGGATGAGTGGCGGTGTGGCAGTCCCCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCC 740
Query 398 AGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGTCAGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGC 471
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGCCAGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGC 814
Query 472 CCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGCCATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACC 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGCCATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACC 888
Query 546 GGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCATGATCATCTACACCAGTGGGACCACGG 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCATGATCATCTACACCAGTGGGACCACGG 962
Query 620 GGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTGGTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCA 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTGGTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCA 1036
Query 694 TGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGTCCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTG 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGTCCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTG 1110
Query 768 TCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCCCTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAA 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCCCTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAA 1184
Query 842 GTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATATACACCAAGCTGATGGAGTACTACGAC 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATATACACCAAGCTGATGGAGTACTACGAC 1258
Query 916 AGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTGTGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTC 989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTGTGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTC 1332
Query 990 AGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACATCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGT 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACATCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGT 1406
Query 1064 ATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACTGCCATGCGCCTGC-------------- 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1407 ATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACTGCCGTGCGCCTGCCAGGATGTGCTGGT 1480
Query 1124 -------------------------------------------------------------------------- 1123
Sbjct 1481 TTTGTCCAGTGCCACCGGCCACAGTCACCACGTAATATGGACGGAATGAGCAAAGCCCGGCTCGCTGAGGCTGC 1554
Query 1124 ------CAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACAGAGGGAA 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGGCTGCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACAGAGGGAA 1628
Query 1192 GCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAGAAAAGGA 1265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAGAAAAGGA 1702
Query 1266 GGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAGAGTGCAT 1339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAGAGTGCAT 1776
Query 1340 TCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCGAGGCCGG 1413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCGAGGCCGG 1850
Query 1414 ACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGCTGGCCCA 1487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGCTGGCCCA 1924
Query 1488 CCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCTGTGGTGA 1561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCTGTGGTGA 1998
Query 1562 CCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGAAATGTCCTGGCCCCGTACGCG 1635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGAAATGTCCTGGCCCCGTACGCG 2072
Query 1636 GTGCCCTCGGAGCTGGTGCTGGTGGAGGAGATCCCGCGGAACCAGATGGGCAAGATTGACAAGAAGGCGCTCAT 1709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTGCCCTCGGAGCTGGTGCTGGTGGAGGAGATCCCGCGGAACCAGATGGGCAAGATTGACAAGAAGGCGCTCAT 2146
Query 1710 CAGGCACTTCCACCCCTCA------------------------------------------------------- 1728
|||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAGGCACTTCCACCCCTCATGACCCGGCAGACTGGGACTGCGGGTCTGGTGGGGAGCAGCAGACGTCCCCTTCA 2220
Query 1729 -------------------------------------------------------------------------- 1728
Sbjct 2221 CACCGAGAACCACGGGGGCCCGTCCAAGACCTGGCCTCCCTTAAACCTGAACCCCCCAAATCAGGTCACGTAGA 2294
Query 1729 -------------------------------------------------------------------------- 1728
Sbjct 2295 ATCAAGAACTGTTTGGGATGAAATCACCATGTGGGGTCCCCAGCCTCGGGCCAGTTGTTGCAGCTCAAGGAGAC 2368
Query 1729 -------------------------------------------------------------------------- 1728
Sbjct 2369 CGTCCCTGGTGTCACCTCTGCCTGGTCACCGCCGACCTCATCTGTGCAGCGCGGTGCAGCCAGCCCCTGGCCCC 2442
Query 1729 -------------------------------------------------------------------------- 1728
Sbjct 2443 ACGTGCTGAGGCACCTCCCGCCCCACAGTGCCCTGCAGTTGCCAGGCTCTCCAGGGCAGGTCCCAGAGGTTTCC 2516
Query 1729 ----------------------------------- 1728
Sbjct 2517 CACAAAAAACAAAGACTCCACTGGAGGAAACAAGC 2551