Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09804
- Subject:
- NM_028881.2
- Aligned Length:
- 2082
- Identities:
- 1874
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA 74
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGACGTCAGGGGCGAACGGGCCGGGTTCCGCCACAGCCTCAGCGTCCAATCCACGCAAGTTTAGTGAGAA 74
Query 75 GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA 148
Query 149 CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT 222
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 CACGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCTTATACAAGGAGCTCCCATTATGGTGGTTCTCTGCCCAATGTT 222
Query 223 AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG 296
|||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACCAGATTGGCTGTGGCCTGGCTGAGTTCCAGAGCCCCCTTCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG 296
Query 297 GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC 370
||||||||||.|||||||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 297 GCACCATGGGTTGGTGGAACGGGTACAACGAGATGCCCGCAGAATGGTGTCCCCACTCCGCCGATACCCCCGCC 370
Query 371 ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC 444
||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||
Sbjct 371 ACATTGACAGTTCTCCATATAGCCCTGCCTATTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTGGCTGGCGAAGGATGATGCCC 444
Query 445 TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC 518
||||||||..||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGGGCAACCTCCCAGCTGAGAAGGGGCAGTTGTTTAGACTGCCGTCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC 518
Query 519 TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC 592
|||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 519 TGCTCTTCACACAAGTGTGATGAACCCTAACCCCCAAGACACTTATCCAGGCCCCACACCTCCCAGTGTCCTGC 592
Query 593 CCA---GCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTA 663
||| |||||.|.||.|||.|||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 593 CCAGCCGCCGAGGAGGAGGTTTTCTGGATGGTGAGATGGATGCTAAAGTCCCTGCTATTGAGGAGAACGTGGTA 666
Query 664 GATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGA 737
||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 667 GATGACAAGCATCTGCTGAAACCTTGGGATGCTAAGAAGCTGTCCTCATCTTCCTCTCGACCTCGATCCTGTGA 740
Query 738 AGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA 811
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTCCCTGGAATCAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCTAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA 814
Query 812 CGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAG 885
|.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 815 CAGGAGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTACACTTCCCTCCTCCACTGCCCACACCCCTGGACCCTGAGGAG 888
Query 886 ACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAG 959
||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||..||||||||||
Sbjct 889 ACAGTCTATCCCAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCACCAATTTGACCCATACTATGACCCATTTGGGCATCAG 962
Query 960 CAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGT 1033
..|.||..|||||.|||||||..|||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGAGGTCTGGGCTTGGGCCCCAGCTATGATGTACCAGGACTTCACTCACCTCTTAGCCACCCATCCCTGCAGT 1036
Query 1034 CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCAC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1037 CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTAAGTAGTCCTCAACCCCAGCTCCAGGGCTCCCATAGTCAC 1110
Query 1108 CCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGC 1181
||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111 CCATCACTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCACCATGCACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCGTCACTTAGTGC 1184
Query 1182 TCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTT 1255
.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||.|.||.|||.|||||||.||||
Sbjct 1185 CCCAGCCCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCGTCCACTTCATCTCCTGTCCTGAGTGCTCCCCCTTACCCAGCTT 1258
Query 1256 CTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGAC 1329
||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTACTCCTGGGGCCTCTCCCCGCCACCGTCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGCTTGCCCGCGGGCCCAGCCGAC 1332
Query 1330 GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA 1406
Query 1404 GGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTC 1477
||||||.|||.||||||||||||||.||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1407 GGGCGTTCCCTTGGATACCAGTAAATTGCCTACTGACCAGCGATTGCCCCCATACCCATATAGCCCCCCAAGTC 1480
Query 1478 TGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTG 1551
|.|||.|.||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||| |.|||||||||||.|.||.|.||||
Sbjct 1481 TAGTTATACCCACCCATCCACCCACCCCAAAGTCTCTACAGCA------GTTGCCCTCTCAGGCCTGCTTAGTG 1548
Query 1552 CAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCA 1625
|||.||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1549 CAGCCCTCAGGTGGACAGCCTCCAGGCAGGCAGCCACATTATGGGGCACTGTACCCACCTGGGTCCAGTGGACA 1622
Query 1626 TGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCC 1699
||||||||||.||||||||||.|||||.|.||||||||.|.||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1623 TGGGCAACAGCCTTACCACCGCCCAATAAATGACTTCAGCTTGGGGAATCTGGAGCAATTCAACATGGAGAGCC 1696
Query 1700 CATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATG 1773
|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1697 CATCAACCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGCCTTTTCTGAAGGTCCTGGATTTTTAGGGAGTGAGGGATCAATG 1770
Query 1774 GGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAA 1847
.|||||||||||||.||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1771 AGTGGCCCCCAGGACCCTCACGTCCTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGACCTAA 1844
Query 1848 CATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCT 1921
.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1845 TATCATACTCACAGGAGACTCTTCCCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCTGGAGTGCCTGGCT 1918
Query 1922 TTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG 1995
||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TTGAGGTGTCAGCATCTGGGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG 1992
Query 1996 GAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGA 2069
|||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1993 GAAGGACTAACTATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGACCCTGCTGTGGAGGACTCATTCCGTAGTGA 2066
Query 2070 CCGGCTCCAA 2079
.|||||.||.
Sbjct 2067 TCGGCTACAG 2076