Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09804
• Subject: XM_006502152.1
• Aligned Length: 2082
• Identities: 1814
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACGTCAGGGGCGAACGGGCCGGGTTCCGCCACAGCCTCAGCGTCCAATCCACGCAAGTTTAGTGAGAA  74

Query   75  GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA  148

Query  149  CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT  222
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CACGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCTTATACAAGGAGCTCCCATTATGGTGGTTCTCTGCCCAATGTT  222

Query  223  AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  296
            |||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACCAGATTGGCTGTGGCCTGGCTGAGTTCCAGAGCCCCCTTCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  296

Query  297  GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC  370
            ||||||||||.|||||||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  297  GCACCATGGGTTGGTGGAACGGGTACAACGAGATGCCCGCAGAATGGTGTCCCCACTCCGCCGATACCCCCGCC  370

Query  371  ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC  444
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||            
Sbjct  371  ACATTGACAGTTCTCCATATAGCCCTGCCTATTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTGGCTGGCGA------------  432

Query  445  TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC  518
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  433  ---------------------------------------------------------AGGACAAGCTCTGACTC  449

Query  519  TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC  592
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  450  TGCTCTTCACACAAGTGTGATGAACCCTAACCCCCAAGACACTTATCCAGGCCCCACACCTCCCAGTGTCCTGC  523

Query  593  CCA---GCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTA  663
            |||   |||||.|.||.|||.|||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  524  CCAGCCGCCGAGGAGGAGGTTTTCTGGATGGTGAGATGGATGCTAAAGTCCCTGCTATTGAGGAGAACGTGGTA  597

Query  664  GATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGA  737
            ||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  598  GATGACAAGCATCTGCTGAAACCTTGGGATGCTAAGAAGCTGTCCTCATCTTCCTCTCGACCTCGATCCTGTGA  671

Query  738  AGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA  811
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  672  AGTCCCTGGAATCAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCTAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA  745

Query  812  CGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAG  885
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  746  CAGGAGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTACACTTCCCTCCTCCACTGCCCACACCCCTGGACCCTGAGGAG  819

Query  886  ACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAG  959
            ||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||..||||||||||
Sbjct  820  ACAGTCTATCCCAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCACCAATTTGACCCATACTATGACCCATTTGGGCATCAG  893

Query  960  CAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGT  1033
            ..|.||..|||||.|||||||..|||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  894  TGGAGGTCTGGGCTTGGGCCCCAGCTATGATGTACCAGGACTTCACTCACCTCTTAGCCACCCATCCCTGCAGT  967

Query 1034  CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCAC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  968  CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTAAGTAGTCCTCAACCCCAGCTCCAGGGCTCCCATAGTCAC  1041

Query 1108  CCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGC  1181
            ||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1042  CCATCACTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCACCATGCACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCGTCACTTAGTGC  1115

Query 1182  TCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTT  1255
            .||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||.|.||.|||.|||||||.||||
Sbjct 1116  CCCAGCCCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCGTCCACTTCATCTCCTGTCCTGAGTGCTCCCCCTTACCCAGCTT  1189

Query 1256  CTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGAC  1329
            ||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1190  CTACTCCTGGGGCCTCTCCCCGCCACCGTCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGCTTGCCCGCGGGCCCAGCCGAC  1263

Query 1330  GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264  GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA  1337

Query 1404  GGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTC  1477
            ||||||.|||.||||||||||||||.||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1338  GGGCGTTCCCTTGGATACCAGTAAATTGCCTACTGACCAGCGATTGCCCCCATACCCATATAGCCCCCCAAGTC  1411

Query 1478  TGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTG  1551
            |.|||.|.||.|||||.||.|.|||||||||||||||||||||      |.|||||||||||.|.||.|.||||
Sbjct 1412  TAGTTATACCCACCCATCCACCCACCCCAAAGTCTCTACAGCA------GTTGCCCTCTCAGGCCTGCTTAGTG  1479

Query 1552  CAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCA  1625
            |||.||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1480  CAGCCCTCAGGTGGACAGCCTCCAGGCAGGCAGCCACATTATGGGGCACTGTACCCACCTGGGTCCAGTGGACA  1553

Query 1626  TGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCC  1699
            ||||||||||.||||||||||.|||||.|.||||||||.|.||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1554  TGGGCAACAGCCTTACCACCGCCCAATAAATGACTTCAGCTTGGGGAATCTGGAGCAATTCAACATGGAGAGCC  1627

Query 1700  CATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATG  1773
            |||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1628  CATCAACCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGCCTTTTCTGAAGGTCCTGGATTTTTAGGGAGTGAGGGATCAATG  1701

Query 1774  GGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAA  1847
            .|||||||||||||.||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1702  AGTGGCCCCCAGGACCCTCACGTCCTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGACCTAA  1775

Query 1848  CATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCT  1921
            .|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1776  TATCATACTCACAGGAGACTCTTCCCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCTGGAGTGCCTGGCT  1849

Query 1922  TTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG  1995
            ||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  TTGAGGTGTCAGCATCTGGGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG  1923

Query 1996  GAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGA  2069
            |||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1924  GAAGGACTAACTATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGACCCTGCTGTGGAGGACTCATTCCGTAGTGA  1997

Query 2070  CCGGCTCCAA  2079
            .|||||.||.
Sbjct 1998  TCGGCTACAG  2007