Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09804
• Subject: XM_006502153.1
• Aligned Length: 2082
• Identities: 1646
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACGTCAGGGGCGAACGGGCCGGGTTCCGCCACAGCCTCAGCGTCCAATCCACGCAAGTTTAGTGAGAA  74

Query   75  GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA  148

Query  149  CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT  222
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CACGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCTTATACAAGGAGCTCCCATTATGGTGGTTCTCTGCCCAATGTT  222

Query  223  AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  296
            |||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACCAGATTGGCTGTGGCCTGGCTGAGTTCCAGAGCCCCCTTCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  296

Query  297  GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC  370
            ||||||||||.|||||||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  297  GCACCATGGGTTGGTGGAACGGGTACAACGAGATGCCCGCAGAATGGTGTCCCCACTCCGCCGATACCCCCGCC  370

Query  371  ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC  444
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||
Sbjct  371  ACATTGACAGTTCTCCATATAGCCCTGCCTATTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTGGCTGGCGAAGGATGATGCCC  444

Query  445  TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC  518
            ||||||||..||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGGGCAACCTCCCAGCTGAGAAGGGGCAGTTGTTTAGACTGCCGTCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC  518

Query  519  TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC  592
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  519  TGCTCTTCACACAAGTGTGATGAACCCTAACCCCCAAGACACTTATCCAGGCCCCACACCTCCCAGTGTCCTGC  592

Query  593  CCA---GCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTA  663
            |||   |||||.|.||.|||.|||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  593  CCAGCCGCCGAGGAGGAGGTTTTCTGGATGGTGAGATGGATGCTAAAGTCCCTGCTATTGAGGAGAACGTGGTA  666

Query  664  GATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGA  737
            ||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  667  GATGACAAGCATCTGCTGAAACCTTGGGATGCTAAGAAGCTGTCCTCATCTTCCTCTCGACCTCGATCCTGTGA  740

Query  738  AGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA  811
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTCCCTGGAATCAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCTAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA  814

Query  812  CGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAG  885
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  815  CAGGAGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTACACTTCCCTCCTCCACTGCCCACACCCCTGGACCCTGAGGAG  888

Query  886  ACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAG  959
            ||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||..||||||||||
Sbjct  889  ACAGTCTATCCCAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCACCAATTTGACCCATACTATGACCCATTTGGGCATCAG  962

Query  960  CAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGT  1033
            ..|.||..|||||.|||||||..|||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAGGTCTGGGCTTGGGCCCCAGCTATGATGTACCAGGACTTCACTCACCTCTTAGCCACCCATCCCTGCAGT  1036

Query 1034  CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCAC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1037  CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTAAGTAGTCCTCAACCCCAGCTCCAGGGCTCCCATAGTCAC  1110

Query 1108  CCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGC  1181
            ||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  CCATCACTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCACCATGCACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCGTCACTTAGTGC  1184

Query 1182  TCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTT  1255
            .||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||.|.||.|||.|||||||.||||
Sbjct 1185  CCCAGCCCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCGTCCACTTCATCTCCTGTCCTGAGTGCTCCCCCTTACCCAGCTT  1258

Query 1256  CTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGAC  1329
            ||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTACTCCTGGGGCCTCTCCCCGCCACCGTCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGCTTGCCCGCGGGCCCAGCCGAC  1332

Query 1330  GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA  1406

Query 1404  GGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTC  1477
            |                                                                         
Sbjct 1407  G-------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1478  TGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTG  1551
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1552  CAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCA  1625
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1626  TGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCC  1699
                                                             ||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1408  -------------------------------------------------CTGGAGCAATTCAACATGGAGAGCC  1432

Query 1700  CATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATG  1773
            |||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1433  CATCAACCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGCCTTTTCTGAAGGTCCTGGATTTTTAGGGAGTGAGGGATCAATG  1506

Query 1774  GGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAA  1847
            .|||||||||||||.||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1507  AGTGGCCCCCAGGACCCTCACGTCCTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGACCTAA  1580

Query 1848  CATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCT  1921
            .|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1581  TATCATACTCACAGGAGACTCTTCCCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCTGGAGTGCCTGGCT  1654

Query 1922  TTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG  1995
            ||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655  TTGAGGTGTCAGCATCTGGGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG  1728

Query 1996  GAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGA  2069
            |||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1729  GAAGGACTAACTATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGACCCTGCTGTGGAGGACTCATTCCGTAGTGA  1802

Query 2070  CCGGCTCCAA  2079
            .|||||.||.
Sbjct 1803  TCGGCTACAG  1812