Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09833
• Subject: XM_006522240.3
• Aligned Length: 2273
• Identities: 1901
• Gaps: 112

Alignment

Query    1  ATGAAAAAACAGAGGAAAATTCTATGGAGGAAAGGAATCCACTTAGCCTTTTCTGAGAAATGGAATACTGGGTT  74
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGAAAAAACAGAAGAAAATTCTATGGAAGAAAGGAATTCACTTAGCCTTTTCTGAGAAATGGAATGCTGGGTT  74

Query   75  TGGAGGCTTTAAGAAGTTTTATTTTCACCAACACTTGTGCATTCTGAAAGCTAAGCTGGGAAGGCCAGTTACTT  148
            ||||.|||||||||||||.||.||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   75  TGGAAGCTTTAAGAAGTTCTACTTTCCCCAAAACTTGTGCTTTCTGAAAGCTAAGCTGGGAAGGCCAGTTGCTT  148

Query  149  GGAATAGACAGTTGAGACATTTCCAGGGTAGAAAGAAAGCTCTTCAAATCCAGAAAACGTGGA-TCAAGGATGA  221
            ||.||.|.|||.|||..|||||||||.||   ||.||.|.||||||.|||||||||||.|||| |||| ||||.
Sbjct  149  GGCATCGGCAGGTGAAGCATTTCCAGTGT---AATAAGGGTCTTCACATCCAGAAAACATGGATTCAA-GATGT  218

Query  222  ACACCTTTGTGCTAAGACCAAGTTCAATG---TGGCTACTCAAAATGTTAGTACTTTGTCCTCTAAAGTGAAAA  292
            ||...|||||.|.|||||.||||   .||   |||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||||
Sbjct  219  ACCGTTTTGTTCAAAGACAAAGT---CTGGACTGGCTACTCAAAATGTTAGTACTTTGTACCCCAAAGTGAAAA  289

Query  293  GAAAGGACGCTAAACACTTCATTTCCTCCTCAAAGACTCTCCTGAGACTCCAAGCAGAGAAGCTGTTGTCATCA  366
            ||||||||..|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||..|..||||.|||
Sbjct  290  GAAAGGACAGTAAGCACTTCATTTCCTCCTCAAGGAGTCTCCTGAAACTCCAAGCAGATAAATTACTGTCTTCA  363

Query  367  GCAAAGAATTCTGACCATGAATACTGCAGAGAGAAAAATCTCTTGAAGGCAGTTACTGACTTTCCATCAAATAG  440
            |||||||..|..||||||.||||||||||||||||||..||..|||||||||.|.|||.|||..||.||||.|.
Sbjct  364  GCAAAGAGCTTGGACCATAAATACTGCAGAGAGAAAAGCCTTCTGAAGGCAGCTCCTGGCTTGTCAGCAAACAC  437

Query  441  TGCTTTAGGTCAG-GCCAATGGTCACAGACCTAGGACAGACCCACAACCTTCTGACTTTCCCATGAAGTTCAAT  513
            ||.||||||| || ||||||||||||..|||||..||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct  438  TGTTTTAGGT-AGAGCCAATGGTCACGAACCTACCACAGACCCACAAGCTTCAGACTTTCCCATGAAGTTCAGT  510

Query  514  GGGGAGAGCCAAAGTCCAGGTGAGAGTGGCACGATTGTGGTCACCTTGAACAACCATAAGAGAAAGGGCTTTTG  587
            |||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||   |||||||||.|||   ||||||.|..||||
Sbjct  511  GGGGAGAGCCAAAGTCCAGGTGACAGTGGCAAGACTGTGGT---CTTGAACAAACAT---AGAAAGCGAGTTTG  578

Query  588  TTACGGCTGCTGCCAAGGGCCGGAGCACCACAGGAATGGGGGACCCTTGATTCCAAAAAAGTTCCAACTTAACC  661
            |.|.|||||||.||||||||..||||||||||||||..||.|||||.||||||||||..|||||||.|||||||
Sbjct  579  TCATGGCTGCTACCAAGGGCTAGAGCACCACAGGAACAGGAGACCCCTGATTCCAAAGCAGTTCCAGCTTAACC  652

Query  662  AACATAGAAGGATAAAATTATCTCCTCTTATGATGTATGAGAAATTATCCATGATTAGATTTCGGTACAGGATT  735
            ||||..||||..|.|   .|.|..||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  653  AACACCGAAGAGTCA---GAGCGTCTCTGATGATGTATGAGAAACTATCCATGATTAGATTTCGGTATAGGATT  723

Query  736  CTCAGATCCCAGCACTTCAGAACCAAAAGCAAGGTTTGCAAGCTAAGAAAAGCCCAGCGAAGCTGGGTACAGAA  809
            .||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  724  TTCAGATCCCAGCACTTCAGAACGAAAAGCAGAGTTTGCAAGCTAAGAAAGGCCCAGCGAAGTTGGGTACAGAA  797

Query  810  AGTCACTGGGGACCATCAAGAGACCCGTAGGG---AGAACGGTGAGGGTGGCAGTTGCAGCCCATTTCCTTCCC  880
            .||||||||||||||||||||||.||.|||||   |.|||..||||||||.||.|||||..|||.|.|||||||
Sbjct  798  GGTCACTGGGGACCATCAAGAGAACCTTAGGGATAATAACACTGAGGGTGACAATTGCAATCCAGTCCCTTCCC  871

Query  881  CAGAACCTAAAGACCCTTCTTGTCGGCATCAGCCGTACTTTCCAGATATGGACAGCAGTGCTGTGGTGAAGGGG  954
            .||||||||||||   |.||||||||..||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct  872  TAGAACCTAAAGA---TCCTTGTCGGTGTCAGCCATACTTTCCAGACATGGACAGCAGTGCTGTGGGGAAGGGA  942

Query  955  ACGAACTCTCATGTGCCTGATTGCCACACTAAAGGAAGCTCTTTCTTGGGCAAGGAGCTTAGTTTAGACGAAGC  1028
            |..||||.|||.|||||||||.|.||||||||||.||.|.||.|.||||.||||||||.|.|||||||.||..|
Sbjct  943  AAAAACTGTCACGTGCCTGATGGTCACACTAAAGAAAACCCTGTATTGGACAAGGAGCATGGTTTAGATGACAC  1016

Query 1029  ATTCCCTGACCAACAGAATGGCAGTGCCACAAACGCCTGGGACCAGTCATCCTGTTCTTCTCCTAAGTGGGAGT  1102
            ||||||||||||.|||||||||.|||...||.||...|||||||||||||||   ||||.||||||||||||.|
Sbjct 1017  ATTCCCTGACCAGCAGAATGGCTGTGTTGCATACAATTGGGACCAGTCATCC---TCTTGTCCTAAGTGGGAAT  1087

Query 1103  GTACAGAGCTGATTCATGACATCCCCTTACCAGAACATCGTTCTAATACCATGTTCATTTCAGAAACTGAAAGA  1176
            |||||||||..||||||||.|||||.|||...|||||||.|||||.|..||.||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1088  GTACAGAGCAAATTCATGAAATCCCTTTAATGGAACATCCTTCTAGTGACAAGTTCTCTCCAGAAACTGAAAGA  1161

Query 1177  GAAATTATGACTCTGGGTCAGGAAAATCAGACAAGTTCTGTCAGTGATGACAGAGTAAAACTGTCAGTGTCTGG  1250
            |.|.|||||.|.|||||||||||||....|||||||.|||||||.||||||||||..||||||.||||||||||
Sbjct 1162  GCACTTATGGCGCTGGGTCAGGAAAGCGGGACAAGTGCTGTCAGCGATGACAGAGAGAAACTGCCAGTGTCTGG  1235

Query 1251  AGCAGATACATCTGTGAGTAGCGTAGATGGGCCTGTGTCCCAAAAGGCTGTTCAAAATGAGAACTCATACCAGA  1324
            ||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||||||||..|..||.|||..||.|||||||||   |.|||||
Sbjct 1236  AGCAGACAAATCTGTGAGTAGTGTAGACGGGCCTGTGTCTGAGGAGCCTGCCCAGAATGAGAAC---TTCCAGA  1306

Query 1325  TGGAGGAGGATGGATCTCTCAAGCAGAGCATTCTTAGTTCTGAGTTGCTGGACCACCCTTACTGTAAAAGTCCA  1398
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307  TGGAGGAGGATGGGTCTCTGAAGCAGAGCATTCTTAGTTCTAAGCTGCTGGACCACCCTTACTGTAAAAGTCCA  1380

Query 1399  CTGGAGGCTCCCTTGGTGTGCAGTGGACTCAAACTAGAAAATCAAGTAGGAGGTGGAAAGAACAGTCAGAAAGC  1472
            |||||.|||||||||.|||||||||.||.||||.|||||||.|||.|...||||||.||||.|||.||||.|||
Sbjct 1381  CTGGATGCTCCCTTGCTGTGCAGTGAACCCAAAGTAGAAAACCAAATGTCAGGTGGCAAGAGCAGCCAGACAGC  1454

Query 1473  CTCTCCAGTGGATGATGAACAGCTGTCAGTCTGTCTTTCTGGATTCCTAGATGAGGTTATGAAGAAGTATGGCA  1546
            .|||||||||||||||||.|||||.|||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1455  GTCTCCAGTGGATGATGAGCAGCTCTCAACCTGCCTTTCTGGATTCCTAGATGAGGTTATGAAAAAGTATGGAA  1528

Query 1547  GTTTGGTTCCACTCAGTGAAAAAGAAGTCCTTGGAAGATTAAAAGATGTCTTTAATGAAGACTTTTCTAATAGA  1620
            ||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529  GTCTGGTCCCACTCAGTGAAAAAGATGTCCTTGGGAGATTAAAAGATGTCTTTAATGAAGACTTTTCTAATAGA  1602

Query 1621  AAACCATTTATCAATAGGGAAATAACAAACTATCGGGCCAGACATCAAAAATGTAACTTCCGTATCTTCTATAA  1694
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1603  AAACCATTCATCAATAGGGAAATAACAAACTACCGGGCCAGACATCAAAAGTGTAACTTCCGCATCTTCTACAA  1676

Query 1695  TAAACACATGCTGGATATGGACGACCTGGCGACTCTGGATGGTCAGAACTGGCTGAATGACCAGGTCATTAATA  1768
            |||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 1677  TAAGCACATGCTGGATATGGACGATCTGGCAACTTTGGATGGGCAGAACTGGTTGAATGACCAGGTTATTAATA  1750

Query 1769  TGTATGGTGAGCTGATAATGGATGCAGTCCCAGACAAAGTTCACTTCTTCAACAGCTTTTTTCATAGACAGCTG  1842
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 1751  TGTATGGCGAGCTGATAATGGATGCAGTCCCAGAC---------------------------------------  1785

Query 1843  GTAACCAAAGGATATAATGGAGTAAAAAGATGGACTAAAAAGGTGGATTTGTTTAAAAAGAGTCTTCTGTTGAT  1916
                                                   ||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786  ---------------------------------------AAGGTGGACTTGTTTAAAAAGAGTCTTCTGTTGAT  1820

Query 1917  TCCTATTCACCTGGAAGTCCACTGGTCTCTCATTACTGTGACACTCTCTAATCGAATTATTTCATTTTATGATT  1990
            |||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1821  TCCCATCCACCTGGAGGTCCACTGGTCTCTCATTACTGTGACACTCTCCAGCCGGATTATTTCATTTTATGATT  1894

Query 1991  CCCAAGGCATTCATTTTAAGTTTTGTGTAGAGAATATAAGAAAGTATTTGCTGACTGAAGCCAGAGAAAAAAAT  2064
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895  CCCAAGGCATTCATTTTAAATTCTGTGTAGAGAATATAAGAAAGTATTTGCTGACTGAAGCCAGAGAAAAAAAT  1968

Query 2065  AGACCTGAATTTCTTCAGGGTTGGCAGACTGCTGTTACGAAGTGTATTCCACAACAGAAAAACGACAGTGACTG  2138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1969  AGACCTGAATTTCTTCAGGGTTGGCAGACTGCTGTTACAAAGTGTATTCCACAACAGAAAAATGACAGTGACTG  2042

Query 2139  TGGAGTCTTTGTGCTCCAGTACTGCAAGTGCCTCGCCTTAGAGCAGCCTTTCCAGTTTTCACAAGAAGACATGC  2212
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2043  TGGAGTCTTTGTGCTCCAGTACTGCAAGTGCCTCGCCCTAGAGCAGCCTTTCCAGTTTTCTCAAGAAGACATGC  2116

Query 2213  CCCGAGTGCGGAAGAGGATTTACAAGGAGCTATGTGAGTGCCGGCTCATGGAC  2265
            |.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 2117  CTCGTGTGCGGAAGAGGATCTATAAGGAGCTGTGTGAGTGCCGGCTCCTGGAC  2169