Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09833
- Subject:
- XM_017317035.1
- Aligned Length:
- 2273
- Identities:
- 1744
- Gaps:
- 271
Alignment
Query 1 ATGAAAAAACAGAGGAAAATTCTATGGAGGAAAGGAATCCACTTAGCCTTTTCTGAGAAATGGAATACTGGGTT 74
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1 ATGAAAAAACAGAAGAAAATTCTATGGAAGAAAGGAATTCACTTAGCCTTTTCTGAGAAATGGAATGCTGGGTT 74
Query 75 TGGAGGCTTTAAGAAGTTTTATTTTCACCAACACTTGTGCATTCTGAAAGCTAAGCTGGGAAGGCCAGTTACTT 148
||||.|||||||||||||.||.||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 75 TGGAAGCTTTAAGAAGTTCTACTTTCCCCAAAACTTGTGCTTTCTGAAAGCTAAGCTGGGAAGGCCAGTTGCTT 148
Query 149 GGAATAGACAGTTGAGACATTTCCAGGGTAGAAAGAAAGCTCTTCAAATCCAGAAAACGTGGA-TCAAGGATGA 221
||.||.|.|||.|||..|||||||||.|| ||.||.|.||||||.|||||||||||.|||| |||| ||||.
Sbjct 149 GGCATCGGCAGGTGAAGCATTTCCAGTGT---AATAAGGGTCTTCACATCCAGAAAACATGGATTCAA-GATGT 218
Query 222 ACACCTTTGTGCTAAGACCAAGTTCAATG---TGGCTACTCAAAATGTTAGTACTTTGTCCTCTAAAGTGAAAA 292
||...|||||.|.|||||.|||| .|| |||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||||
Sbjct 219 ACCGTTTTGTTCAAAGACAAAGT---CTGGACTGGCTACTCAAAATGTTAGTACTTTGTACCCCAAAGTGAAAA 289
Query 293 GAAAGGACGCTAAACACTTCATTTCCTCCTCAAAGACTCTCCTGAGACTCCAAGCAGAGAAGCTGTTGTCATCA 366
||||||||..|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||..|..||||.|||
Sbjct 290 GAAAGGACAGTAAGCACTTCATTTCCTCCTCAAGGAGTCTCCTGAAACTCCAAGCAGATAAATTACTGTCTTCA 363
Query 367 GCAAAGAATTCTGACCATGAATACTGCAGAGAGAAAAATCTCTTGAAGGCAGTTACTGACTTTCCATCAAATAG 440
|||||||..|..||||||.||||||||||||||||||..||..|||||||||.|.|||.|||..||.||||.|.
Sbjct 364 GCAAAGAGCTTGGACCATAAATACTGCAGAGAGAAAAGCCTTCTGAAGGCAGCTCCTGGCTTGTCAGCAAACAC 437
Query 441 TGCTTTAGGTCAG-GCCAATGGTCACAGACCTAGGACAGACCCACAACCTTCTGACTTTCCCATGAAGTTCAAT 513
||.||||||| || ||||||||||||..|||||..||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 438 TGTTTTAGGT-AGAGCCAATGGTCACGAACCTACCACAGACCCACAAGCTTCAGACTTTCCCATGAAGTTCAGT 510
Query 514 GGGGAGAGCCAAAGTCCAGGTGAGAGTGGCACGATTGTGGTCACCTTGAACAACCATAAGAGAAAGGGCTTTTG 587
|||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||| |||||||||.||| ||||||.|..||||
Sbjct 511 GGGGAGAGCCAAAGTCCAGGTGACAGTGGCAAGACTGTGGT---CTTGAACAAACAT---AGAAAGCGAGTTTG 578
Query 588 TTACGGCTGCTGCCAAGGGCCGGAGCACCACAGGAATGGGGGACCCTTGATTCCAAAAAAGTTCCAACTTAACC 661
|.|.|||||||.||||||||..||||||||||||||..||.|||||.||||||||||..|||||||.|||||||
Sbjct 579 TCATGGCTGCTACCAAGGGCTAGAGCACCACAGGAACAGGAGACCCCTGATTCCAAAGCAGTTCCAGCTTAACC 652
Query 662 AACATAGAAGGATAAAATTATCTCCTCTTATGATGTATGAGAAATTATCCATGATTAGATTTCGGTACAGGATT 735
||||..||||..|.| .|.|..||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 653 AACACCGAAGAGTCA---GAGCGTCTCTGATGATGTATGAGAAACTATCCATGATTAGATTTCGGTATAGGATT 723
Query 736 CTCAGATCCCAGCACTTCAGAACCAAAAGCAAGGTTTGCAAGCTAAGAAAAGCCCAGCGAAGCTGGGTACAGAA 809
.||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 724 TTCAGATCCCAGCACTTCAGAACGAAAAGCAGAGTTTGCAAGCTAAGAAAGGCCCAGCGAAGTTGGGTACAGAA 797
Query 810 AGTCACTGGGGACCATCAAGAGACCCGTAGGG---AGAACGGTGAGGGTGGCAGTTGCAGCCCATTTCCTTCCC 880
.||||||||||||||||||||||.||.||||| |.|||..||||||||.||.|||||..|||.|.|||||||
Sbjct 798 GGTCACTGGGGACCATCAAGAGAACCTTAGGGATAATAACACTGAGGGTGACAATTGCAATCCAGTCCCTTCCC 871
Query 881 CAGAACCTAAAGACCCTTCTTGTCGGCATCAGCCGTACTTTCCAGATATGGACAGCAGTGCTGTGGTGAAGGGG 954
.|||||||||||| |.||||||||..||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 872 TAGAACCTAAAGA---TCCTTGTCGGTGTCAGCCATACTTTCCAGACATGGACAGCAGTGCTGTGGGGAAGGGA 942
Query 955 ACGAACTCTCATGTGCCTGATTGCCACACTAAAGGAAGCTCTTTCTTGGGCAAGGAGCTTAGTTTAGACGAAGC 1028
|..||||.|||.|||||||||.|.||||||||||.||.|.||.|.||||.||||||||.|.|||||||.||..|
Sbjct 943 AAAAACTGTCACGTGCCTGATGGTCACACTAAAGAAAACCCTGTATTGGACAAGGAGCATGGTTTAGATGACAC 1016
Query 1029 ATTCCCTGACCAACAGAATGGCAGTGCCACAAACGCCTGGGACCAGTCATCCTGTTCTTCTCCTAAGTGGGAGT 1102
||||||||||||.|||||||||.|||...||.||...||||||||||||||| ||||.||||||||||||.|
Sbjct 1017 ATTCCCTGACCAGCAGAATGGCTGTGTTGCATACAATTGGGACCAGTCATCC---TCTTGTCCTAAGTGGGAAT 1087
Query 1103 GTACAGAGCTGATTCATGACATCCCCTTACCAGAACATCGTTCTAATACCATGTTCATTTCAGAAACTGAAAGA 1176
|||||||||..||||||||.|||||.|||...|||||||.|||||.|..||.||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1088 GTACAGAGCAAATTCATGAAATCCCTTTAATGGAACATCCTTCTAGTGACAAGTTCTCTCCAGAAACTGAAAGA 1161
Query 1177 GAAATTATGACTCTGGGTCAGGAAAATCAGACAAGTTCTGTCAGTGATGACAGAGTAAAACTGTCAGTGTCTGG 1250
|.|.|||||.|.|||||||||||||....|||||||.|||||||.||||||||||..||||||.||||||||||
Sbjct 1162 GCACTTATGGCGCTGGGTCAGGAAAGCGGGACAAGTGCTGTCAGCGATGACAGAGAGAAACTGCCAGTGTCTGG 1235
Query 1251 AGCAGATACATCTGTGAGTAGCGTAGATGGGCCTGTGTCCCAAAAGGCTGTTCAAAATGAGAACTCATACCAGA 1324
||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||||||||..|..||.|||..||.||||||||| |.|||||
Sbjct 1236 AGCAGACAAATCTGTGAGTAGTGTAGACGGGCCTGTGTCTGAGGAGCCTGCCCAGAATGAGAAC---TTCCAGA 1306
Query 1325 TGGAGGAGGATGGATCTCTCAAGCAGAGCATTCTTAGTTCTGAGTTGCTGGACCACCCTTACTGTAAAAGTCCA 1398
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 TGGAGGAGGATGGGTCTCTGAAGCAGAGCATTCTTAGTTCTAAGCTGCTGGACCACCCTTACTGTAAAAGTCCA 1380
Query 1399 CTGGAGGCTCCCTTGGTGTGCAGTGGACTCAAACTAGAAAATCAAGTAGGAGGTGGAAAGAACAGTCAGAAAGC 1472
|||||.|||||||||.|||||||||.||.||||.|||||||.|||.|...||||||.||||.|||.||||.|||
Sbjct 1381 CTGGATGCTCCCTTGCTGTGCAGTGAACCCAAAGTAGAAAACCAAATGTCAGGTGGCAAGAGCAGCCAGACAGC 1454
Query 1473 CTCTCCAGTGGATGATGAACAGCTGTCAGTCTGTCTTTCTGGATTCCTAGATGAGGTTATGAAGAAGTATGGCA 1546
.|||||||||||||||||.|||||.|||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1455 GTCTCCAGTGGATGATGAGCAGCTCTCAACCTGCCTTTCTGGATTCCTAGATGAGGTTATGAAAAAGTATGGAA 1528
Query 1547 GTTTGGTTCCACTCAGTGAAAAAGAAGTCCTTGGAAGATTAAAAGATGTCTTTAATGAAGACTTTTCTAATAGA 1620
||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 GTCTGGTCCCACTCAGTGAAAAAGATGTCCTTGGGAGATTAAAAGATGTCTTTAATGAAGACTTTTCTAATAGA 1602
Query 1621 AAACCATTTATCAATAGGGAAATAACAAACTATCGGGCCAGACATCAAAAATGTAACTTCCGTATCTTCTATAA 1694
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1603 AAACCATTCATCAATAGGGAAATAACAAACTACCGGGCCAGACATCAAAAGTGTAACTTCCGCATCTTCTACAA 1676
Query 1695 TAAACACATGCTGGATATGGACGACCTGGCGACTCTGGATGGTCAGAACTGGCTGAATGACCAGGTCATTAATA 1768
|||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 1677 TAAGCACATGCTGGATATGGACGATCTGGCAACTTTGGATGGGCAGAACTGGTTGAATGACCAGGTTATTAATA 1750
Query 1769 TGTATGGTGAGCTGATAATGGATGCAGTCCCAGACAAAGTTCACTTCTTCAACAGCTTTTTTCATAGACAGCTG 1842
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1751 TGTATGGCGAGCTGATAATGGATGCAGTCCCAGACAAGGTCCACTTCTTCAACAGCTTTTTCCATAGACAGCTG 1824
Query 1843 GTAACCAAAGGATATAATGGAGTAAAAAGATGGACTAAAAAGGTGGATTTGTTTAAAAAGAGTCTTCTGTTGAT 1916
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825 GTAACCAAAGGCTATAATGGAGTTAAAAGATGGACGAAGAAGGTGGACTTGTTTAAAAAGAGTCTTCTGTTGAT 1898
Query 1917 TCCTATTCACCTGGAAGTCCACTGGTCTCTCATTACTGTGACACTCTCTAATCGAATTATTTCATTTTATGATT 1990
|||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1899 TCCCATCCACCTGGAGGTCCACTGGTCTCTCATTACTGTGACACTCTCCAGCCGGATTATTTCATTTTATGATT 1972
Query 1991 CCCAAGGCATTCATTTTAAGTTTTGTGTAGAGAATATAAGAAAGTATTTGCTGACTGAAGCCAGAGAAAAAAAT 2064
|||||||||||||||||||.||.||||||||| |.||||
Sbjct 1973 CCCAAGGCATTCATTTTAAATTCTGTGTAGAG-------GTAAGT----------------------------- 2010
Query 2065 AGACCTGAATTTCTTCAGGGTTGGCAGACTGCTGTTACGAAGTGTATTCCACAACAGAAAAACGACAGTGACTG 2138
Sbjct 2011 -------------------------------------------------------------------------- 2010
Query 2139 TGGAGTCTTTGTGCTCCAGTACTGCAAGTGCCTCGCCTTAGAGCAGCCTTTCCAGTTTTCACAAGAAGACATGC 2212
Sbjct 2011 -------------------------------------------------------------------------- 2010
Query 2213 CCCGAGTGCGGAAGAGGATTTACAAGGAGCTATGTGAGTGCCGGCTCATGGAC 2265
Sbjct 2011 ----------------------------------------------------- 2010