Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09848
• Subject: NM_001001953.1
• Aligned Length: 935
• Identities: 866
• Gaps: 4

Alignment

Query   1  ATGTCCAACGCCAGCCTACTGACAGCGTTCATCCTCATGGGCCTTCCCCATGCCCCAGCGCTGGACGCCCCCCT  74
           ||||||||..|||||||..||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct   1  ATGTCCAAGACCAGCCTCGTGACAGCGTTCATCCTCACGGGCCTTCCCCATGCCCCAGGGCTGGACGCCCCACT  74

Query  75  CTTTGGAGTCTTCCTGGTGGTTTACGTGCTCACTGTGCTGGGGAACCTCCTCATCCTGCTGGTGATCAGGGTGG  148
           |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CTTTGGAATCTTCCTGGTGGTTTACGTGCTCACTGTGCTGGGGAACCTCCTCATCCTGCTGGTGATCAGGGTGG  148

Query 149  ATTCTCACCTCCACACCACCATGTACTACTTCCTCACCAACCTGTCGTTCATTGACATGTGGTTCTCCACTGTC  222
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTCACCTCCACACCCCCATGTACTACTTCCTCACCAACCTGTCCTTCATTGACATGTGGTTCTCCACTGTC  222

Query 223  ACGGTGCCCAAATTGCTGATGACTTTGGTGTTCCCAAGTGGCAGGGCTATCTCCTTCCACAGCTGCATGGCTCA  296
           ||||||||||||.||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 223  ACGGTGCCCAAAATGCTGATGACCTTGGTGTCCCCAAGCGGCAGGGCTATCTCCTTCCACAGCTGCGTGGCTCA  296

Query 297  GCTCTATTTCTTTCACTTCCTAGGGGGCACCGAGTGTTTCCTCTACAGGGTCATGTCCTGTGATCGCTACCTGG  370
           |||||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 297  GCTCTATTTTTTCCACTTCCTGGGGAGCACCGAGTGTTTCCTCTACACAGTCATGTCCTATGATCGCTACTTGG  370

Query 371  CCATCAGTTACCCGCTCAGGTACACCAGCATGATGACTGGGCGCTCGTGTACTCTTCTGGCCACCAGCACTTGG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||...|||.|.||.||||||||||||||||||
Sbjct 371  CCATCAGTTACCCGCTCAGGTACACCAGCATGATGAGTGGGAGCAGATGTGCCCTCCTGGCCACCAGCACTTGG  444

Query 445  CTCAGTGGCTCTCTGCACTCTGCTGTCCAGGCCATATTGACTTTCCATTTGCCCTACTGTGGACCCAACTGGAT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 445  CTCAGTGGCTCTCTGCACTCTGCTGTCCAGACCATATTGACTTTCCATTTGCCCTACTGTGGACCCAACCAGAT  518

Query 519  CCAGCACTATTTGTGTGATGCACCGCCCATCCTGAAACTGGCCTGTGCAGACACCTCAGCCATAGAGACTGTCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||..||||
Sbjct 519  CCAGCACTATTTGTGTGATGCACCGCCCATCCTGAAACTGGCCTGTGCAGACACCTCAGCCAACGAGATGGTCA  592

Query 593  TTTTTGT-GACTGTTGGAATAGTGGCCTCGGGCTGCTTTGTCCTGATAGTGCTGTCCTATGTGTCCATCGTCTG  665
           |.||||| ||| .||||..||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 593  TCTTTGTGGAC-ATTGGGCTAGTGGCCTCGGGCTGCTTTCTCCTGATAGTGCTGTCTTATGTGTCCATCGTCTG  665

Query 666  TTCCATACTGCGGATCCGCACCTCAGAGGGGAAGCACAGAGCCTTTCAGACCTGTGCCTCCCACTGTATCGTGG  739
           ||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 666  TTCCATCCTGCGGATCCACACCTCAGAGGGGAGGCACAGAGCCTTTCAGACCTGTGCCTCCCACTGCATCGTGG  739

Query 740  TCCTTTGCTTCTTTG-GCCCTGGTCTTTTCATTTACCTGAGGCCAGGCTCCAGGAAAGCTGTGGATGGAGTTGT  812
           ||||||||||.|||| .|||| ||.||||||||||||||||.||||||||||||.|.|..||||||||||||||
Sbjct 740  TCCTTTGCTTTTTTGTTCCCT-GTGTTTTCATTTACCTGAGACCAGGCTCCAGGGACGTCGTGGATGGAGTTGT  812

Query 813  GGCCGTTTTCTACACTGTGCTGACGCCCCTTCTCAACCCTGTTGTGTACACCCTGAGGAACAAGGAGGTGAAGA  886
           ||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 813  GGCCATTTTCTACACTGTGCTGACACCCCTTCTCAACCCTGTTGTGTACACCCTGAGAAACAAGGAGGTGAAGA  886

Query 887  AAGCTCTGTTGAAGCTGAAAGACAAAGTAGCACATTCTCAGAGCAAA  933
           |||||.|||||||.||||.||||||||||||||||||||||.|..||
Sbjct 887  AAGCTGTGTTGAAACTGAGAGACAAAGTAGCACATTCTCAGGGAGAA  933