Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09848
Subject:
NM_001004463.1
Aligned Length:
941
Identities:
867
Gaps:
16

Alignment

Query   1  ATGTCCAACGCCAGCCTACTGACAGCGTTCATCCTCATGGGCCTTCCCCATGCCCCAGCGCTGGACGCCCCCCT  74
           |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCCAACGCCACCCTACTGACAGCGTTCATCCTCACGGGCCTTCCCCATGCCCCAGGGCTGGACGCCCCCCT  74

Query  75  CTTTGGAGTCTTCCTGGTGGTTTACGTGCTCACTGTGCTGGGGAACCTCCTCATCCTGCTGGTGATCAGGGTGG  148
           |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CTTTGGAATCTTCCTGGTGGTTTACGTGCTCACTGTGCTGGGGAACCTCCTCATCCTGCTGGTGATCAGGGTGG  148

Query 149  ATTCTCACCTCCACACCACCATGTACTACTTCCTCACCAACCTGTCGTTCATTGACATGTGGTTCTCCACTGTC  222
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTCACCTCCACACCCCCATGTACTACTTCCTCACCAACCTGTCCTTCATTGACATGTGGTTCTCCACTGTC  222

Query 223  ACGGTGCCCAAATTGCTGATGACTTTGGTGTTCCCAAGTGGCAGGGCTATCTCCTTCCACAGCTGCATGGCTCA  296
           ||||||||||||.||||||||||.|||||||.||||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 223  ACGGTGCCCAAAATGCTGATGACCTTGGTGTCCCCAAGCGGCAGGACTATCTCCTTCCACAGCTGCGTGGCTCA  296

Query 297  GCTCTATTTCTTTCACTTCCTAGGGGGCACCGAGTGTTTCCTCTACAGGGTCATGTCCTGTGATCGCTACCTGG  370
           |||||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 297  GCTCTATTTTTTCCACTTCCTGGGGAGCACCGAGTGTTTCCTCTACACAGTCATGTCCTATGATCGCTACCTGG  370

Query 371  CCATCAGTTACCCGCTCAGGTACACCAGCATGATGACTGGGCGCTCGTGTACTCTTCTGGCCACCAGCACTTGG  444
           |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||.||||||||
Sbjct 371  CCATCAGTTACCCGCTCAGGTACACCAACATGATGACTGGGCGCTCGTGTGCCCTCCTGGCCACCGGCACTTGG  444

Query 445  CTCAGTGGCTCTCTGCACTCTGCTGTCCAGGCCATATTGACTTTCCATTTGCCCTACTGTGGACCCAACTGGAT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 445  CTCAGTGGCTCTCTGCACTCTGCTGTCCAGACCATATTGACTTTCCATTTGCCCTACTGTGGACCCAACCAGAT  518

Query 519  CCAGCACTATTTGTGTGATGCACCGCCCATCCTGAAACTGGCCTGTGCAGACACCTCAGCCATAGAGACTGTCA  592
           |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||..||||
Sbjct 519  CCAGCACTACTTCTGTGACGCACCGCCCATCCTGAAACTGGCCTGTGCAGACACCTCAGCCAACGAGATGGTCA  592

Query 593  TTTTTGTGACTGTTGGAATAGTGGCCTCGGGCTGCTTTGTCCTGATAGTGCTGTCCTATGTGTCCATCGTCTGT  666
           |.|||||||.|.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TCTTTGTGAATATTGGGCTAGTGGCCTCGGGCTGCTTTGTCCTGATAGTGCTGTCCTATGTGTCCATCGTCTGT  666

Query 667  TCCATACTGCGGATCCGCACCTCAGAGGGGAAGCACAGAGCCTTTCAGACCTGTGCCTCCCACTGTATCGTGGT  740
           |||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TCCATCCTGCGGATCCGCACCTCAGAGGGGAGGCACAGAGCCTTTCAGACCTGTGCCTCCCACTGTATCGTGGT  740

Query 741  CCTTTGCTTCTTTGGCCCTGGTCTTTTCATTTACCTGAGGCCAGGCTCCAGGAAAGCTGTGGATGGAGTTGTGG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||..||.||||.|||||||
Sbjct 741  CCTTTGCTTCTTTGGCCCTGGTCTTTTCATTTACCTGAGGCCAGGCTCCAGGGACGCCTTGCATGGGGTTGTGG  814

Query 815  CCGTTTTCTACACTGTGCTGACGCCCCTTCTCAACCCTGTTGTGTACACCCTGAGGAACAAGGAGGTGAAGAAA  888
           |||||||||||||...||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 815  CCGTTTTCTACACCACGCTGACTCCTCTTTTCAACCCTGTTGTGTACACCCTGAGAAACAAGGAGGTAAAGAAA  888

Query 889  GCTCTGTTGAAGCTGAAAGACAA------AGTAGCACATT--CTCAGAGCAAA  933
           ||||||||||||||||||   ||      |||     |||  |||||.|..||
Sbjct 889  GCTCTGTTGAAGCTGAAA---AATGGGTCAGT-----ATTTGCTCAGGGTGAA  933