Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09861
• Subject: XM_006717702.3
• Aligned Length: 1755
• Identities: 1506
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGTTTTCTTGTTTCTGTTTCAGCCTTCAGGATAATTCCTTCAGCAGCACCACTGTAACAGAGTGTGACGAAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCCAGTCTCTCTACATGAAGACCAGACTGATTGCTCCAGTCTCAGAGATGAAAACAATAAAGAGAACTACCCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGCAGGGGCTCTGGTAGAAGAGCACGCGCCGCCCTCTTGGGAGCCGCAGCAGCAGAATGTAGAGGCGACCGTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGGTGGACAGCGTATTGCGACACAGCATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA  296
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------ATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA  47

Query  297  GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG  121

Query  371  CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA  195

Query  445  ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC  269

Query  519  TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG  343

Query  593  ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC  417

Query  667  AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG  491

Query  741  CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT  565

Query  815  CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC  639

Query  889  AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCGGCCTTCACATGGTGACAAGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCGGCCTTCACATGGTGACAAGAC  713

Query  963  TTCTAATCCTGAAGTCCTGAAATGGATGAATGATTTGGCTAAAGGTCGTAAACAGCTCAAAGAACTAAAGCTAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  TTCTAATCCTGAAGTCCTGAAATGGATGAATGATTTGGCTAAAGGTCGTAAACAGCTCAAAGAACTAAAGCTAA  787

Query 1037  AGCTGTCAGAAGAACAAGGGAGTGCTCCCAAAGGTCCACCTAGAAACCTGTTGTGTGAGCAACCCACAGTCCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  AGCTGTCAGAAGAACAAGGGAGTGCTCCCAAAGGTCCACCTAGAAACCTGTTGTGTGAGCAACCCACAGTCCCC  861

Query 1111  AGAGAAAATGGGAAACCGGAAGCTGCGGGCCCGGAGCCAAGCTCCTCTGGAGAAGAGACTCCAGATGCTGCCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  AGAGAAAATGGGAAACCGGAAGCTGCGGGCCCGGAGCCAAGCTCCTCTGGAGAAGAGACTCCAGATGCTGCCTT  935

Query 1185  GACATGCCTGAAGGAGAGAAGAGAGCAACTTCCTCCCCAGGAGGATTCTAAGGTAACTAAGCAAGACAAGAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  GACATGCCTGAAGGAGAGAAGAGAGCAACTTCCTCCCCAGGAGGATTCTAAGGTAACTAAGCAAGACAAGAACC  1009

Query 1259  TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT  1083

Query 1333  CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA  1157

Query 1407  CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA  1231

Query 1481  AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC  1305

Query 1555  CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC  1379

Query 1629  AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA  1453

Query 1703  AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT  1755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT  1506