Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09862
• Subject: NM_027920.5
• Aligned Length: 876
• Identities: 770
• Gaps: 21

Alignment

Query   1  ATGAGCATGCCACTGCATCAGATCTCTGCCATTCCATCCCAGGATGCCATCTCTGCTAGAGTCTACAGAAGTAA  74
           ||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct   1  ATGAGCATGCCATTGCACCAGATCTCTGCCATCCCTTCTCAGGATGCCATTTCTGCTAGAGTCTACAGAAGCAA  74

Query  75  GACCAAAGAAAAGGAGAGGGAAGAACAGAATGAGAAGACTTTGGGACATTTCATGAGTCATTCAAGCAACATTT  148
           |||||||||.||||||         |||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct  75  GACCAAAGATAAGGAG---------CAGAATGAGAAGACTTTGGGACATTCCATGAGTCATCCAAGCAACATTT  139

Query 149  CTAAGGCTGGG---AGTCCTCCGTCAGCATCAGCTCCGGCTCCGGTGTCCTCCTTCTCTCGCACTTCTATCACG  219
           |||||||||||   |||||||      ||||..|..|||||||.|||||..|||||||||||||||||.||||.
Sbjct 140  CTAAGGCTGGGAGTAGTCCTC------CATCCACGACGGCTCCAGTGTCTGCCTTCTCTCGCACTTCTGTCACA  207

Query 220  CCATCCAGCCAGGACATCTGCAGGATCTGCCACTGTGAAGGAGATGATGAGAGCCCCCTGATCACCCCCTGCCA  293
           |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 208  CCATCCAACCAGGACATCTGCAGGATCTGCCACTGTGAAGGGGATGACGAGAGCCCTCTGATCACCCCCTGTCA  281

Query 294  CTGCACAGGAAGCCTCCACTTCGTGCACCAGGCCTGCCTGCAGCAGTGGATCAAGAGCTCCGACACGCGCTGCT  367
           |||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 282  CTGCACAGGGAGCCTCCATTTCGTGCATCAGGCTTGCCTGCAGCAGTGGATCAAGAGTTCTGACACACGCTGCT  355

Query 368  GCGAGCTCTGCAAGTATGAGTTCATCATGGAGACCAAGCTGAAGCCACTGAGAAAATGGGAGAAGTTGCAGATG  441
           |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 356  GTGAACTCTGCAAGTACGAGTTCATCATGGAGACCAAGCTGAAACCTTTGAGGAAATGGGAGAAGTTGCAGATG  429

Query 442  ACGTCCAGCGAGCGCAGGAAGATCATGTGCTCAGTGACATTCCACGTCATTGCCATCACATGTGTGGTCTGGTC  515
           ||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 430  ACTGCCAGTGAGCGCAGGAAGATCATGTGCTCAGTGACCTTCCATGTCATTGCTATCACCTGTGTGGTCTGGTC  503

Query 516  CTTGTATGTGCTCATTGACCGTACTGCTGAGGAGATCAAGCAGGGGCAGGCAACAGGAATCCTAGAATGGCCCT  589
           |||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 504  CTTGTATGTGCTCATTGACCGCACAGCAGAGGAAATCAAGCAGGGTCAGGTAACAGGAATCCTAGAGTGGCCTT  577

Query 590  TTTGGACTAAATTGGTGGTTGTGGCCATCGGCTTCACCGGAGGACTTCTTTTTATGTATGTTCAGTGTAAAGTG  663
           |.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 578  TCTGGACGAAGCTGGTAGTTGTGGCCATCGGCTTCACTGGAGGACTTCTCTTTATGTATGTTCAGTGCAAGGTG  651

Query 664  TATGTGCAATTGTGGAAGAGACTCAAGGCCTATAATAGAGTGATCTATGTTCAAAACTGTCCAGAAACAAGCAA  737
           ||..|.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 652  TACCTACAGTTATGGAAAAGACTCAAGGCTTACAATAGAGTGATCTATGTTCAGAACTGTCCAGAAACAAGTAA  725

Query 738  AAAGAATATTTTTGAAAAATCTCCACTAACAGAGCCCAACTTTGAAAATAAACATGGACATGGAATCTGTCATT  811
           ||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||.|.|||||||||||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 726  AAAGAATATTTTTGAAAAGTCTGCACTTACAGAGCCCACCCTTGAAAATAAAGAAGGACATGGAATGTGTCATT  799

Query 812  CCGACACAAACTCTTCTTGTTGCACAGAGCCTGAAGACACTGGAGCAGAAATCATTCACGTC  873
           ||..||||||   |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 800  CCACCACAAA---TTCTTCTTGCACAGAGCCTGAAGACACTGGAGCAGAAATTATTAACGTC  858