Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09862
• Subject: XM_006506648.3
• Aligned Length: 883
• Identities: 704
• Gaps: 98

Alignment

Query   1  ATGAGCATGCCACTGCATCAGATCTCTGCCATTCCATCCCAGGATGCCATCTCTGCTAGAGTCTACAGAAGTAA  74
                                                      ||| |||..|||.|                 
Sbjct   1  -------------------------------------------ATG-CATTCCTGTT-----------------  13

Query  75  GACCAAAGAAAAGGAGAGGGAAGA-------ACAGAATGAGAAGACTTTGGGACATTTCATGAGTCATTCAAGC  141
                             ||||||       .|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  14  ------------------GGAAGATGAAGCTTCAGAATGAGAAGACTTTGGGACATTCCATGAGTCATCCAAGC  69

Query 142  AACATTTCTAAGGCTGGG---AGTCCTCCGTCAGCATCAGCTCCGGCTCCGGTGTCCTCCTTCTCTCGCACTTC  212
           ||||||||||||||||||   |||||||      ||||..|..|||||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct  70  AACATTTCTAAGGCTGGGAGTAGTCCTC------CATCCACGACGGCTCCAGTGTCTGCCTTCTCTCGCACTTC  137

Query 213  TATCACGCCATCCAGCCAGGACATCTGCAGGATCTGCCACTGTGAAGGAGATGATGAGAGCCCCCTGATCACCC  286
           |.||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 138  TGTCACACCATCCAACCAGGACATCTGCAGGATCTGCCACTGTGAAGGGGATGACGAGAGCCCTCTGATCACCC  211

Query 287  CCTGCCACTGCACAGGAAGCCTCCACTTCGTGCACCAGGCCTGCCTGCAGCAGTGGATCAAGAGCTCCGACACG  360
           ||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 212  CCTGTCACTGCACAGGGAGCCTCCATTTCGTGCATCAGGCTTGCCTGCAGCAGTGGATCAAGAGTTCTGACACA  285

Query 361  CGCTGCTGCGAGCTCTGCAAGTATGAGTTCATCATGGAGACCAAGCTGAAGCCACTGAGAAAATGGGAGAAGTT  434
           ||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..||||.||||||||||||||
Sbjct 286  CGCTGCTGTGAACTCTGCAAGTACGAGTTCATCATGGAGACCAAGCTGAAACCTTTGAGGAAATGGGAGAAGTT  359

Query 435  GCAGATGACGTCCAGCGAGCGCAGGAAGATCATGTGCTCAGTGACATTCCACGTCATTGCCATCACATGTGTGG  508
           |||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 360  GCAGATGACTGCCAGTGAGCGCAGGAAGATCATGTGCTCAGTGACCTTCCATGTCATTGCTATCACCTGTGTGG  433

Query 509  TCTGGTCCTTGTATGTGCTCATTGACCGTACTGCTGAGGAGATCAAGCAGGGGCAGGCAACAGGAATCCTAGAA  582
           ||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.
Sbjct 434  TCTGGTCCTTGTATGTGCTCATTGACCGCACAGCAGAGGAAATCAAGCAGGGTCAGGTAACAGGAATCCTAGAG  507

Query 583  TGGCCCTTTTGGACTAAATTGGTGGTTGTGGCCATCGGCTTCACCGGAGGACTTCTTTTTATGTATGTTCAGTG  656
           |||||.||.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 508  TGGCCTTTCTGGACGAAGCTGGTAGTTGTGGCCATCGGCTTCACTGGAGGACTTCTCTTTATGTATGTTCAGTG  581

Query 657  TAAAGTGTATGTGCAATTGTGGAAGAGACTCAAGGCCTATAATAGAGTGATCTATGTTCAAAACTGTCCAGAAA  730
           .||.|||||..|.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 582  CAAGGTGTACCTACAGTTATGGAAAAGACTCAAGGCTTACAATAGAGTGATCTATGTTCAGAACTGTCCAGAAA  655

Query 731  CAAGCAAAAAGAATATTTTTGAAAAATCTCCACTAACAGAGCCCAACTTTGAAAATAAACATGGACATGGAATC  804
           ||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||.|.|||||||||||.|.|||||||||||.
Sbjct 656  CAAGTAAAAAGAATATTTTTGAAAAGTCTGCACTTACAGAGCCCACCCTTGAAAATAAAGAAGGACATGGAATG  729

Query 805  TGTCATTCCGACACAAACTCTTCTTGTTGCACAGAGCCTGAAGACACTGGAGCAGAAATCATTCACGTC  873
           |||||||||..||||||   |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 730  TGTCATTCCACCACAAA---TTCTTCTTGCACAGAGCCTGAAGACACTGGAGCAGAAATTATTAACGTC  795