Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09862
• Subject: XM_017321749.1
• Aligned Length: 876
• Identities: 662
• Gaps: 138

Alignment

Query   1  ATGAGCATGCCACTGCATCAGATCTCTGCCATTCCATCCCAGGATGCCATCTCTGCTAGAGTCTACAGAAGTAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GACCAAAGAAAAGGAGAGGGAAGAACAGAATGAGAAGACTTTGGGACATTTCATGAGTCATTCAAGCAACATTT  148
                                                               |||||||||.||||||||||||
Sbjct   1  ----------------------------------------------------ATGAGTCATCCAAGCAACATTT  22

Query 149  CTAAGGCTGGG---AGTCCTCCGTCAGCATCAGCTCCGGCTCCGGTGTCCTCCTTCTCTCGCACTTCTATCACG  219
           |||||||||||   |||||||      ||||..|..|||||||.|||||..|||||||||||||||||.||||.
Sbjct  23  CTAAGGCTGGGAGTAGTCCTC------CATCCACGACGGCTCCAGTGTCTGCCTTCTCTCGCACTTCTGTCACA  90

Query 220  CCATCCAGCCAGGACATCTGCAGGATCTGCCACTGTGAAGGAGATGATGAGAGCCCCCTGATCACCCCCTGCCA  293
           |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  91  CCATCCAACCAGGACATCTGCAGGATCTGCCACTGTGAAGGGGATGACGAGAGCCCTCTGATCACCCCCTGTCA  164

Query 294  CTGCACAGGAAGCCTCCACTTCGTGCACCAGGCCTGCCTGCAGCAGTGGATCAAGAGCTCCGACACGCGCTGCT  367
           |||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 165  CTGCACAGGGAGCCTCCATTTCGTGCATCAGGCTTGCCTGCAGCAGTGGATCAAGAGTTCTGACACACGCTGCT  238

Query 368  GCGAGCTCTGCAAGTATGAGTTCATCATGGAGACCAAGCTGAAGCCACTGAGAAAATGGGAGAAGTTGCAGATG  441
           |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 239  GTGAACTCTGCAAGTACGAGTTCATCATGGAGACCAAGCTGAAACCTTTGAGGAAATGGGAGAAGTTGCAGATG  312

Query 442  ACGTCCAGCGAGCGCAGGAAGATCATGTGCTCAGTGACATTCCACGTCATTGCCATCACATGTGTGGTCTGGTC  515
           ||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 313  ACTGCCAGTGAGCGCAGGAAGATCATGTGCTCAGTGACCTTCCATGTCATTGCTATCACCTGTGTGGTCTGGTC  386

Query 516  CTTGTATGTGCTCATTGACCGTACTGCTGAGGAGATCAAGCAGGGGCAGGCAACAGGAATCCTAGAATGGCCCT  589
           |||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 387  CTTGTATGTGCTCATTGACCGCACAGCAGAGGAAATCAAGCAGGGTCAGGTAACAGGAATCCTAGAGTGGCCTT  460

Query 590  TTTGGACTAAATTGGTGGTTGTGGCCATCGGCTTCACCGGAGGACTTCTTTTTATGTATGTTCAGTGTAAAGTG  663
           |.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 461  TCTGGACGAAGCTGGTAGTTGTGGCCATCGGCTTCACTGGAGGACTTCTCTTTATGTATGTTCAGTGCAAGGTG  534

Query 664  TATGTGCAATTGTGGAAGAGACTCAAGGCCTATAATAGAGTGATCTATGTTCAAAACTGTCCAGAAACAAGCAA  737
           ||..|.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 535  TACCTACAGTTATGGAAAAGACTCAAGGCTTACAATAGAGTGATCTATGTTCAGAACTGTCCAGAAACAAGTAA  608

Query 738  AAAGAATATTTTTGAAAAATCTCCACTAACAGAGCCCAACTTTGAAAATAAACATGGACATGGAATCTGTCATT  811
           ||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||.|.|||||||||||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 609  AAAGAATATTTTTGAAAAGTCTGCACTTACAGAGCCCACCCTTGAAAATAAAGAAGGACATGGAATGTGTCATT  682

Query 812  CCGACACAAACTCTTCTTGTTGCACAGAGCCTGAAGACACTGGAGCAGAAATCATTCACGTC  873
           ||..||||||   |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 683  CCACCACAAA---TTCTTCTTGCACAGAGCCTGAAGACACTGGAGCAGAAATTATTAACGTC  741