Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09944
• Subject: NM_001346785.1
• Aligned Length: 1321
• Identities: 1113
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGCGGCGCTACCTGCGCGTCGTGGTGCTGTGTGTGGCCTGCGGCTTCTGCTCGCTCCTTTACGCTTTCAGCCA  74
            |||||||||||||||||.|||||.|.||||||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCGGCGCTACCTGCGGGTCGTAGGGCTGTGCCTGGCCTGCGGCTTCTGCTCGCTGCTGTACGCCTTCAGCCA  74

Query   75  GCTCGCCGTGTCCCTGGAAGAAGGAACGGGC-GGCGGTGGCGGGAAGCCGCAGGCCGCGGTGGCTTCCTGGCTC  147
            ||||||.||||||.||||.||||||    || |.|||.|||.|.|.|||||||||||||||.|.|||||||||.
Sbjct   75  GCTCGCGGTGTCCTTGGAGGAAGGA----GCTGCCGGGGGCCGCAGGCCGCAGGCCGCGGTAGTTTCCTGGCTG  144

Query  148  GCGGGCGGCGGACGCGGCGCCGTGAGAGGCGCCGGCGTCGCGGGCCCCGCAGCGCATCCCGGCGTGTCGGACAG  221
            ||||.|||.|||||||||.|.|.|||||||||.|||..|||||||            ||.|||..|.|||.|||
Sbjct  145  GCGGACGGTGGACGCGGCACGGGGAGAGGCGCGGGCAGCGCGGGC------------CCGGGCCGGACGGGCAG  206

Query  222  GTGTAAAGATTTCTCTCTGTGTTACTGGAATCCCTATTGGATGCTGCCCTCTGATGTTTGTGGAATGAACTGCT  295
            |||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  GTGTAAAGAGTTCTCTCTGAGTTACTGGAATCCCTATTGGATGCTGCCCTCTGATGTTTGTGGAATGAACTGCT  280

Query  296  TTTGGGAAGCGGCTTTTAGGTACAGTCTGAAAATACAGCCTGTTGAGAAAATGCATCTAGCTGTAGTTGCCTGT  369
            ||||||||||||||||||||||...|.||||||.|..|||.|.||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  281  TTTGGGAAGCGGCTTTTAGGTATGATATGAAAACAAGGCCCGATGAGAAAATGCACCTTGCTGTTGTTGCCTGT  354

Query  370  GGTGAAAGACTGGAAGAAACTATGACCATGTTGAAGTCAGCTATCATTTTCAGCATCAAACCTCTTCAATTCCA  443
            |||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||.||.||..||||
Sbjct  355  GGTGAGAGACTGGAAGAAACTGTGACTATGTTGAAGTCAGCTCTGATTTTCAGCATCAAGCCACTGCACGTCCA  428

Query  444  TATTTTTGCTGAAGATCAGCTACATCATAGCTTTAAAGGCAGACTTGACAACTGGTCATTTCTACAAACATTTA  517
            .||.|||||||||||.||.||.||..||||||||||||.||||||||.||.||||||.||.||.|..|.||||.
Sbjct  429  CATCTTTGCTGAAGACCAACTGCACGATAGCTTTAAAGACAGACTTGCCAGCTGGTCCTTCCTGCGGAGATTTG  502

Query  518  ATTATACGTTATACCCCATAACCTTTCCAAGTGAGAATGCAGCAGAGTGGAAAAAACTCTTTAAACCATGTGCT  591
            |.||.|...|.|||||.||.|||||.|||.||||.|..||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  503  ACTACAGCCTGTACCCTATCACCTTCCCAGGTGACAGCGCCGCGGACTGGAAGAAGCTCTTTAAGCCCTGTGCG  576

Query  592  TCGCAGAGATTGTTCTTGCCGTTAATCCTGAAAGAAGTTAACTCACTATTGTATGTCGACACTGATATCCTTTT  665
            ||.|||||..||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  577  TCCCAGAGGCTGTTCTTGCCATTAATACTGAAAGAAGTTGACTCACTGTTGTATGTGGACACTGATATCCTTTT  650

Query  666  TTTACGACCAGTTGATGATATTTGGTCTTTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCAATGGCACCAG  739
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  651  TTTACGACCTGTTGATGATATTTGGTCATTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCGATGGCACCAG  724

Query  740  AACATGAGGAACCTCGAATAGGATGGTATAATCGCTTTGCTAGGCATCCATATTATGGAAAAACTGGAGTAAAC  813
            ||||.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||..||||.||.||.|||||.|..||.||.||.|||
Sbjct  725  AACACGAGGAGCCCAGAATTGGATGGTATAATCGCTTTGCCCGGCACCCGTACTATGGGAGGACGGGCGTGAAC  798

Query  814  TCTGGAGTTATGTTGATGAACATGACTCGAATGAGAAGGAAGTATTTCAAGAATGATATGACAACTGTACGACT  887
            ||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..||.||
Sbjct  799  TCTGGAGTGATGCTGATGAACATGACCCGGATGAGGAGGAAGTACTTCAAGAATGATATGACAACTGCGCGGCT  872

Query  888  ACAATGGGGAGATATACTTATGCCATTGCTTAAAAAATACAAACTAAACATCACATGGGGTGATCAAGATCTAT  961
            |||||||||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct  873  ACAATGGGGGGACATACTTATGCCACTGCTTAAAAAGTACAAACTGAACATCACGTGGGGCGATCAGGATCTGT  946

Query  962  TGAATATCGTGTTTTTTCATAATCCAGAAAGCCTTTTTGTTTTTCCGTGTCAATGGAATTATCGACCAGATCAT  1035
            |.|||||||||||||..||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  947  TAAATATCGTGTTTTCCCACAATCCAGAAAGCCTCTTTGTTTTTCCATGTCAATGGAATTACCGACCAGATCAC  1020

Query 1036  TGTATATATGGAAGCAATTGCCAAGAAGCAGAAGAAGGAGGAATCTTTATTCTTCATGGGAACAGAGGTGTTTA  1109
            |||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1021  TGTATATATGGGAGCAACTGCCGAGAAGCAGAAGAAGAAGGAGTCTTCATTCTTCATGGAAACAGAGGTGTTTA  1094

Query 1110  CCATGACGATAAGCAACCAGCATTTAGAGCTGTTTATGAAGCACTGAGAAATTGTTCTTTTGAAGATGACAACA  1183
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||...|.
Sbjct 1095  CCATGACGACAAGCAGCCAGCATTCAGAGCTGTGTATGAAGCACTAAGAAATTGCTCTCTTGAGGATGATTCCG  1168

Query 1184  TCCGTTCCTTATTAAAACCTTTAGAACTGGAACTACAAAAAACAGTGCATACATACTGTGGAAAAATTTACAAA  1257
            |||||||||||.|||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||..||||||
Sbjct 1169  TCCGTTCCTTACTAAAACCTTTAGAGCTGGAGCTGCAGAAGACAGTTCACACATACTGTGGAAAAACGTACAAA  1242

Query 1258  ATATTTATCAAACAACTAGCAAAAAGTGTAAGAGATCGTTATGCCAGATCACCAAAGGAAAAG  1320
            |||||||||||.||..|..|||||||..|||||.|.|||||||.||...||||.|||||||.|
Sbjct 1243  ATATTTATCAAGCAGTTGACAAAAAGCATAAGAAACCGTTATGACACGCCACCGAAGGAAAGG  1305