Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09987
• Subject: NM_173676.2
• Aligned Length: 1338
• Identities: 1308
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGTGCAGATGATGAGGCAGTTTCTGTACCGGGTCCTGCCCGAGGACTCCTACAAGGTCACCACGGGGAAGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCAGATGATGAGGCAGTTTCTGTACCGGGTCCTGCCCGAGGACTCCTACAAGGTCACCACGGGGAAGCT  74

Query   75  CCATGTGAGCCTCACCCGCTTAACGGACGGGGAGAATGTGGTGGTTTCAGAGTTCACGTCCAAGGAGGAGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCATGTGAGCCTCACCCGCTTAACGGACGGGGAGAATGTGGTGGTTTCAGAGTTCACGTCCAAGGAGGAGCTCA  148

Query  149  TTGAGGCCCTATACTGCAGCTGCTTCGTCCCGGTGTACTGTGGCCTCATCCCCCCGACTTACCGCGGTGTGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  149  TTGAGGCCCTATACTGCAGCTGCTTCGTCCCGGTGTACTGTGGCCTCATCCCCCCGACTTACCGCGGTGT----  218

Query  223  GCATTTCTCACTCTGCCCCCACAGAGGTACATCGATGGGGGCTTCACGGGCATGCAGCCCTGTGCCTTCTGGAC  296
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  -----------------------GAGGTACATCGATGGGGGCTTCACGGGCATGCAGCCCTGTGCCTTCTGGAC  269

Query  297  CGACGCCATCACCATCTCCACCTTCAGTGGGCAGCAGGACATCTGTCCCCGGGACTGCCCGGCCATCTTCCACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  CGACGCCATCACCATCTCCACCTTCAGTGGGCAGCAGGACATCTGTCCCCGGGACTGCCCGGCCATCTTCCACG  343

Query  371  ACTTCCGCATGTTCAACTGCTCCTTCCAGTTCTCCCTGGAGAACATCGCCAGGATGACCCACGCATTGTTCCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  ACTTCCGCATGTTCAACTGCTCCTTCCAGTTCTCCCTGGAGAACATCGCCAGGATGACCCACGCATTGTTCCCC  417

Query  445  CCGGACCTGGTGATCCTGCACGATTACTACTACCGAGGGTACGAGGATGCAGTTTTGTACTTGAGGCGGCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  CCGGACCTGGTGATCCTGCACGATTACTACTACCGAGGGTACGAGGATGCAGTTTTGTACTTGAGGCGGCTGAA  491

Query  519  TGCTGTTTATCTTAATTCTTCCTCCAAGAGAGTGATTTTCCCCCGGGTGGAAGTGTACTGCCAGATAGAACTCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  TGCTGTTTATCTTAATTCTTCCTCCAAGAGAGTGATTTTCCCCCGGGTGGAAGTGTACTGCCAGATAGAACTCG  565

Query  593  CCCTTGGCAATGAGTGCCCTGAACGCAGTCAACCAAGCCTTCGAGCACGGCAGGCCAGTCTGGAAGGAGCCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  CCCTTGGCAATGAGTGCCCTGAACGCAGTCAACCAAGCCTTCGAGCACGGCAGGCCAGTCTGGAAGGAGCCACA  639

Query  667  CAACCTCACAAGGAGTGGGTTCCCAAAGGGGATGGAAGGGGCAGCCATGGTCCGCCTGTGTCCCAACCTGTGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  CAACCTCACAAGGAGTGGGTTCCCAAAGGGGATGGAAGGGGCAGCCATGGTCCGCCTGTGTCCCAACCTGTGCA  713

Query  741  GACACTTGAATTCACATGCGAGTCACCTGTTTCAGCACCAGTCTCTCCACTTGAGCAGCCACCTGCACAGCCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  GACACTTGAATTCACATGCGAGTCACCTGTTTCAGCACCAGTCTCTCCACTTGAGCAGCCACCTGCACAGCCAC  787

Query  815  TGGCCTCTTCAACTCCACTTTCTCTAAGTGGCATGCCACCTGTATCATTCCCAGCTGTGCACAAGCCACCCAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  TGGCCTCTTCAACTCCACTTTCTCTAAGTGGCATGCCACCTGTATCATTCCCAGCTGTGCACAAGCCACCCAGC  861

Query  889  TCCACACCTGGTTCATCACTGCCCACCCCACCACCTGGACTGTCACCTCTGTCACCTCAGCAGCAGGTACAACC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  TCCACACCTGGTTCATCACTGCCCACCCCACCACCTGGACTGTCACCTCTGTCACCTCAGCAGCAGGTACAACC  935

Query  963  GTCTGGATCACCAGCCAGATCCCTACACTCTCAGGCACCCACTTCACACAGGCCATCCCTGGGGCCTTCAACTG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  GTCTGGATCACCAGCCAGATCCCTACACTCTCAGGCACCCACTTCACCCAGGCCATCCCTGGGGCCTTCAACTG  1009

Query 1037  TGGGGGCACCTCAAACACTGCCCCGAAGTTCTCTTTCAGCCTTCCCTGCTCAGCCACCTGTGGAGGAACTAGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  TGGGGGCACCTCAAACACTGCCCCGAAGTTCTCTTTCAGCCTTCCCTGCTCAGCCACCTGTGGAGGAACTAGGC  1083

Query 1111  CAAGAACAGCCCCAAGCTGTAGCTCTTCTTGTCTCTTCAAAACCAAAAAGCGCCGTGCCTCTGGTTCATGTGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  CAAGAACAGCCCCAAGCTGTAGCTCTTCTTGTCTCTTCAAAACCAAAAAGCGCCGTGCCTCTGGTTCATGTGAA  1157

Query 1185  GGAAACCGTCAGCAAGCCTTATGTAATGGAGAGCCCTGCTGAAGACTCAAACTGGGTGAATAAGGTCTTCAAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  GGAAACCGTCAGCAAGCCTTATGTAACGGAGAGCCCTGCTGAAGACTCAAACTGGGTGAATAAGGTCTTCAAGA  1231

Query 1259  AGAACAAGCAAAAGACAAGTGGCACCAGAAAAGGCTTCCCAAGACATCCGGGATCCAAAAAACCAAGCAGCAAA  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  AGAACAAGCAAAAGACAAGTGGCACCAGAAAAGGCTTCCCAAGACATTCGGGATCCAAAAAACCAAGCAGCAAA  1305

Query 1333  GTGCAG  1338
            ||||||
Sbjct 1306  GTGCAG  1311